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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0031142 (Gene tree)
Gene ID: 110326623
Gene Symbol: Zc3h10
Alias: -
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 10
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5737 bases
Position: chr9:48553852-48559588
Accession: 110326623
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0087503	zf-CCCH	PF00642.24	2.6e-12	1	2
MGP_PahariEiJ_P0087503	zf-CCCH	PF00642.24	2.6e-12	2	2
MGP_PahariEiJ_P0087503	zf-CCCH_2	PF14608.6	5e-09	1	3
MGP_PahariEiJ_P0087503	zf-CCCH_2	PF14608.6	5e-09	2	3
MGP_PahariEiJ_P0087503	zf-CCCH_2	PF14608.6	5e-09	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0087505	-	571	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087504	-	757	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087506	-	995	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087503	-	3678	-	MGP_PahariEiJ_P0087503	435 (aa)	XP_021060848	UPI000A30C4F9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSG00000135482	ZC3H10	100	97.011	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	76.389	ENSAPOG00000013862	zc3h10	75	76.852	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSAMEG00000019365	ZC3H10	100	97.011	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	82	75.926	ENSACIG00000022311	zc3h10	86	76.562	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	76.389	ENSAOCG00000021782	zc3h10	93	61.677	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	76.389	ENSAPEG00000010972	zc3h10	93	61.677	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	73.043	ENSATEG00000024754	zc3h10	68	73.148	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	73.165	ENSACAG00000005020	ZC3H10	95	79.093	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.782	ENSANAG00000004774	ZC3H10	100	96.782	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	82	76.562	ENSACLG00000001913	zc3h10	86	47.826	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	85	72.174	ENSAMXG00000000266	zc3h10	60	76.744	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.552	ENSBTAG00000009542	ZC3H10	100	96.552	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSCJAG00000045638	ZC3H10	100	97.241	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.092	ENSCAFG00000000104	ZC3H10	100	96.092	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.092	ENSCAFG00020025996	ZC3H10	100	96.092	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.782	ENSCHIG00000003359	ZC3H10	100	96.782	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.701	ENSTSYG00000014379	ZC3H10	100	97.701	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	92	95.990	ENSCAPG00000002936	ZC3H10	100	95.990	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.552	ENSCPOG00000032639	ZC3H10	100	96.552	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.552	ENSCCAG00000020214	-	100	96.552	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSCATG00000012691	ZC3H10	100	97.241	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSCLAG00000011346	ZC3H10	100	97.241	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSCSAG00000018893	ZC3H10	100	97.241	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	72.874	ENSCPBG00000012828	ZC3H10	100	73.563	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSCANG00000007357	ZC3H10	100	97.241	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.701	ENSCGRG00001004310	Zc3h10	100	97.701	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.701	ENSCGRG00000015981	Zc3h10	100	97.701	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	91	71.918	ENSCSEG00000003687	zc3h10	86	46.502	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	75.397	ENSCVAG00000001548	zc3h10	86	46.778	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	75.000	ENSDARG00000030335	zc3h10	87	77.519	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSDNOG00000040571	ZC3H10	100	97.241	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.552	ENSDORG00000001081	Zc3h10	100	96.552	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSEASG00005003533	ZC3H10	100	97.011	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSECAG00000013003	ZC3H10	100	97.241	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSFDAG00000012558	ZC3H10	100	97.011	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	74.219	ENSFHEG00000021836	zc3h10	94	64.935	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	72.936	ENSGALG00000037941	ZC3H10	100	73.624	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	75.000	ENSGAFG00000002137	zc3h10	81	46.751	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	88	76.984	ENSGACG00000000638	zc3h10	90	66.334	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	73.103	ENSGAGG00000020590	ZC3H10	100	73.793	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.782	ENSGGOG00000039636	ZC3H10	100	96.782	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSHGLG00000015956	ZC3H10	100	97.011	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSHGLG00100013005	ZC3H10	100	97.011	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	74.419	ENSHCOG00000020331	zc3h10	99	46.170	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	91	59.290	ENSIPUG00000001697	zc3h10	85	74.419	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.782	ENSSTOG00000007753	ZC3H10	100	96.782	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.092	ENSJJAG00000001726	Zc3h10	100	96.092	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	75.969	ENSKMAG00000017905	zc3h10	85	46.555	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	79	77.344	ENSLBEG00000018281	zc3h10	59	77.344	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	65.604	ENSLACG00000002390	ZC3H10	100	64.237	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.092	ENSLAFG00000014817	ZC3H10	100	96.092	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSMFAG00000027256	ZC3H10	100	97.241	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSMMUG00000021084	ZC3H10	100	97.241	Macaca_mulatta
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MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSMLEG00000027930	ZC3H10	100	97.241	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	81	76.190	ENSMAMG00000003284	zc3h10	61	77.315	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.471	ENSMAUG00000008505	Zc3h10	100	97.471	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSMOCG00000019869	Zc3h10	100	97.011	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	83	74.627	ENSMMOG00000021874	zc3h10	86	48.033	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	85	76.498	ENSMALG00000016443	zc3h10	85	46.694	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	99.770	MGP_CAROLIEiJ_G0015942	Zc3h10	100	99.770	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	99.540	ENSMUSG00000039810	Zc3h10	100	99.540	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	99.540	MGP_SPRETEiJ_G0016767	Zc3h10	100	99.540	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	96.552	ENSMPUG00000018496	ZC3H10	100	96.552	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	92.414	ENSMLUG00000006564	ZC3H10	100	92.644	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.471	ENSNGAG00000011848	Zc3h10	100	97.471	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	79	76.852	ENSNBRG00000020931	zc3h10	86	47.727	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	87.185	ENSMEUG00000001222	ZC3H10	100	88.558	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSODEG00000007942	ZC3H10	100	97.011	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	65.924	ENSONIG00000019154	zc3h10	90	66.830	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	95.642	ENSOCUG00000017349	ZC3H10	100	95.642	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	72.609	ENSORLG00000014596	zc3h10	87	46.347	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	72.174	ENSORLG00020000559	zc3h10	87	46.138	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	97	44.618	ENSORLG00015014077	zc3h10	87	46.347	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	90	72.174	ENSOMEG00000023135	zc3h10	87	46.555	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	95.632	ENSOGAG00000030676	ZC3H10	100	95.632	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	93.793	ENSOARG00000010330	ZC3H10	100	93.793	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSPPAG00000023790	ZC3H10	100	97.011	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSPTIG00000006237	ZC3H10	100	97.241	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.011	ENSPTRG00000005078	ZC3H10	100	97.011	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.241	ENSPANG00000029620	ZC3H10	100	97.241	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	84	76.429	ENSPKIG00000007158	zc3h10	84	47.314	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	86	70.161	ENSPSIG00000000811	ZC3H10	87	70.161	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	94	67.056	ENSPMGG00000010570	zc3h10	92	64.563	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	97.471	ENSPEMG00000008278	Zc3h10	100	97.471	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	86.073	ENSPCIG00000007018	ZC3H10	100	88.356	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	74.219	ENSPFOG00000006164	zc3h10	85	46.392	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	89	74.219	ENSPLAG00000001248	zc3h10	85	46.392	Poecilia_latipinna
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MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	100	95.862	ENSPVAG00000007566	ZC3H10	100	95.862	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	79	76.562	ENSPNYG00000021193	zc3h10	86	47.826	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0031142	Zc3h10	76	79.703	ENSPNAG00000013796	zc3h10	57	77.500	Pygocentrus_nattereri
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