EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0020902 (Gene tree)
Gene ID: 110335883
Gene Symbol: Thumpd2
Alias: 2810025A12Rik
Full Name: THUMP domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42306 bases
Position: chr18:46892945-46935250
Accession: 110335883
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0045234	THUMP	PF02926.17	2.2e-06	1	1
MGP_PahariEiJ_P0045234	MTS	PF05175.14	1.3e-05	1	1
MGP_PahariEiJ_P0045234	UPF0020	PF01170.18	1.9e-25	1	1
MGP_PahariEiJ_P0045234	Methyltransf_31	PF13847.6	1.9e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0045234	-	1852	-	MGP_PahariEiJ_P0045234	528 (aa)	XP_021073964	UPI000A30AE1C

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.254	ENSG00000138050	THUMPD2	88	81.818	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	74	44.068	ENSAPOG00000001802	-	67	43.771	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	65.217	ENSAMEG00000008664	THUMPD2	99	65.217	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	72	35.641	ENSACIG00000011677	THUMPD2	81	35.641	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	58	50.239	ENSAOCG00000000927	THUMPD2	67	42.712	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	58	49.761	ENSAPEG00000000981	thumpd2	67	42.373	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	75	43.260	ENSATEG00000012329	thumpd2	65	43.260	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	48.760	ENSAPLG00000008775	THUMPD2	99	48.760	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	88	48.649	ENSACAG00000000538	THUMPD2	98	48.649	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.056	ENSANAG00000034298	THUMPD2	100	68.056	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	93	36.832	ENSACLG00000025840	thumpd2	97	41.781	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	34.292	ENSAMXG00000011080	thumpd2	98	34.343	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.940	ENSBTAG00000004722	THUMPD2	99	64.940	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.659	ENSCJAG00000014891	THUMPD2	100	67.659	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.594	ENSCAFG00000006471	THUMPD2	100	67.594	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	67.019	ENSCAFG00020021695	THUMPD2	100	67.019	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.143	ENSCHIG00000013921	THUMPD2	99	64.143	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	66.164	ENSTSYG00000010555	THUMPD2	99	65.854	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.811	ENSCPOG00000003368	THUMPD2	100	64.811	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.793	ENSCCAG00000034405	THUMPD2	100	67.793	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.857	ENSCATG00000012396	THUMPD2	100	67.857	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.683	ENSCLAG00000003029	THUMPD2	99	64.683	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	77	66.667	ENSCSAG00000012431	THUMPD2	100	66.667	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	67	61.690	ENSCHOG00000000360	THUMPD2	100	61.690	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	53.411	ENSCPBG00000018272	THUMPD2	97	53.411	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.793	ENSCANG00000032596	THUMPD2	100	67.793	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	100	80.755	ENSCGRG00001009939	Thumpd2	100	80.755	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	80.213	ENSCGRG00000006284	Thumpd2	100	80.213	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	35.052	ENSDARG00000093070	thumpd2	98	37.166	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.671	ENSDNOG00000019834	THUMPD2	99	64.671	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	55.675	ENSETEG00000001300	THUMPD2	99	55.675	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	52	41.696	ENSEBUG00000010906	THUMPD2	85	41.696	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	67	30.541	ENSEBUG00000004221	thumpd3	82	30.541	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	97	67.121	ENSEASG00005005106	THUMPD2	98	68.504	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	66.864	ENSECAG00000010799	THUMPD2	97	68.245	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	55.411	ENSEEUG00000000105	THUMPD2	100	55.411	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	37.282	ENSELUG00000003735	thumpd2	92	38.218	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.063	ENSFCAG00000006809	THUMPD2	100	67.063	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	47.379	ENSFALG00000008655	THUMPD2	91	48.225	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	36.312	ENSFHEG00000011402	thumpd2	97	36.312	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	54	36.301	ENSGMOG00000002236	-	100	36.014	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	78	49.165	ENSGALG00000009119	THUMPD2	99	49.165	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	36.117	ENSGAFG00000012683	thumpd2	99	35.490	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	72	47.194	ENSGAGG00000001325	THUMPD2	98	47.194	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.254	ENSGGOG00000001608	THUMPD2	100	68.254	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	61	41.765	ENSHBUG00000011780	-	59	44.373	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.793	ENSHGLG00000019145	THUMPD2	99	67.793	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	92	34.694	ENSIPUG00000015283	thumpd2	98	34.694	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	69.307	ENSSTOG00000027472	THUMPD2	