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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0028793 (Gene tree)
Gene ID: 110323475
Gene Symbol: Zc3h12a
Alias: Mcpip1
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 12A
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10026 bases
Position: chr6:76186689-76196714
Accession: 110323475
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0079444	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	4.5e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0079445	-	657	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0079444	-	2749	XM_021200720	MGP_PahariEiJ_P0079444	596 (aa)	XP_021056379	UPI000A30C5AF

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	70	57.178	MGP_PahariEiJ_G0015078	Zc3h12c	50	57.178

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	80.801	ENSG00000163874	ZC3H12A	96	85.348	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.543	ENSAPOG00000024328	zc3h12a	97	45.323	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	70	50.361	ENSAPOG00000005848	-	64	50.120	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	64	67.419	ENSAPOG00000001632	-	71	67.419	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	80.303	ENSAMEG00000000991	ZC3H12A	99	80.303	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.177	ENSACIG00000017750	zc3h12a	98	45.425	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	47.735	ENSACIG00000004135	si:dkey-206d17.12	79	66.234	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	41.554	ENSACIG00000006790	-	94	50.323	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	70	50.361	ENSAOCG00000009106	-	64	50.120	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.760	ENSAOCG00000014937	zc3h12a	51	66.769	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	67	61.801	ENSAOCG00000003866	-	92	57.874	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.760	ENSAPEG00000006072	zc3h12a	97	45.760	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	70	50.361	ENSAPEG00000004229	-	64	50.120	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	65	63.844	ENSAPEG00000005727	-	97	48.765	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	93	42.712	ENSATEG00000013053	-	83	59.829	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	47.333	ENSATEG00000006140	si:dkey-206d17.12	87	57.862	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	95	48.718	ENSATEG00000002260	-	90	58.935	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	95	45.696	ENSATEG00000009946	zc3h12a	68	55.531	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	57.517	ENSACAG00000017285	ZC3H12A	94	57.407	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	80.872	ENSANAG00000009908	ZC3H12A	96	84.982	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	95	43.021	ENSACLG00000018534	-	98	42.529	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	44.391	ENSACLG00000027801	zc3h12a	66	54.651	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	46.296	ENSACLG00000004488	si:dkey-206d17.12	90	46.453	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	47.512	ENSAMXG00000001736	zc3h12a	99	47.512	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	41.695	ENSAMXG00000030754	-	54	60.197	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	80.789	ENSBTAG00000011316	ZC3H12A	100	81.132	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.135	ENSCJAG00000041792	ZC3H12A	100	81.469	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	78.902	ENSCAFG00000003304	ZC3H12A	100	79.074	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	78.902	ENSCAFG00020008620	ZC3H12A	100	79.074	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	79.866	ENSCHIG00000021957	ZC3H12A	100	80.789	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	82.304	ENSTSYG00000035959	ZC3H12A	100	82.471	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	82.971	ENSCAPG00000015365	ZC3H12A	100	82.971	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	82.609	ENSCPOG00000011081	ZC3H12A	100	82.609	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.135	ENSCCAG00000023848	ZC3H12A	100	81.469	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.531	ENSCATG00000037700	ZC3H12A	96	85.818	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	80.167	ENSCLAG00000008722	ZC3H12A	100	80.167	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.697	ENSCSAG00000001106	ZC3H12A	100	81.864	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	58.891	ENSCPBG00000018492	ZC3H12A	91	58.497	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.198	ENSCANG00000042287	ZC3H12A	100	81.364	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	87.752	ENSCGRG00001015497	Zc3h12a	100	87.752	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	87.752	ENSCGRG00000013149	Zc3h12a	100	87.752	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	57	63.987	ENSCSEG00000010073	-	81	59.592	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	47.430	ENSCSEG00000010348	si:dkey-206d17.12	89	47.841	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.910	ENSCSEG00000019043	zc3h12a	99	45.151	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	49.742	ENSCVAG00000001516	si:dkey-206d17.12	92	49.315	