EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0020473 (Gene tree)
Gene ID: 110336129
Gene Symbol: Nelfe
Alias: NELF-E|Rdbp
Full Name: negative elongation factor complex member E
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5667 bases
Position: chr18:2768122-2773788
Accession: 110336129
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0043855	RRM_1	PF00076.22	3.7e-11	1	1
MGP_PahariEiJ_P0043856	RRM_1	PF00076.22	3.7e-11	1	1
MGP_PahariEiJ_P0043858	RRM_1	PF00076.22	3.7e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0043857	-	973	-	MGP_PahariEiJ_P0043857	232 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0043856	-	1405	XM_021218559	MGP_PahariEiJ_P0043856	369 (aa)	XP_021074218	UPI000A313A33
MGP_PahariEiJ_T0043855	-	1621	XM_021218560	MGP_PahariEiJ_P0043855	369 (aa)	XP_021074219	UPI000A313A33
MGP_PahariEiJ_T0043859	-	496	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0043858	-	1395	XM_021218558	MGP_PahariEiJ_P0043858	369 (aa)	XP_021074217	UPI000A313A33
MGP_PahariEiJ_T0043860	-	431	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0043861	-	420	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	92.453	ENSG00000204356	NELFE	100	94.969	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.081	ENSTSYG00000012132	-	96	87.027	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	92.683	ENSCATG00000028969	NELFE	98	92.683	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.328	ENSCLAG00000009684	NELFE	98	91.328	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	50	48.529	ENSCSAVG00000004231	-	67	48.529	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	45.676	ENSEBUG00000017070	nelfe	99	58.659	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	72	96.296	ENSEEUG00000005004	NELFE	67	96.296	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	49.091	ENSELUG00000005830	nelfe	72	74.227	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	63.243	ENSGALG00000045676	NELFE	94	77.778	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	61.247	ENSGACG00000002935	nelfe	52	66.082	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.914	ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	92.954	ENSMLEG00000030245	NELFE	98	92.954	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	87	58.284	ENSMGAG00000001297	NELFE	75	73.810	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	95.957	ENSMOCG00000003723	Nelfe	100	95.957	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	82	91.279	ENSMODG00000015063	NELFE	93	90.751	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	97.855	MGP_CAROLIEiJ_G0021478	Nelfe	100	97.855	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	98.103	ENSMUSG00000024369	Nelfe	100	98.103	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	97.855	MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	97.855	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	61	73.469	ENSOMEG00000008581	nelfe	66	73.469	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.957	ENSPPAG00000039942	NELFE	98	90.349	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.689	ENSPTRG00000017996	NELFE	98	90.080	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	92.954	ENSPANG00000019366	NELFE	98	92.954	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	67.209	ENSPKIG00000012048	nelfe	75	77.241	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	92.225	ENSPPYG00000016471	NELFE	98	90.349	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	67	89.431	ENSPCAG00000004108	NELFE	65	89.431	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	93.225	ENSPCOG00000024944	NELFE	98	93.225	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	97.290	ENSRNOG00000000420	Nelfe	100	97.290	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.689	ENSRROG00000041993	NELFE	98	90.617	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	61.772	ENSSFOG00015017039	nelfe	99	66.938	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	93	89.826	ENSSARG00000003684	NELFE	95	89.521	Sorex_araneus
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	93.767	ENSSSCG00000001423	NELFE	98	93.767	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	59.621	ENSXCOG00000019513	nelfe	99	59.621	Xiphophorus_couchianus