EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0028758 (Gene tree)
Gene ID: 110322897
Gene Symbol: Trit1
Alias: 2310075G14Rik|MOD5
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38899 bases
Position: chr6:74110422-74149320
Accession: 110322897
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0079323	IPPT	PF01715.17	2.4e-65	1	1
MGP_PahariEiJ_P0079323	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	7.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0079322	-	1969	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0079323	-	2079	XM_021199807	MGP_PahariEiJ_P0079323	467 (aa)	XP_021055466	UPI000A306A09
MGP_PahariEiJ_T0079324	-	512	-	-	- (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.651	ENSG00000043514	TRIT1	97	91.988	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	89	64.762	ENSAPOG00000020918	trit1	91	64.762	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.938	ENSAMEG00000004342	TRIT1	100	86.938	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	85	64.573	ENSACIG00000017409	trit1	99	59.062	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	89	64.762	ENSAOCG00000009850	trit1	87	64.762	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	89	64.762	ENSAPEG00000001481	trit1	87	64.762	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	95	59.688	ENSATEG00000005426	trit1	88	60.690	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	71	67.941	ENSAPLG00000011421	TRIT1	97	67.941	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	87	73.399	ENSACAG00000002280	TRIT1	83	73.399	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.580	ENSANAG00000030732	TRIT1	100	87.580	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	58.836	ENSACLG00000004920	trit1	92	59.603	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	93	61.379	ENSAMXG00000010959	trit1	92	62.500	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.724	ENSBTAG00000013832	TRIT1	100	86.724	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	84	34.793	WBGene00001740	gro-1	95	34.434	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.366	ENSCJAG00000002620	TRIT1	100	87.366	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.325	ENSCAFG00000003048	TRIT1	100	86.325	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	84.407	ENSCAFG00020003875	TRIT1	97	88.604	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	85.249	ENSCHIG00000013259	TRIT1	98	85.249	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.326	ENSTSYG00000004363	TRIT1	100	88.223	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	77	84.680	ENSCAPG00000017001	TRIT1	93	84.680	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.296	ENSCPOG00000012820	TRIT1	100	86.296	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.296	ENSCCAG00000031271	TRIT1	100	86.296	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	99	82.729	ENSCATG00000034344	TRIT1	97	87.941	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	85.225	ENSCLAG00000009828	TRIT1	100	85.225	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	87.348	ENSCSAG00000001137	TRIT1	100	87.348	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	84.768	ENSCHOG00000000435	TRIT1	100	84.582	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	43.365	ENSCSAVG00000002050	-	92	43.365	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.724	ENSCANG00000043008	TRIT1	100	86.724	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	90.792	ENSCGRG00001001894	Trit1	100	90.792	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	89.588	ENSCGRG00000007059	Trit1	91	89.487	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	61.098	ENSCSEG00000009574	trit1	88	63.107	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	96	60.486	ENSDARG00000032876	trit1	95	66.134	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	75.681	ENSDNOG00000001994	TRIT1	100	75.758	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	96	78.097	ENSDORG00000012449	Trit1	98	78.097	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	87	41.002	FBgn0043799	CG31381	91	40.406	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	87	88.193	ENSETEG00000008733	TRIT1	98	88.193	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	57.246	ENSEBUG00000012845	trit1	92	57.246	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	84.979	ENSECAG00000010597	TRIT1	92	85.263	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	66.385	ENSEEUG00000009269	TRIT1	100	66.316	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	90	56.604	ENSELUG00000017278	trit1	84	57.985	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.326	ENSFCAG00000006029	TRIT1	100	87.794	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	80	76.471	ENSFALG00000000532	TRIT1	94	76.471	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	85.649	ENSFDAG00000003098	TRIT1	97	85.649	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	68	54.489	ENSFHEG00000022274	trit1	96	54.489	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	62.100	ENSGMOG00000006522	trit1	98	62.972	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	99	69.631	ENSGALG00000003851	TRIT1	94	72.374	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	74	61.782	ENSGAFG00000018636	trit1	96	62.286	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	61.927	ENSGACG00000008493	trit1	95	63.221	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	82	77.143	ENSGAGG00000000522	TRIT1	95	77.143	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.437	ENSGGOG00000010070	TRIT1	100	88.437	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	59.267	ENSHBUG00000018999	trit1	92	60.044	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	76.484	ENSHGLG00000009564	-	98	76.419	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	96	85.778	ENSHGLG00000010308	-	97	85.778	