EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0029778 (Gene tree)
Gene ID: 110324358
Gene Symbol: Nrde2
Alias: 6720454P05Rik|BC002230
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34800 bases
Position: chr7:94625768-94660567
Accession: 110324358
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0083213	NRDE-2	PF08424.10	4.2e-104	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0083213	-	3721	XM_021201863	MGP_PahariEiJ_P0083213	1169 (aa)	XP_021057522	UPI000A30D04A

Gene Model

Click here to download MGP_PahariEiJ_G0029778's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_PahariEiJ_G0029778's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.500	ENSG00000119720	NRDE2	100	87.745	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	47.948	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	45.230	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	76.203	ENSAMEG00000001807	NRDE2	99	76.227	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	49.126	ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.498	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	49.206	ENSAOCG00000015576	nrde2	98	45.581	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	49.248	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	45.597	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.506	ENSATEG00000010247	nrde2	88	47.977	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	98	60.069	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	59.600	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	56.139	ENSACAG00000014571	NRDE2	99	56.447	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	77.187	ENSANAG00000025313	NRDE2	99	77.187	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.935	ENSACLG00000025154	nrde2	88	47.259	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	81	64.103	ENSAMXG00000034642	nrde2	91	43.470	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	74.224	ENSBTAG00000005427	NRDE2	99	74.310	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	79.880	ENSCJAG00000017711	NRDE2	99	79.880	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	74.638	ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	73.891	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	77.121	ENSCAFG00020016346	NRDE2	99	76.632	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	73.879	ENSCHIG00000005876	NRDE2	99	73.966	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	76.014	ENSTSYG00000000161	NRDE2	99	75.410	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	81.003	ENSCAPG00000012039	NRDE2	99	81.003	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.759	ENSCPOG00000002428	NRDE2	99	80.759	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	78.762	ENSCCAG00000024917	NRDE2	99	78.762	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.948	ENSCLAG00000015185	NRDE2	99	81.034	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	81.018	ENSCSAG00000011451	NRDE2	99	81.018	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	75	77.047	ENSCHOG00000006165	NRDE2	74	77.093	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	62.906	ENSCPBG00000008537	NRDE2	97	63.068	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.414	ENSCANG00000029067	NRDE2	99	80.414	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	88.851	ENSCGRG00001015658	Nrde2	99	88.765	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	89.801	ENSCGRG00000005062	Nrde2	99	89.801	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	89	47.274	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	48.249	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.672	ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.000	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.485	ENSDARG00000074726	nrde2	88	51.670	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	78.265	ENSDNOG00000024057	NRDE2	99	78.295	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	79	81.838	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.996	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	74	68.915	ENSETEG00000000198	NRDE2	74	68.915	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	40.264	ENSEBUG00000014552	nrde2	87	41.929	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.673	ENSEASG00005020675	NRDE2	99	80.673	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.637	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	80.036	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	67	85.714	ENSEEUG00000004026	-	68	85.950	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.680	ENSELUG00000005973	nrde2	99	48.497	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	77.968	ENSFCAG00000011312	NRDE2	99	77.308	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	59.359	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	58.909	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	81.207	ENSFDAG00000021350	NRDE2	99	81.207	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	46.072	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	45.726	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	63	55.417	ENSGMOG00000015815	nrde2	87	55.819	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	59.291	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	59.079	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	90	47.810	ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.384	ENSGACG00000012619	nrde2	87	49.807	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	62.821	ENSGAGG00000003252	NRDE2	99	62.586	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.328	ENSGGOG00000008835	NRDE2	99	80.328	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.188	ENSHBUG00000016736	nrde2	88	47.353	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	81.622	ENSHGLG00000006731	NRDE2	99	81.622	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	81.722	ENSHGLG00100017736	NRDE2	98	81.722	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	44.120	ENSHCOG00000009559	nrde2	94	43.774	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.142	ENSIPUG00000016129	nrde2	88	46.927	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	81.881	ENSSTOG00000001678	NRDE2	99	81.881	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	82.084	ENSJJAG00000000907	Nrde2	99	82.140	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.860	ENSKMAG00000008647	nrde2	99	45.492	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	89	48.980	ENSLBEG00000021428	nrde2	92	49.424	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	71	60.870	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.662	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	86	56.931	ENSLOCG00000009037	nrde2	85	56.814	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	75.832	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	75.856	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	79	83.731	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	87.255	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.901	ENSMAMG00000013452	nrde2	88	47.940	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.935	