100	69.307	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	86	66.231	ENSJJAG00000020374	Thumpd2	97	66.231	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	75	40.566	ENSLBEG00000007585	THUMPD2	87	36.697	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	39.689	ENSLOCG00000015747	THUMPD2	97	43.103	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	55	66.553	ENSLAFG00000005383	-	97	66.553	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.857	ENSMFAG00000031464	THUMPD2	100	67.857	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.056	ENSMMUG00000011841	THUMPD2	100	68.056	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.857	ENSMNEG00000037438	THUMPD2	100	67.857	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	67.532	ENSMLEG00000031490	THUMPD2	100	67.532	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	75	37.438	ENSMAMG00000022090	thumpd2	81	37.438	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	82	42.183	ENSMZEG00005027354	-	67	44.839	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	50.313	ENSMGAG00000007605	THUMPD2	99	50.313	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	99	77.883	ENSMAUG00000012866	Thumpd2	99	77.883	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	92	68.443	ENSMICG00000008042	THUMPD2	100	67.460	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	99	76.560	ENSMOCG00000018094	Thumpd2	99	76.560	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	69	44.118	ENSMMOG00000007356	thumpd2	90	44.118	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	57.173	ENSMODG00000009129	THUMPD2	100	57.388	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	68	38.247	ENSMALG00000020471	thumpd2	96	32.515	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	100	91.098	MGP_CAROLIEiJ_G0021912	Thumpd2	100	91.098	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	100	91.098	ENSMUSG00000024246	Thumpd2	100	91.098	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	100	91.856	MGP_SPRETEiJ_G0022828	Thumpd2	100	91.856	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	66.004	ENSMPUG00000010563	THUMPD2	99	66.004	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	65.751	ENSMLUG00000009688	THUMPD2	100	65.751	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	96	71.709	ENSNGAG00000016396	Thumpd2	99	71.709	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.254	ENSNLEG00000016562	THUMPD2	100	68.254	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	53.165	ENSMEUG00000014815	THUMPD2	99	53.165	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	55.965	ENSOPRG00000013478	THUMPD2	99	55.965	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	76	39.855	ENSONIG00000001165	thumpd2	95	40.338	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	68	56.593	ENSOANG00000004028	-	97	56.593	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	64.427	ENSOCUG00000003257	THUMPD2	100	67.500	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	93	37.354	ENSORLG00000002138	thumpd2	99	37.354	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	74	36.658	ENSORLG00020018792	thumpd2	94	36.658	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	92	36.779	ENSORLG00015005237	thumpd2	99	36.905	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	93	33.271	ENSOMEG00000023563	thumpd2	98	33.271	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	64.629	ENSOGAG00000010890	THUMPD2	99	64.629	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	60.000	ENSOARG00000007841	THUMPD2	99	60.000	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	92	69.325	ENSPPAG00000033850	THUMPD2	99	69.325	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	66.468	ENSPPRG00000003874	THUMPD2	100	66.468	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	65.152	ENSPTIG00000004118	THUMPD2	96	65.152	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	68.651	ENSPTRG00000011860	THUMPD2	100	68.651	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	67.659	ENSPANG00000004807	THUMPD2	100	67.659	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	38.351	ENSPKIG00000022207	THUMPD2	89	38.193	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	52.854	ENSPSIG00000003159	THUMPD2	99	52.854	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	100	78.154	ENSPEMG00000009015	Thumpd2	100	78.154	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	72	41.282	ENSPMAG00000006922	thumpd2	99	41.282	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	94	52.104	ENSPCIG00000022621	THUMPD2	96	52.104	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	91	35.827	ENSPFOG00000006461	thumpd2	96	36.527	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	68	47.059	ENSPLAG00000010700	THUMPD2	81	47.059	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	74	43.607	ENSPMEG00000009573	-	89	43.607	Poecilia_mexicana
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MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	87	54.783	ENSPCAG00000007326	THUMPD2	99	54.783	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	95	56.548	ENSPCOG00000028456	-	100	56.548	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	92	69.057	ENSPCOG00000000396	-	100	68.254	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	89	64.905	ENSPVAG00000008101	THUMPD2	100	64.905	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0020902	Thumpd2	93	32.625	ENSPNYG00000009804	THUMPD2	97	33.141	Pundamilia_nyererei
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