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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0024789 (Gene tree)
Gene ID: 110318555
Gene Symbol: Rexo4
Alias: Rex4|XPMC2H
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10537 bases
Position: chr3:14176085-14186621
Accession: 110318555
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0061485	RNase_T	PF00929.24	2.6e-19	1	1
MGP_PahariEiJ_P0061486	RNase_T	PF00929.24	2.9e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0061490	-	737	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0061488	-	359	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0061489	-	592	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0061492	-	384	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0061485	-	2281	XM_021193702	MGP_PahariEiJ_P0061485	409 (aa)	XP_021049361	-
MGP_PahariEiJ_T0061486	-	2278	XM_021193702	MGP_PahariEiJ_P0061486	432 (aa)	XP_021049361	-
MGP_PahariEiJ_T0061487	-	660	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0061491	-	575	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.903	ENSG00000148300	REXO4	96	69.660	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	53.977	ENSAPOG00000019264	rexo4	83	51.676	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	91	66.316	ENSAMEG00000011649	REXO4	89	66.935	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	54.391	ENSAOCG00000004087	rexo4	83	52.925	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	54.391	ENSAPEG00000009106	rexo4	83	52.925	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	84	50.997	ENSATEG00000017662	rexo4	81	50.997	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	80	54.303	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	53.353	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	66.102	ENSANAG00000028404	REXO4	96	66.990	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.342	ENSACLG00000006007	rexo4	83	50.815	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	52.113	ENSAMXG00000013291	rexo4	80	51.268	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	89	65.312	ENSBTAG00000019721	REXO4	88	62.602	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	66.505	ENSCJAG00000009774	REXO4	96	66.908	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	94	68.020	ENSCAFG00000019767	REXO4	91	67.553	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	96	68.238	ENSCAFG00020000983	-	88	68.351	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	91	64.362	ENSCHIG00000009517	REXO4	88	62.873	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	90	70.889	ENSTSYG00000027492	REXO4	88	69.003	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	69.795	ENSCAPG00000014583	REXO4	99	67.836	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	66.265	ENSCPOG00000001386	REXO4	88	65.385	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	61.836	ENSCCAG00000027049	REXO4	96	61.594	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	68.932	ENSCATG00000028646	REXO4	96	68.613	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	79	70.732	ENSCLAG00000006919	REXO4	99	70.427	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	68.599	ENSCSAG00000015280	REXO4	97	68.357	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	95	51.724	ENSCPBG00000021152	REXO4	84	55.337	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	51	56.667	ENSCING00000010751	-	95	50.000	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.175	ENSCANG00000029855	REXO4	96	68.932	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	81.553	ENSCGRG00001013126	Rexo4	100	80.796	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	81.553	ENSCGRG00000009819	Rexo4	100	81.553	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	50.725	ENSCSEG00000019343	rexo4	80	51.020	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	51	65.421	ENSCVAG00000014963	rexo4	62	63.158	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	51	66.822	ENSDARG00000088619	rexo4	79	66.822	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	94	56.376	ENSDNOG00000002429	REXO4	81	63.810	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	82	73.887	ENSDORG00000006190	Rexo4	99	72.700	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	59	69.136	ENSEASG00005009915	-	79	68.313	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	91	70.053	ENSECAG00000007896	REXO4	81	70.027	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	86	48.813	ENSELUG00000003539	rexo4	84	48.813	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	90	66.757	ENSFCAG00000011652	REXO4	84	67.308	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	90	53.786	ENSFALG00000001520	REXO4	91	53.264	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	71.744	ENSFDAG00000016050	REXO4	97	70.690	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	90	50.811	ENSFHEG00000002413	rexo4	86	49.721	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	51	60.094	ENSGMOG00000012876	rexo4	64	60.094	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	67	47.500	ENSGAFG00000015404	-	83	47.143	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	53.448	ENSGACG00000008065	rexo4	79	52.312	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	55.966	ENSGAGG00000010260	REXO4	84	55.620	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.660	ENSGGOG00000014508	REXO4	96	69.417	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.342	ENSHBUG00000000542	rexo4	83	50.815	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	70.792	ENSHGLG00000016901	REXO4	96	71.040	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	70.792	ENSHGLG00100017444	REXO4	96	71.040	