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	81	67.368	ENSHGLG00100018159	-	98	67.368	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	86.057	ENSHGLG00100015382	-	99	86.057	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	62.264	ENSHCOG00000006755	trit1	95	52.174	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	64.371	ENSIPUG00000021822	trit1	87	64.371	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.580	ENSSTOG00000006446	TRIT1	97	87.580	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	80.435	ENSJJAG00000000300	-	98	80.435	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	96	83.296	ENSJJAG00000000316	-	99	83.296	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	93	62.273	ENSKMAG00000021788	trit1	90	62.273	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	62.181	ENSLBEG00000024262	trit1	87	63.070	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	90	67.991	ENSLACG00000013861	TRIT1	88	67.991	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	58.246	ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.868	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	86.296	ENSLAFG00000016876	TRIT1	100	86.296	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.580	ENSMFAG00000001316	TRIT1	100	87.580	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.580	ENSMMUG00000016220	TRIT1	100	87.580	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.580	ENSMNEG00000023137	TRIT1	100	87.580	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	99	87.554	ENSMLEG00000035296	TRIT1	99	87.554	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	61.201	ENSMAMG00000005868	trit1	87	62.500	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	58.621	ENSMZEG00005011506	trit1	92	59.382	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	79	75.000	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	75.000	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	91.435	ENSMAUG00000000399	Trit1	100	91.435	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	87.859	ENSMICG00000016294	TRIT1	100	87.580	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	91.649	ENSMOCG00000008173	Trit1	100	91.649	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	88	60.048	ENSMMOG00000021140	trit1	94	60.048	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	93	78.458	ENSMODG00000017650	TRIT1	96	78.458	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	91	60.277	ENSMALG00000017843	trit1	88	61.244	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	97.645	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	100	97.645	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	97.645	ENSMUSG00000028653	Trit1	100	97.645	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	97.645	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	100	97.645	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.248	ENSMPUG00000014291	TRIT1	100	88.248	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	85.808	ENSMLUG00000000334	TRIT1	98	85.808	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.437	ENSNLEG00000012038	TRIT1	100	88.437	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	95	69.144	ENSMEUG00000005217	TRIT1	95	69.144	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	73	70.968	ENSOPRG00000003205	-	73	70.968	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	82.590	ENSODEG00000006117	TRIT1	100	82.590	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	58.422	ENSONIG00000015407	trit1	93	59.170	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	79	77.688	ENSOANG00000002779	TRIT1	99	74.430	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.106	ENSOCUG00000002054	TRIT1	100	88.009	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	93	62.500	ENSORLG00000005802	trit1	95	62.500	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	94	60.793	ENSORLG00020005519	trit1	98	60.793	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	94	60.352	ENSORLG00015018715	trit1	98	60.352	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	95	61.969	ENSOMEG00000006569	trit1	95	62.273	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	86.123	ENSOGAG00000009571	TRIT1	100	85.897	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	86.275	ENSOARG00000020140	TRIT1	98	86.275	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.437	ENSPPAG00000023930	TRIT1	100	88.437	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.326	ENSPPRG00000009680	TRIT1	100	88.009	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	97	88.326	ENSPTIG00000021134	TRIT1	100	88.009	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	88.437	ENSPTRG00000000579	TRIT1	100	88.437	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	87.366	ENSPANG00000018125	TRIT1	100	87.366	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	79	59.946	ENSPKIG00000024527	trit1	95	59.946	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	77	57.895	ENSPSIG00000017073	TRIT1	99	57.895	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	87	60.099	ENSPMGG00000018445	trit1	95	61.675	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	100	92.291	ENSPEMG00000022418	Trit1	100	92.291	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	83	59.148	ENSPMAG00000008892	trit1	100	59.148	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	92	79.587	ENSPCIG00000020666	TRIT1	94	82.927	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	96	59.251	ENSPFOG00000014626	trit1	96	59.251	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	70	63.830	ENSPLAG00000011669	trit1	94	64.375	Poecilia_latipinna
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MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	70	64.242	ENSPREG00000018182	trit1	90	65.409	Poecilia_reticulata
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