EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0020501 (Gene tree)
Gene ID: 110335375
Gene Symbol: Gpank1
Alias: Bat4|D17H6S54E|G5
Full Name: G-patch domain and ankyrin repeats 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3301 bases
Position: chr18:3047271-3050571
Accession: 110335375
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0043986	G-patch	PF01585.23	6.6e-13	1	1
MGP_PahariEiJ_P0043988	G-patch	PF01585.23	6.6e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0043988	-	1290	-	MGP_PahariEiJ_P0043988	350 (aa)	XP_021073144	UPI000A30B87C
MGP_PahariEiJ_T0043987	-	256	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0043986	-	1528	XM_021217484	MGP_PahariEiJ_P0043986	350 (aa)	XP_021073143	UPI000A30B87C

Gene Model

Click here to download MGP_PahariEiJ_G0020501's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_PahariEiJ_G0020501's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.552	ENSG00000204438	GPANK1	100	78.552	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	87	36.196	ENSAPOG00000014355	-	98	34.341	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	87	36.196	ENSAPOG00000010685	-	98	34.341	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.294	ENSAMEG00000009290	GPANK1	94	76.554	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	41.732	ENSAOCG00000024034	GPANK1	67	43.137	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	36.364	ENSAPEG00000000530	GPANK1	99	38.441	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.278	ENSATEG00000008243	-	98	35.735	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.482	ENSANAG00000026356	GPANK1	100	76.584	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	41.961	ENSACLG00000001320	GPANK1	98	37.079	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	39.326	ENSAMXG00000012581	-	85	39.326	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.141	ENSBTAG00000008835	GPANK1	100	75.141	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	65	32.051	WBGene00014256	ZK1320.7	60	31.646	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.667	ENSCJAG00000003002	GPANK1	100	77.222	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.271	ENSCAFG00000000601	GPANK1	100	76.271	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.271	ENSCAFG00020020706	GPANK1	100	76.271	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.432	ENSCHIG00000024637	GPANK1	100	75.000	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.930	ENSTSYG00000028288	GPANK1	100	74.930	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.157	ENSCAPG00000005661	GPANK1	95	74.157	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	73.596	ENSCPOG00000031872	GPANK1	100	74.438	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.482	ENSCCAG00000019583	GPANK1	100	75.482	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.716	ENSCATG00000036761	GPANK1	100	77.716	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.404	ENSCLAG00000014639	GPANK1	99	76.124	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.994	ENSCSAG00000008570	GPANK1	100	77.994	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	45.479	ENSCPBG00000014706	GPANK1	99	44.353	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.273	ENSCANG00000038862	GPANK1	100	78.273	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	85.593	ENSCGRG00001007828	Gpank1	97	86.158	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	85.593	ENSCGRG00000014676	Gpank1	100	86.158	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.060	ENSCVAG00000020672	-	98	35.097	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	35.556	ENSDARG00000053995	gpank1	99	36.212	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.833	ENSDNOG00000018727	GPANK1	100	76.111	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.792	ENSDORG00000024662	Gpank1	100	75.900	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	72.778	ENSETEG00000015166	GPANK1	100	72.981	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	79.096	ENSEASG00005016313	GPANK1	100	79.379	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	79.437	ENSECAG00000019093	GPANK1	100	79.437	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	35.942	ENSELUG00000009653	-	98	36.232	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.119	ENSFCAG00000023899	GPANK1	100	77.119	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.271	ENSFDAG00000018857	GPANK1	100	76.271	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.165	ENSFHEG00000013343	-	99	36.538	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	38.655	ENSGMOG00000007797	GPANK1	98	38.655	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	36.517	ENSGAFG00000012817	-	98	36.517	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.897	ENSGACG00000016703	-	98	36.141	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	44.628	ENSGAGG00000011085	GPANK1	99	44.077	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.830	ENSGGOG00000005539	GPANK1	100	78.830	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	41.569	ENSHBUG00000018924	-	99	38.483	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.528	ENSHGLG00000011853	GPANK1	99	76.966	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.143	ENSHGLG00100018021	GPANK1	100	75.706	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.054	ENSHCOG00000000542	-	99	34.688	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	80.114	ENSSTOG00000024202	GPANK1	100	80.114	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.409	ENSJJAG00000015387	Gpank1	100	78.286	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	96	32.337	ENSLBEG00000006109	-	97	31.522	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	87	33.437	ENSLBEG00000005751	GPANK1	100	34.056	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	37.037	ENSLBEG00000006075	-	90	35.613	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	39.623	ENSLACG00000008055	GPANK1	100	39.623	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	43.590	ENSLOCG00000008972	GPANK1	99	44.193	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.309	ENSLAFG00000009499	GPANK1	94	75.967	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.323	ENSMFAG00000037562	GPANK1	100	76.323	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.159	