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	51	63.033	ENSHCOG00000018196	rexo4	57	61.991	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	89	47.781	ENSIPUG00000021084	rexo4	85	48.128	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	69.830	ENSSTOG00000003754	REXO4	98	69.343	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	73.608	ENSJJAG00000013002	Rexo4	87	76.267	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	51.304	ENSKMAG00000015039	rexo4	81	51.014	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	52.286	ENSLBEG00000025570	rexo4	80	51.685	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	87	50.802	ENSLACG00000012399	REXO4	85	50.267	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	51.705	ENSLOCG00000003577	rexo4	82	50.678	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	61.520	ENSLAFG00000011274	REXO4	89	64.343	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	68.932	ENSMFAG00000042425	REXO4	96	68.689	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	68.689	ENSMMUG00000000935	REXO4	96	68.447	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	68.447	ENSMNEG00000031604	REXO4	96	68.204	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	68.932	ENSMLEG00000037716	REXO4	96	68.689	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	84	52.941	ENSMAMG00000011251	rexo4	86	50.135	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	49.727	ENSMZEG00005012336	rexo4	83	50.543	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	55.899	ENSMGAG00000006521	REXO4	97	54.875	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	83.981	ENSMAUG00000015137	Rexo4	100	83.138	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	67.082	ENSMICG00000008422	REXO4	88	67.480	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	82.927	ENSMOCG00000020607	Rexo4	100	81.481	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	86	57.534	ENSMODG00000012817	REXO4	84	55.890	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	87	54.821	ENSMALG00000019705	rexo4	83	54.017	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	92.665	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	100	92.665	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	92.822	ENSMUSG00000052406	Rexo4	99	92.822	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	92.822	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	99	92.822	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	82	67.353	ENSMPUG00000012315	REXO4	96	66.765	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	72.549	ENSNGAG00000010700	Rexo4	99	71.814	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	51.515	ENSNBRG00000011712	rexo4	83	51.247	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	63.325	ENSNLEG00000007556	-	90	66.757	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	67.797	ENSNLEG00000013130	-	96	67.554	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	44.193	ENSMEUG00000006513	-	86	44.193	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	65.407	ENSODEG00000015721	REXO4	99	64.826	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	87	52.717	ENSONIG00000020052	rexo4	85	50.802	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	89	53.600	ENSOANG00000002453	REXO4	96	53.457	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.841	ENSORLG00000006904	rexo4	83	52.841	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	53.390	ENSORLG00020013768	rexo4	83	53.390	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	92	50.636	ENSORLG00015012070	rexo4	83	52.273	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	54.062	ENSOMEG00000018327	rexo4	81	52.825	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	66.750	ENSOGAG00000014040	REXO4	85	70.704	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.903	ENSPPAG00000027911	REXO4	96	69.660	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	97	66.500	ENSPPRG00000002894	REXO4	90	67.027	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	94	57.436	ENSPTIG00000012007	REXO4	87	57.754	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.903	ENSPTRG00000023363	REXO4	96	69.660	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	98	69.175	ENSPANG00000026040	REXO4	96	68.932	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	52.707	ENSPKIG00000024761	rexo4	81	52.691	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	57.224	ENSPSIG00000016908	REXO4	84	56.620	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	49.206	ENSPMGG00000005312	rexo4	64	59.592	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	100	85.575	ENSPEMG00000017982	Rexo4	100	85.575	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	95	55.860	ENSPCIG00000017379	REXO4	84	57.895	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.707	ENSPFOG00000017751	rexo4	83	51.275	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.422	ENSPLAG00000010487	rexo4	83	50.992	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.571	ENSPMEG00000020767	rexo4	83	49.322	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	51.567	ENSPREG00000021841	rexo4	83	50.425	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	99	69.007	ENSPPYG00000019735	REXO4	97	68.765	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	86	63.611	ENSPCAG00000010581	REXO4	85	63.056	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	91	70.213	ENSPCOG00000025466	REXO4	88	70.541	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	95	59.439	ENSPVAG00000001429	REXO4	87	59.016	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	85	52.617	ENSPNYG00000013712	rexo4	83	51.087	Pundamilia_nyererei
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