EuRBPDB

Description

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0029450 (Gene tree)
Gene ID: 110324560
Gene Symbol: Twistnb
Alias: 2810024J17Rik|D16Wsu83e
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10474 bases
Position: chr7:31905360-31915833
Accession: 110324560
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0082250	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0082250	-	2330	-	MGP_PahariEiJ_P0082250	329 (aa)	XP_021057879	UPI000A304CC4

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.380	ENSG00000105849	TWISTNB	96	75.380	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	67	51.131	ENSAPOG00000011796	twistnb	54	53.365	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	65.885	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	65.885	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	53.030	ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.787	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	54.187	ENSAOCG00000024200	twistnb	53	54.187	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	54.680	ENSAPEG00000016750	twistnb	53	54.680	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	51	63.905	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	63.905	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.242	ENSANAG00000026418	TWISTNB	97	74.242	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	54.592	ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.628	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	73.433	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	99	72.836	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.227	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	97	75.227	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	70.958	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	95	73.353	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	71.515	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	89	73.939	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	94	73.718	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	99	71.513	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	73.373	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	73.669	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	78.769	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	96	78.769	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.076	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	96	75.684	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.468	ENSCATG00000035621	TWISTNB	96	74.468	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.846	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	75.964	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.772	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	96	74.772	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	76	82.576	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	74	82.576	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	88	61.224	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	86	62.807	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.772	ENSCANG00000038759	TWISTNB	96	74.772	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	81.515	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	81.515	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	72.619	ENSDNOG00000006438	-	99	73.512	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	93	74.757	ENSDORG00000007795	Twistnb	99	74.455	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	77.381	ENSEASG00005021702	TWISTNB	95	77.381	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	77.083	ENSECAG00000014563	TWISTNB	95	77.381	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	91	43.711	ENSELUG00000000098	TWISTNB	82	47.213	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	79.193	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	96	78.882	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	79	49.286	ENSFALG00000009761	TWISTNB	89	51.246	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	76.615	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	96	74.468	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	56.650	ENSFHEG00000013318	twistnb	54	56.650	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	92	57.097	ENSGALG00000010863	TWISTNB	75	56.774	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	76	44.402	ENSGACG00000006425	twistnb	99	44.697	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.380	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	96	75.380	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.778	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	96	77.778	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.778	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	96	77.778	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	51.471	ENSIPUG00000004117	twistnb	51	53.514	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	78.274	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	77.679	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	75.466	ENSJJAG00000015887	Twistnb	96	73.913	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	53	57.471	ENSKMAG00000001591	twistnb	53	55.051	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	90	50.974	ENSLACG00000010508	TWISTNB	87	51.104	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	57	61.905	ENSLOCG00000011399	twistnb	64	57.143	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	76.852	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	75.000	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.772	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	96	74.772	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.772	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	96	74.772	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.164	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	96	74.164	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.772	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	96	74.772	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	78.078	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	78.378	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	97	84.688	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	84.688	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	66	49.537	ENSMMOG00000020085	twistnb	56	49.537	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	85	59.364	ENSMODG00000001402	-	64	59.933	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	91.843	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	92.749	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	93.636	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	93.636	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	94.242	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	94.242	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	76.852	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	74.702	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	90	71.237	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	95	72.241	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	61	88.500	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	88.500	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	54.040	ENSNBRG00000008652	twistnb	52	54.404	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	94	76.527	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	91	76.527	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	69.912	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	98	70.206	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	76.308	ENSODEG00000007222	TWISTNB	96	76.923	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.455	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	96	75.455	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	94	74.277	ENSOARG00000009803	TWISTNB	98	71.726	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.684	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	96	75.380	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	78.261	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	96	78.261	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	87	79.371	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	95	79.371	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.684	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	96	75.684	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.468	ENSPANG00000015736	TWISTNB	96	74.468	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	58.673	ENSPKIG00000025635	twistnb	56	56.931	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	85	57.042	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	88	57.770	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	74.848	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	96	74.545	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.375	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.177	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	70.859	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	95	72.393	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	59	55.670	ENSPNYG00000002674	twistnb	51	55.670	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	96	43.373	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	55.615	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	91.304	ENSRNOG00000010750	Twistnb	100	91.615	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.076	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	95	75.076	Rhinopithecus_bieti
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.076	ENSRROG00000040155	TWISTNB	96	75.076	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	73.636	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	97	74.242	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	50	59.639	ENSSFOG00015012788	twistnb	53	59.639	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	87	42.053	ENSSMAG00000012792	twistnb	78	45.017	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	55.779	ENSSDUG00000007038	twistnb	84	45.260	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	91	50.804	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	93	50.000	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	96	40.896	ENSSPAG00000005871	twistnb	55	52.451	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	97	75.701	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	75.701	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	95	43.082	ENSTNIG00000017778	twistnb	92	43.218	Tetraodon_nigroviridis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	100	74.405	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	98	74.328	Tupaia_belangeri
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	78.086	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	75.893	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	77.778	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	75.595	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	72.121	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	96	74.242	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	77	53.571	ENSXETG00000013443	twistnb	51	52.713	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	56.650	ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.650	Xiphophorus_couchianus