ENSMZEG00005008319	nrde2	88	47.259	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	84	62.828	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	62.921	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	89.628	ENSMAUG00000018578	Nrde2	99	89.628	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.414	ENSMICG00000016741	NRDE2	99	80.414	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	86.540	ENSMOCG00000014472	Nrde2	99	86.799	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	73	48.225	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	48.225	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	94	67.286	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	67.286	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	89	46.654	ENSMALG00000021869	nrde2	91	48.047	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	96.024	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	96.024	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	95.431	ENSMUSG00000021179	Nrde2	99	95.517	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	95.769	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	99	95.769	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	74.763	ENSMPUG00000008135	NRDE2	99	73.988	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	79.483	ENSMLUG00000007484	NRDE2	99	79.569	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	84.629	ENSNGAG00000002993	Nrde2	99	84.629	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	49.234	ENSNBRG00000010184	nrde2	97	48.934	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	80.460	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	80.442	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	77	62.542	ENSMEUG00000011097	NRDE2	77	62.373	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	60	83.838	ENSOPRG00000001375	-	60	83.838	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	80.316	ENSODEG00000012422	NRDE2	99	80.316	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	46.020	ENSONIG00000019512	nrde2	99	45.105	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	77.175	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	77.175	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	48.346	ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.717	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.959	ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.335	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.041	ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.417	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	48.131	ENSOMEG00000010890	nrde2	88	47.826	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	79.845	ENSOGAG00000006624	NRDE2	99	79.845	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	72.399	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	72.575	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	97	80.141	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	83.948	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	78.224	ENSPPRG00000006422	NRDE2	99	77.481	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	77.968	ENSPTIG00000009989	NRDE2	99	77.222	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.673	ENSPTRG00000023399	NRDE2	99	80.673	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	46.789	ENSPKIG00000009331	nrde2	88	49.318	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	61.966	ENSPSIG00000005588	NRDE2	99	61.868	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	46.196	ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.453	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	90.431	ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.431	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	54	44.428	ENSPMAG00000003270	-	99	43.685	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	68.182	ENSPCIG00000018567	NRDE2	98	71.260	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.251	ENSPFOG00000013217	nrde2	87	46.908	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.184	ENSPLAG00000022350	nrde2	88	47.125	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.325	ENSPMEG00000000778	nrde2	88	47.363	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	47.584	ENSPREG00000009066	nrde2	88	47.264	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	83	81.386	ENSPPYG00000006245	NRDE2	99	81.386	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	82	89.231	ENSPCAG00000016399	NRDE2	81	90.566	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	94	79.566	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	79.566	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	96	76.393	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	76.393	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	98	45.075	ENSPNYG00000022833	nrde2	93	50.055	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	48.465	ENSPNAG00000015807	nrde2	92	49.608	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	91.509	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	91.509	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	79.551	ENSSBOG00000024346	NRDE2	99	79.551	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	69.039	ENSSHAG00000016736	NRDE2	96	69.132	Sarcophilus_harrisii
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.213	ENSSFOG00015011794	nrde2	87	51.462	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	44.964	ENSSMAG00000011671	nrde2	88	47.378	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.682	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.640	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.936	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	50.110	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	86	65.347	ENSSPUG00000006348	NRDE2	96	65.278	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	87	49.566	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.359	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	80.345	ENSSSCG00000002434	NRDE2	99	80.345	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	98	60.590	ENSTGUG00000012462	-	99	60.123	Taeniopygia_guttata
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	80	48.156	ENSTRUG00000002798	nrde2	96	48.726	Takifugu_rubripes
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	94	76.667	ENSTBEG00000011834	NRDE2	94	76.667	Tupaia_belangeri
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	78.516	ENSTTRG00000013583	NRDE2	99	78.516	Tursiops_truncatus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	96	75.289	ENSUAMG00000004159	NRDE2	99	74.688	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	96	76.000	ENSUMAG00000006393	NRDE2	99	75.223	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	76.526	ENSVVUG00000018202	NRDE2	99	75.809	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	53.385	ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.835	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	90	46.741	ENSXCOG00000013298	nrde2	94	46.757	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.469	ENSXMAG00000009320	nrde2	89	46.922	Xiphophorus_maculatus