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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0028810 (Gene tree)
Gene ID: 110322815
Gene Symbol: Ago4
Alias: 5730550L01Rik|Eif2c4|argonaute 4
Full Name: protein argonaute-4
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 47758 bases
Position: chr6:77553572-77601329
Accession: 110322815
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0079517	PAZ	PF02170.22	3e-28	1	1
MGP_PahariEiJ_P0079517	Piwi	PF02171.17	3.7e-102	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0079517	-	6684	-	MGP_PahariEiJ_P0079517	861 (aa)	XP_021055264	UPI000A30D1C7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	82.553	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	84.071
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	80.415	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	99	80.415
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	77.960	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	98	77.960

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSG00000134698	AGO4	100	98.490	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	96	94.988	ENSAPOG00000023867	ago4	99	94.988	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.021	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	98.021	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	96.348	ENSACIG00000014548	ago4	100	96.348	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	91.688	ENSAPEG00000022426	ago4	100	91.688	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.080	ENSATEG00000006717	ago4	100	95.031	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	98	97.993	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	97.993	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.076	ENSACAG00000017275	AGO4	99	97.076	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSANAG00000031428	AGO4	100	98.374	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSACLG00000005181	ago4	100	94.966	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSAMXG00000010318	ago4	100	94.966	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.552	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.552	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.490	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	98.363	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.363	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.606	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	98.606	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.363	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	98.363	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	94	94.855	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	94.855	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	96.051	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.051	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.490	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSCATG00000043421	AGO4	100	98.490	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.126	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	98.126	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	98.490	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	80	98.347	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	98.347	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.012	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.012	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.480	ENSCANG00000016914	AGO4	100	98.480	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.839	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	98.839	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.829	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	98.829	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	90.327	ENSCSEG00000010696	ago4	100	90.327	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	96.176	ENSDARG00000100854	ago4	100	96.176	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.258	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	98.258	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.374	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	60	97.444	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.444	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSEASG00005012079	AGO4	100	98.490	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSECAG00000024686	AGO4	100	98.490	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	79	96.820	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	96.820	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.077	ENSELUG00000023873	ago4	100	94.305	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	98.374	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.361	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	98.361	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	97	87.440	ENSFHEG00000019658	ago4	100	87.440	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	96.231	ENSGMOG00000009544	ago4	99	95.693	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.026	ENSGALG00000039713	AGO4	100	98.026	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.737	ENSGAFG00000017239	ago4	100	94.737	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	96.279	ENSGACG00000002683	ago4	99	96.279	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	97.859	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.859	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	95.065	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	95.065	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSHBUG00000001525	ago4	100	94.966	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	98.374	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.471	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.471	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.851	ENSHCOG00000003725	ago4	100	94.851	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	95.000	ENSIPUG00000015600	ago4	100	94.851	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.372	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.372	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.851	ENSKMAG00000018602	ago4	100	94.851	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.432	ENSLBEG00000010670	ago4	100	94.432	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	97.329	ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.329	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.074	ENSLOCG00000000584	ago4	100	95.074	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	93	97.753	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	97.753	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	98.490	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.252	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	97.619	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	98.490	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.478	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	98.478	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSMAMG00000003874	ago4	100	94.966	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSMZEG00005026346	ago4	100	94.966	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.661	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	97.661	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	89	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	96	100.000	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.246	ENSMICG00000033507	AGO4	100	98.246	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.955	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	98.955	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	95.592	ENSMMOG00000013473	ago4	100	95.592	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.142	ENSMODG00000017888	AGO4	100	98.142	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	94.522	ENSMALG00000011797	ago4	100	94.522	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.722	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.722	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.374	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.258	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.258	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	98.363	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	98.363	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.196	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.196	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.361	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	98.361	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSNBRG00000013492	ago4	100	94.966	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.478	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	98.478	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	90	97.538	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	97.538	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	91.218	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	91.218	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	93	98.246	ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.246	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.966	ENSONIG00000013603	ago4	100	94.966	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	97.985	ENSOANG00000002082	AGO4	100	97.985	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.258	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	98.258	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.080	ENSORLG00000009865	ago4	92	95.080	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.080	ENSORLG00020016978	ago4	92	95.080	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.080	ENSORLG00015008800	ago4	92	95.080	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	95.080	ENSOMEG00000006399	ago4	100	95.080	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	93	96.996	ENSOGAG00000004233	-	100	96.996	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	89.779	ENSOGAG00000027107	-	100	89.779	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	97.788	ENSOARG00000019568	AGO4	98	97.788	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.478	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	98.478	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.374	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	98.374	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.361	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	98.361	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.490	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.490	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	98.363	ENSPANG00000007232	AGO4	100	98.363	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.737	ENSPKIG00000022598	ago4	100	94.737	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.012	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	98.012	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	92	96.222	ENSPMGG00000023325	ago4	100	96.222	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	88.065	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.142	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.142	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.851	ENSPFOG00000001935	ago4	100	94.851	Poecilia_formosa
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MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.851	ENSPREG00000010315	ago4	100	94.851	Poecilia_reticulata
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MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.129	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	98.129	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
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