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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0024015 (Gene tree)
Gene ID: 110338616
Gene Symbol: Aco1
Alias: Aco-1|Irebp|Irp1
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 51440 bases
Position: chr22:45985834-46037273
Accession: 110338616
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0057433	Aconitase	PF00330.20	1.2e-182	1	1
MGP_PahariEiJ_P0057433	Aconitase_C	PF00694.19	3.2e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0057434	-	603	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0057435	-	414	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0057436	-	645	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0057433	-	3840	XM_021221906	MGP_PahariEiJ_P0057433	889 (aa)	XP_021077565	UPI000A3079DE

Gene Model

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	61.917	MGP_PahariEiJ_G0015103	Ireb2	91	61.917

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.701	ENSG00000122729	ACO1	100	93.701	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.790	ENSAPOG00000008670	aco1	99	82.790	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.921	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	92.921	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.790	ENSACIG00000014377	aco1	99	82.790	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	83.127	ENSAOCG00000007699	aco1	99	83.127	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	83.015	ENSAPEG00000014370	aco1	99	83.015	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.446	ENSATEG00000000560	aco1	99	83.446	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	87.387	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	97	87.442	ENSACAG00000001541	ACO1	99	87.442	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	92.342	ENSANAG00000003359	ACO1	99	92.342	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	83.127	ENSACLG00000007755	aco1	99	83.127	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.108	ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.108	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.376	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	94.376	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.463	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	92.463	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.258	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	93.258	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	93.363	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.601	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	94.601	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.038	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	94.038	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	73.341	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	73.228	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.013	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	92.013	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.238	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	92.238	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSCATG00000045333	ACO1	100	93.363	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.463	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.463	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.476	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	93.476	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	90	74.738	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	74.625	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	89.077	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	89.077	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.138	ENSCANG00000014847	ACO1	100	93.138	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	98.200	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	98.200	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	97.075	ENSCGRG00000004877	-	100	97.075	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	78.805	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.805	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	76.663	ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.902	ENSDARG00000026376	aco1	99	82.902	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	93.363	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.251	ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.251	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	86	71.429	ENSETEG00000012415	-	85	71.429	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	58.501	ENSEBUG00000015441	aco1	97	58.501	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.376	ENSEASG00005004602	ACO1	100	94.376	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.263	ENSECAG00000014846	ACO1	100	94.263	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	81.552	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	81.552	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	81.665	ENSELUG00000016812	aco1	97	81.665	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	93.363	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	87.162	ENSFALG00000001167	ACO1	99	87.162	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.688	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	92.688	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.976	ENSFHEG00000005619	aco1	99	82.976	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	79.458	ENSGMOG00000005514	aco1	99	79.458	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	87.387	ENSGALG00000002162	ACO1	99	87.387	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.115	ENSGACG00000001637	aco1	99	82.115	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	88.626	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.626	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.701	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	93.701	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	83.015	ENSHBUG00000008952	aco1	99	83.015	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.588	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	93.588	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.588	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.588	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	79.594	ENSHCOG00000015881	aco1	99	79.594	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.565	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.565	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.826	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	94.826	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	95.051	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	95.051	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.432	ENSKMAG00000015759	aco1	99	82.432	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	78.427	ENSLBEG00000013866	aco1	99	78.427	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	75	73.156	ENSLACG00000000936	ACO1	99	73.145	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	84.364	ENSLOCG00000011082	aco1	99	84.364	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.463	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	93.363	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.476	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	93.476	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.251	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	93.251	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.476	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	93.476	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	83.465	ENSMAMG00000002915	aco1	99	83.465	Mastacembelus_armatus
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MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	72.098	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	72.098	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	97.413	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	97.413	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.813	ENSMICG00000006540	ACO1	100	93.813	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	97.300	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	97.300	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	81.440	ENSMMOG00000020282	aco1	99	81.440	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	89.989	ENSMODG00000004463	ACO1	100	89.989	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.902	ENSMALG00000019764	aco1	99	82.902	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	98.763	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	98.763	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	98.875	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	98.875	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	99.325	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	99.325	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.251	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	93.251	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.238	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	92.238	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	96.288	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	96.288	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	65.436	ENSNBRG00000008973	aco1	99	65.213	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.701	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	93.701	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	90	82.688	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	82.688	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	89.989	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	89.989	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	88.526	ENSODEG00000015432	-	100	88.076	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	91.001	ENSODEG00000001240	-	100	91.001	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.790	ENSONIG00000019869	aco1	99	82.790	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	81	91.010	ENSOANG00000012132	ACO1	100	91.010	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.214	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	91.991	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.108	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.108	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.883	ENSORLG00020010991	aco1	99	82.883	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.770	ENSORLG00015011785	aco1	99	82.770	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	81.151	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.151	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.701	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	93.701	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	94.601	ENSOARG00000014707	ACO1	98	94.601	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.588	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	93.588	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.363	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	93.363	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.251	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	93.251	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	93.588	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	93.588	Pan_troglodytes
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