ENSMNEG00000040965	GPANK1	100	77.159	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.994	ENSMLEG00000034247	GPANK1	100	77.994	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.106	ENSMAMG00000008470	-	99	36.074	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	42.308	ENSMZEG00005012135	GPANK1	99	38.398	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	86.364	ENSMAUG00000014293	Gpank1	100	86.364	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.792	ENSMICG00000037690	GPANK1	100	77.008	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	88.286	ENSMOCG00000000141	Gpank1	100	88.286	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.440	ENSMMOG00000003606	-	97	36.559	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	60.833	ENSMODG00000015291	GPANK1	99	62.778	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	40.945	ENSMALG00000002757	-	75	42.353	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	96.000	MGP_CAROLIEiJ_G0021506	Gpank1	100	96.000	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	94.857	ENSMUSG00000092417	Gpank1	100	94.857	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	95.143	MGP_SPRETEiJ_G0022411	Gpank1	100	95.143	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.706	ENSMPUG00000011149	GPANK1	100	75.989	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	73.164	ENSMLUG00000009408	GPANK1	94	73.164	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.437	ENSNLEG00000006201	GPANK1	100	77.437	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	62.784	ENSMEUG00000004082	GPANK1	100	63.636	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	73.407	ENSOPRG00000012134	GPANK1	100	73.407	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	72.934	ENSODEG00000017947	GPANK1	99	72.958	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	71.745	ENSOCUG00000021491	GPANK1	100	74.792	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.916	ENSORLG00000009014	-	99	34.711	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.501	ENSORLG00020012082	-	68	41.860	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	32.973	ENSORLG00015011561	-	99	34.677	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.930	ENSOGAG00000010276	GPANK1	100	78.273	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.716	ENSOARG00000006913	GPANK1	97	75.284	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.273	ENSPPAG00000035166	GPANK1	100	78.273	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.554	ENSPPRG00000001737	GPANK1	100	76.554	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.554	ENSPTIG00000014920	GPANK1	100	76.554	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	78.273	ENSPTRG00000017973	GPANK1	100	78.273	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.994	ENSPANG00000007625	GPANK1	100	77.994	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	43.429	ENSPKIG00000001197	GPANK1	100	42.330	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	45.055	ENSPSIG00000006795	GPANK1	99	44.780	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	90	37.423	ENSPMGG00000019843	-	91	38.344	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	86.119	ENSPEMG00000014457	Gpank1	100	86.686	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	36.649	ENSPMAG00000010274	GPANK1	100	37.831	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	62.849	ENSPCIG00000018505	GPANK1	100	64.225	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	96	34.286	ENSPFOG00000009128	-	98	35.692	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.085	ENSPLAG00000007457	-	99	35.393	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	96	32.857	ENSPMEG00000011187	-	98	34.986	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	34.463	ENSPREG00000000043	-	97	36.338	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.994	ENSPPYG00000016447	GPANK1	90	77.994	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	59.167	ENSPCAG00000012850	GPANK1	100	61.111	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.008	ENSPCOG00000017559	GPANK1	100	78.670	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	63	74.306	ENSPVAG00000012380	-	62	74.658	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	71	41.176	ENSPNYG00000021711	GPANK1	99	37.921	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	90.028	ENSRNOG00000000848	Gpank1	100	90.598	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	77.716	ENSRROG00000036770	GPANK1	100	77.716	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	76.243	ENSSBOG00000031598	GPANK1	100	77.072	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	44.193	ENSSFOG00015015696	gpank1	99	44.986	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	37.673	ENSSMAG00000021273	-	98	37.673	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	34.908	ENSSDUG00000016390	-	85	43.191	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	34.545	ENSSLDG00000022692	-	65	43.191	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.790	ENSSARG00000013203	GPANK1	100	74.790	Sorex_araneus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	99	39.250	ENSSPUG00000017213	GPANK1	99	39.500	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.450	ENSSPAG00000023053	GPANK1	99	35.884	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.568	ENSSSCG00000001413	GPANK1	100	75.568	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	98	35.057	ENSTRUG00000024606	-	99	35.345	Takifugu_rubripes
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.576	ENSTTRG00000014102	GPANK1	100	74.576	Tursiops_truncatus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.294	ENSUAMG00000012437	GPANK1	100	76.836	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	74.576	ENSUMAG00000014147	GPANK1	100	77.119	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	73.938	ENSVPAG00000002989	GPANK1	100	73.938	Vicugna_pacos
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	75.989	ENSVVUG00000020893	GPANK1	100	75.989	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	100	36.288	ENSXETG00000002509	gpank1	100	36.066	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	33.333	ENSXCOG00000005699	-	95	33.523	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0020501	Gpank1	97	33.908	ENSXMAG00000026046	-	98	35.598	Xiphophorus_maculatus