EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0020247 (Gene tree)
Gene ID: 110334851
Gene Symbol: Arf3
Alias: 5430400P17Rik
Full Name: ADP ribosylation factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21907 bases
Position: chr17:63321634-63343540
Accession: 110334851
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0043060	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0043062	-	512	-	MGP_PahariEiJ_P0043062	49 (aa)	-	UPI0000DBED11
MGP_PahariEiJ_T0043059	-	5506	-	MGP_PahariEiJ_P0043059	164 (aa)	-	UPI0006387B0E
MGP_PahariEiJ_T0043061	-	399	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0043060	-	3408	XM_021216834	MGP_PahariEiJ_P0043060	181 (aa)	XP_021072493	UPI00000012C8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	58.537	MGP_PahariEiJ_G0031373	Arl1	100	56.906
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	30.270	MGP_PahariEiJ_G0027868	Arl8a	99	30.270
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	44.848	MGP_PahariEiJ_G0026509	Arl14	88	44.379
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	66	36.364	MGP_PahariEiJ_G0019602	Arl10	55	35.088
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	96	33.333	MGP_PahariEiJ_G0026253	Arfrp1	93	37.931
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	30.909	MGP_PahariEiJ_G0022456	Arl8b	94	31.609
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	46.951	MGP_PahariEiJ_G0014529	Arl3	91	46.988
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	98	49.718	MGP_PahariEiJ_G0024654	Arl5b	98	49.718
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	96	46.203	MGP_PahariEiJ_G0018200	Arl5c	98	44.318
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	46.626	MGP_PahariEiJ_G0014091	Arl2	90	46.386
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	45.029	MGP_PahariEiJ_G0018357	Arl4d	86	44.509
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	44.643	MGP_PahariEiJ_G0029472	Arl4a	95	42.632
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	MGP_PahariEiJ_G0017561	Arf1	100	96.133
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	40.476	MGP_PahariEiJ_G0016558	Arl6	96	41.341
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	83.436	MGP_PahariEiJ_G0021914	Arf5	100	78.889
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	43.558	MGP_PahariEiJ_G0030400	Arl11	95	43.713
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	95	49.383	MGP_PahariEiJ_G0027638	Arl4c	91	46.857
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.951	MGP_PahariEiJ_G0018418	Arf2	100	94.475
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	98	51.250	MGP_PahariEiJ_G0025008	Arl5a	99	48.876

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSG00000143761	ARF1	100	96.133	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSG00000134287	ARF3	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSAPOG00000021053	-	100	93.370	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	90.798	ENSAPOG00000014968	-	100	88.333	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAPOG00000014921	-	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	97	100.000	ENSAPOG00000015419	arf3b	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	94.512	ENSAPOG00000023828	arf2a	100	91.713	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSAMEG00000004184	-	100	93.923	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSAMEG00000016301	ARF1	100	96.133	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAMEG00000007042	-	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	92.025	ENSACIG00000019050	-	100	88.889	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSACIG00000012912	arf2b	82	93.370	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSACIG00000022896	arf3b	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSACIG00000016782	-	100	100.000	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSAOCG00000001809	arf2b	100	92.818	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	100.000	ENSAOCG00000007571	arf3b	97	100.000	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAOCG00000013349	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAPEG00000002821	-	100	100.000	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAPEG00000016302	arf3b	100	100.000	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSAPEG00000003390	arf2b	100	92.818	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSATEG00000009653	arf2b	100	93.370	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	93.827	ENSATEG00000005611	-	99	90.503	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSATEG00000001951	arf3b	100	100.000	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSATEG00000022222	-	100	100.000	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSACAG00000008240	-	100	100.000	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSACAG00000006923	ARF1	100	96.133	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSANAG00000025111	-	100	100.000	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	94	89.610	ENSANAG00000023642	-	85	89.116	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSANAG00000036021	-	84	96.133	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	94	85.065	ENSANAG00000021775	-	77	82.456	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSACLG00000006072	-	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSACLG00000022124	arf2b	100	93.370	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	94.444	ENSACLG00000017387	-	99	91.061	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSACLG00000024971	arf3b	100	100.000	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSAMXG00000035742	arf2a	100	95.028	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.951	ENSAMXG00000037485	arf2b	100	95.028	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSAMXG00000016434	arf3a	79	100.000	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSBTAG00000051755	ARF3	100	100.000	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSBTAG00000007725	ARF1	100	96.133	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.951	ENSBTAG00000006785	ARF2	100	94.475	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	95.706	WBGene00000182	arf-1.2	100	92.265	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCJAG00000020800	-	100	100.000	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	91	92.667	ENSCJAG00000041786	-	95	91.018	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSCAFG00000029422	-	100	93.923	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSCAFG00020026857	-	100	93.923	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCAFG00020005724	ARF1	100	96.133	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCAFG00020013389	-	100	100.000	Canis_lupus_dingo
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCHIG00000010924	ARF1	100	96.133	Capra_hircus
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSTSYG00000027538	ARF1	100	96.133	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCAPG00000002502	ARF1	100	96.133	Cavia_aperea
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCPOG00000039117	ARF1	100	96.133	Cavia_porcellus
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCCAG00000037739	-	100	100.000	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCCAG00000025067	-	83	96.133	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCATG00000033929	-	100	100.000	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCATG00000034162	-	100	96.133	Cercocebus_atys
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCLAG00000000520	ARF1	100	96.133	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCSAG00000016460	ARF1	100	96.133	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCSAG00000006224	-	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCPBG00000019994	-	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCPBG00000001732	ARF1	100	96.133	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSCPBG00000018544	-	100	93.370	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	86.585	ENSCING00000021790	-	99	82.873	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	81.212	ENSCING00000020806	-	99	78.571	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	98	78.750	ENSCSAVG00000000059	-	100	75.706	Ciona_savignyi
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MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCANG00000031504	-	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCANG00000035715	-	100	96.133	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCANG00000030439	-	100	96.133	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCGRG00001004437	Arf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	98.171	ENSCGRG00001013922	Arf1	100	96.133	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.951	ENSCGRG00001001863	Arf2	100	94.475	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCGRG00000006593	Arf3	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCSEG00000003101	arf3b	100	100.000	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	98	92.547	ENSCSEG00000012285	-	99	88.764	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCSEG00000007217	-	100	99.448	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	95.122	ENSCSEG00000009747	arf2b	100	92.818	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	100.000	ENSCVAG00000001271	arf3b	100	100.000	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	100	96.341	ENSCVAG00000000745	arf2b	100	93.370	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0020247	Arf3	99	95.062	ENSCVAG00000021619	-	99	91.620	Cyprinodon_variegatus
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