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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0025455 (Gene tree)
Gene ID: 110318829
Gene Symbol: Caprin1
Alias: Gpiap1|MMGPIP137|RNG105|caprin-1
Full Name: cell cycle associated protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36083 bases
Position: chr3:87859742-87895824
Accession: 110318829
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0064384	Caprin-1_C	PF12287.8	4e-136	1	1
MGP_PahariEiJ_P0064385	Caprin-1_C	PF12287.8	4e-136	1	1
MGP_PahariEiJ_P0064386	Caprin-1_C	PF12287.8	4.4e-90	1	1
MGP_PahariEiJ_P0064391	Caprin-1_C	PF12287.8	2.8e-25	1	1
MGP_PahariEiJ_P0064387	Caprin-1_C	PF12287.8	2.5e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0064388	-	821	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064389	-	937	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064384	-	6177	XM_021194111	MGP_PahariEiJ_P0064384	707 (aa)	XP_021049770	UPI000A305D8F
MGP_PahariEiJ_T0064385	-	4068	-	MGP_PahariEiJ_P0064385	707 (aa)	-	UPI000A305D8F
MGP_PahariEiJ_T0064386	-	1927	-	MGP_PahariEiJ_P0064386	213 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064387	-	859	-	MGP_PahariEiJ_P0064387	93 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064397	-	392	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064396	-	824	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064395	-	565	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064394	-	879	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064393	-	481	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064392	-	570	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064391	-	760	-	MGP_PahariEiJ_P0064391	253 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064390	-	799	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0064398	-	629	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	89	42.966	MGP_PahariEiJ_G0022834	Caprin2	94	36.310

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	43.396	ENSG00000110888	CAPRIN2	94	51.969	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	97.183	ENSG00000135387	CAPRIN1	100	97.312	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.453	ENSAPOG00000010508	caprin1b	93	61.550	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.345	ENSAPOG00000004726	caprin1a	95	54.058	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.077	ENSAMEG00000008137	CAPRIN1	94	97.612	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	43.062	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	55	43.511	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	57.000	ENSACIG00000005383	caprin1a	95	52.842	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.925	ENSACIG00000017913	caprin1b	94	60.490	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.453	ENSAOCG00000004574	caprin1b	93	63.174	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.853	ENSAOCG00000003017	caprin1a	95	54.893	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.853	ENSAPEG00000008548	caprin1a	95	55.046	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.453	ENSAPEG00000001227	caprin1b	93	62.712	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	69.340	ENSATEG00000015675	caprin1b	94	62.923	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.219	ENSATEG00000007707	caprin1a	95	53.566	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	43.172	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	54	42.963	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	92.670	ENSAPLG00000006975	CAPRIN1	100	89.185	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	95	39.171	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	54	38.989	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	89.552	ENSACAG00000013621	CAPRIN1	95	86.186	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.756	ENSANAG00000032811	-	100	96.756	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	95	41.346	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	66	42.697	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	66.525	ENSANAG00000034464	-	88	70.505	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.925	ENSACLG00000007463	caprin1b	93	61.738	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	55.500	ENSACLG00000026749	caprin1a	95	53.988	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	61.111	ENSAMXG00000005142	caprin1b	92	56.703	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	67.431	ENSAMXG00000006601	caprin1a	95	54.683	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	31.132	ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.163	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	44.019	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	58	43.893	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.186	ENSBTAG00000016744	CAPRIN1	100	96.186	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	43.868	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	69	41.948	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.756	ENSCJAG00000010542	CAPRIN1	100	96.756	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	43.269	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	58	43.511	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.234	ENSCAFG00000007104	CAPRIN1	100	96.234	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.077	ENSCAFG00020004525	CAPRIN1	100	97.561	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	43.062	ENSCAFG00020018961	-	59	41.481	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	89	44.961	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	59	44.574	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.610	ENSCHIG00000017561	CAPRIN1	100	96.610	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	86.000	ENSTSYG00000028754	-	98	81.750	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	92.500	ENSTSYG00000033857	-	100	91.720	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	44.340	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	66	42.748	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	99	93.023	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	95	84.711	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.774	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	100	96.254	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	43.541	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	70	37.307	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.756	ENSCCAG00000020172	-	100	96.656	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	96	74.521	ENSCCAG00000036089	-	94	75.156	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	44.019	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	66	42.697	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	82.593	ENSCCAG00000022482	-	95	85.202	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	