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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0020716 (Gene tree)
Gene ID: 110335897
Gene Symbol: Apobec2
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13796 bases
Position: chr18:16016958-16030753
Accession: 110335897
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0044714	APOBEC_N	PF08210.11	6.6e-51	1	1
MGP_PahariEiJ_P0044714	APOBEC_C	PF05240.14	2.1e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0044714	-	1209	-	MGP_PahariEiJ_P0044714	224 (aa)	XP_021073984	UPI000A30D41B

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	77	31.818	MGP_PahariEiJ_G0020031	-	81	31.818
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	77	34.483	MGP_PahariEiJ_G0022579	Aicda	86	34.483
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	57	30.000	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	73	30.108

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSG00000124701	APOBEC2	100	91.071	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	57.592	ENSAPOG00000019390	apobec2b	69	57.592	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	80	86.034	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	76	81.250	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	56.250	ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	ENSACIG00000002472	APOBEC2	77	59.686	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	97	54.091	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	57.216	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	58.115	ENSAOCG00000023355	apobec2b	69	58.115	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	58.115	ENSAPEG00000004591	apobec2b	69	58.115	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	97	54.338	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	57.216	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	57.592	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	57.592	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	55.556	ENSATEG00000000956	apobec2a	94	60.920	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	84	78.947	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	74.178	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	69.110	ENSACAG00000016506	APOBEC2	94	73.184	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.518	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	91.518	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	79	52.514	ENSACLG00000026736	-	96	52.514	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	ENSACLG00000007634	APOBEC2	69	59.686	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	98	58.904	ENSAMXG00000015966	apobec2b	71	60.396	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	90	52.427	ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	88.393	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	88.393	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	92.411	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	92.411	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	91.071	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.518	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	91.518	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	90.179	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	90.179	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	92.381	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	93	92.381	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	88.626	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	88.626	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	88.626	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	88.626	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.964	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	91.964	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	89.286	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	89.286	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	87.281	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	89.100	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	91.071	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	80	93.296	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	99	93.296	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	83	79.144	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	95	75.355	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	90.625	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	90.625	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	95.982	ENSCGRG00001014983	Apobec2	100	95.982	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	95.982	ENSCGRG00000007835	Apobec2	100	95.982	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	55.300	ENSCSEG00000020201	apobec2a	80	56.250	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	56.021	ENSCSEG00000000690	-	69	56.021	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	92	58.937	ENSCVAG00000012342	apobec2b	75	58.937	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	93	56.604	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	56.604	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	61.140	ENSDARG00000018881	apobec2a	76	58.852	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	65.066	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	65.066	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	89.083	ENSDORG00000006447	Apobec2	92	90.995	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	87.204	ENSETEG00000000624	APOBEC2	92	87.204	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	90.104	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	90.104	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	91.071	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	85.714	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	85.714	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	55.959	ENSELUG00000003736	apobec2a	69	54.455	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	89.286	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	100	89.286	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	99	58.850	ENSFALG00000003910	APOBEC2	94	60.377	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	88.444	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	88.444	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	62.304	ENSFHEG00000005492	apobec2b	79	62.304	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	77	64.740	ENSGMOG00000007028	apobec2a	96	64.740	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	56.021	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	56.021	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	78.010	ENSGALG00000003226	APOBEC2	95	73.364	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	61.780	ENSGAFG00000007634	apobec2b	60	61.780	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	56.995	ENSGACG00000009663	apobec2b	83	56.995	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	57.216	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	57.216	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	83	78.610	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	95	74.528	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	92.381	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	91	92.381	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	ENSHBUG00000005993	apobec2b	69	59.686	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	97	54.795	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	58.031	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	87.678	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	93	87.678	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	87.678	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	93	87.678	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	59.067	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	71	59.067	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	99	52.232	ENSHCOG00000020319	apobec2a	78	57.000	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	53.425	ENSIPUG00000017355	apobec2a	59	54.502	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	89	59.000	ENSIPUG00000013784	Apobec2	74	59.000	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	90.625	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	90.625	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	88.839	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	88.839	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	58.947	ENSKMAG00000020631	apobec2b	69	58.947	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	98	52.511	ENSLBEG00000009422	-	66	57.592	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	98	53.846	ENSLBEG00000025214	apobec2a	82	56.650	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	89	66.000	ENSLACG00000015985	APOBEC2	85	66.000	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	90	59.701	ENSLOCG00000012415	apobec2b	71	59.701	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	95	91.038	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	90.625	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	91.071	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	91.071	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	91.071	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	91.071	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	99	56.054	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	60.309	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	68	59.686	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.162	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	69	59.162	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	97	54.338	ENSMZEG00005005240	-	91	56.364	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	78.010	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	93	77.222	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	94.643	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	94.643	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSMICG00000043339	APOBEC2	100	91.071	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	95.536	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	95.536	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	93	54.327	ENSMMOG00000008681	apobec2b	76	54.327	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	52	45.690	ENSMMOG00000009531	-	66	45.690	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	99	82.960	ENSMODG00000013090	APOBEC2	95	85.167	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	57.592	ENSMALG00000013779	APOBEC2	72	57.592	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	59.278	ENSMALG00000020523	apobec2a	76	59.278	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	99.554	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	99.554	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	99.554	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	99.554	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	89.573	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	90	90.000	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	88.785	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	91	89.048	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	94.643	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	94.643	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.162	ENSNBRG00000018806	apobec2b	61	59.162	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	86	58.031	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	58.031	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	91.071	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	91.071	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	99	83.857	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	95	86.124	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	87.281	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	88.596	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	88.626	ENSODEG00000016183	APOBEC2	92	88.626	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.686	ENSONIG00000012289	apobec2b	69	59.686	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	97	55.708	ENSONIG00000004644	-	75	59.585	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	75	84.024	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	80.110	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	89.427	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	89.427	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	53.333	ENSORLG00000010752	apobec2a	84	54.680	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	98	53.182	ENSORLG00000022372	APOBEC2	69	57.592	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	53.333	ENSORLG00020004153	apobec2a	84	54.680	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	98	53.636	ENSORLG00020006164	APOBEC2	69	58.115	Oryzias_latipes_hni
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MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	53.333	ENSORLG00015021781	apobec2a	84	54.680	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	59.162	ENSOMEG00000015449	APOBEC2	76	59.162	Oryzias_melastigma
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MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	83	78.610	ENSPSIG00000013480	APOBEC2	97	70.852	Pelodiscus_sinensis
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MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	96	56.279	ENSSLDG00000020199	apobec2a	81	57.416	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	89	65.217	ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	Sphenodon_punctatus
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MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	58.115	ENSTNIG00000015038	apobec2b	70	58.115	Tetraodon_nigroviridis
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MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	82.456	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	92	85.238	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	59	83.824	ENSUMAG00000012252	APOBEC2	77	88.983	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	55	94.937	ENSVPAG00000008024	APOBEC2	55	94.937	Vicugna_pacos
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	94	90.952	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	100	91.071	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	48.739	ENSXETG00000008007	apobec2	92	51.598	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	90	59.901	ENSXCOG00000007398	apobec2b	77	59.901	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	61.257	ENSXMAG00000008134	apobec2b	68	61.257	Xiphophorus_maculatus