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	93	45.017	ENSCVAG00000017420	zc3h12a	66	55.663	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	43.169	ENSCVAG00000001077	-	99	43.169	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	50	68.404	ENSDARG00000005271	zc3h12a	80	69.132	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	48.403	ENSDARG00000101034	si:dkey-206d17.12	89	48.305	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	78.559	ENSDNOG00000035006	ZC3H12A	99	78.559	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	98	79.322	ENSDORG00000012666	Zc3h12a	98	80.000	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	82	65.182	ENSETEG00000018311	ZC3H12A	100	65.992	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	81.132	ENSEASG00005012220	ZC3H12A	100	81.304	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	81.411	ENSECAG00000009562	ZC3H12A	94	81.411	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	87	75.676	ENSEEUG00000005907	ZC3H12A	100	77.027	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	45.182	ENSELUG00000018274	zc3h12a	71	56.763	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	46.591	ENSELUG00000007368	si:dkey-206d17.12	94	46.141	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	80.471	ENSFCAG00000008757	ZC3H12A	99	80.640	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	58.696	ENSFALG00000000890	ZC3H12A	97	57.860	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	80.333	ENSFDAG00000006446	ZC3H12A	100	80.500	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	47.157	ENSFHEG00000001174	si:dkey-206d17.12	94	46.678	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	58	64.495	ENSFHEG00000021225	-	85	50.307	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	44.944	ENSFHEG00000001019	zc3h12a	65	55.714	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	82	48.073	ENSGMOG00000017603	si:dkey-206d17.12	95	49.153	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	47.487	ENSGMOG00000007388	-	99	47.834	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	57.635	ENSGALG00000002021	ZC3H12A	88	57.143	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	48.663	ENSGAFG00000019001	si:dkey-206d17.12	93	48.307	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	52	58.544	ENSGAFG00000009523	-	57	58.544	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	43.548	ENSGAFG00000008480	zc3h12a	97	43.274	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	48.070	ENSGACG00000002341	si:dkey-206d17.12	97	47.719	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	49.830	ENSGACG00000013859	zc3h12a	98	49.830	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	57.492	ENSGAGG00000003881	ZC3H12A	91	57.561	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.135	ENSGGOG00000009268	ZC3H12A	100	81.135	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	44.551	ENSHBUG00000009356	zc3h12a	66	54.884	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	46.399	ENSHBUG00000017076	si:dkey-206d17.12	90	45.868	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	95	43.289	ENSHBUG00000021584	-	95	58.964	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	80.000	ENSHGLG00000012808	ZC3H12A	100	80.167	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	79.500	ENSHGLG00100002244	ZC3H12A	100	79.667	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	43.116	ENSHCOG00000004255	si:dkey-206d17.12	92	57.940	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	60	65.886	ENSHCOG00000008878	-	60	52.564	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	43.902	ENSIPUG00000011663	-	99	43.728	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	93	46.231	ENSIPUG00000005852	si:dkey-206d17.12	90	46.231	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	58	69.836	ENSIPUG00000015158	Zc3h12a	98	48.440	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	80.467	ENSSTOG00000026842	ZC3H12A	100	80.467	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	83.806	ENSJJAG00000004252	Zc3h12a	100	84.307	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	42.086	ENSKMAG00000014401	-	70	50.250	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	93	41.693	ENSKMAG00000013650	zc3h12a	98	41.653	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	94	44.914	ENSLBEG00000027429	zc3h12a	68	56.250	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	91	41.065	ENSLBEG00000012121	-	98	40.893	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	62	65.781	ENSLBEG00000012554	-	85	51.974	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	97	43.248	ENSLBEG00000017593	si:dkey-206d17.12	97	44.870	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	59.036	ENSLACG00000017365	ZC3H12A	94	58.864	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	50	63.245	ENSLOCG00000017000	-	63	59.821	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	92	54.286	ENSLOCG00000003232	si:dkey-206d17.12	92	54.118	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	99	79.766	ENSLAFG00000018720	ZC3H12A	99	79.933	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0028793	Zc3h12a	100	81.697	ENSMFAG00000032647	ZC3H12A	100	81.864	Macaca_fascicularis
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