43.269	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	69	42.697	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.897	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	100	96.897	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	42.456	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	73	37.389	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.040	ENSCLAG00000015468	-	100	100.000	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	67.647	ENSCLAG00000007513	-	94	66.913	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	43.541	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	58	42.697	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	90.370	ENSCSAG00000005378	CAPRIN1	86	96.269	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.558	ENSCHOG00000001622	CAPRIN1	77	98.701	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	90	42.439	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	51	39.216	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	91.500	ENSCPBG00000012511	CAPRIN1	94	88.102	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	93	44.495	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.756	ENSCANG00000032583	CAPRIN1	100	96.656	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	43.396	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	65	42.697	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	85	42.029	ENSCGRG00001002901	Caprin2	70	35.387	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	97.595	ENSCGRG00001006383	Caprin1	100	97.595	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	97.849	ENSCGRG00000012551	Caprin1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	79	46.575	ENSCGRG00000001249	Caprin2	72	34.913	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	66.038	ENSCSEG00000013073	caprin1b	93	61.598	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	54.774	ENSCSEG00000001898	caprin1a	94	53.406	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	57.071	ENSCVAG00000005129	caprin1a	95	52.632	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	69.048	ENSCVAG00000021994	caprin1b	95	61.898	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	96	61.611	ENSDARG00000009346	caprin1a	95	56.068	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	63.594	ENSDARG00000054272	caprin1b	93	61.035	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	85	40.513	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	62	42.972	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.077	ENSDNOG00000031223	-	99	93.794	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	97.596	ENSDNOG00000037711	-	100	96.656	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	90.000	ENSDORG00000006566	Caprin1	95	90.448	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	42.857	ENSDORG00000012639	Caprin2	73	36.758	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	50	33.333	ENSETEG00000011498	-	52	38.144	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	97.115	ENSETEG00000009308	CAPRIN1	100	95.000	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	41.667	ENSEBUG00000005422	CAPRIN1	92	39.531	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	38.393	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	58	43.130	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	97.115	ENSEASG00005020196	CAPRIN1	99	95.133	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	96.635	ENSECAG00000007147	CAPRIN1	99	95.290	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	38.393	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	58	43.130	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.558	ENSEEUG00000006638	CAPRIN1	100	95.476	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	96	56.330	ENSELUG00000009443	caprin1a	98	55.217	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	96	63.208	ENSELUG00000006003	caprin1b	93	58.069	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	42.654	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	67	43.511	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	98.077	ENSFCAG00000030411	CAPRIN1	100	96.975	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	92.000	ENSFALG00000001291	CAPRIN1	94	88.805	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	44.348	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	52	42.435	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	95.699	ENSFDAG00000015466	CAPRIN1	100	98.361	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	88	42.647	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	59	43.985	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	66.667	ENSFHEG00000009076	caprin1b	95	60.542	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.500	ENSFHEG00000020227	caprin1a	95	52.511	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	60.849	ENSGMOG00000002853	caprin1b	94	57.982	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	55.505	ENSGMOG00000008955	caprin1a	96	51.506	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	92.000	ENSGALG00000013532	CAPRIN1	94	89.124	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	42.986	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	53	42.593	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	56.500	ENSGAFG00000013909	caprin1a	95	52.879	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	69.340	ENSGACG00000009867	caprin1b	93	60.909	Gasterosteus_aculeatus
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	97	93.237	ENSMEUG00000012704	CAPRIN1	99	83.251	Notamacropus_eugenii
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	52.500	ENSORLG00020012410	caprin1a	94	51.777	Oryzias_latipes_hni
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	66.038	ENSORLG00015005783	caprin1b	93	61.120	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	66.509	ENSOMEG00000013708	caprin1b	93	60.433	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	52.869	ENSOMEG00000020990	caprin1a	85	51.387	Oryzias_melastigma
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	100	96.897	ENSPTRG00000003493	CAPRIN1	100	96.815	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	43.396	ENSPTRG00000004802	CAPRIN2	64	43.071	Pan_troglodytes
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	69.194	ENSPKIG00000003997	CAPRIN1	91	62.346	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	94	61.836	ENSPKIG00000015169	-	93	58.168	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	98	46.256	ENSPSIG00000016188	CAPRIN2	55	41.418	Pelodiscus_sinensis
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MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	91	55.556	ENSPMGG00000004813	caprin1a	95	51.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
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