EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0031194 (Gene tree)
Gene ID: 110326608
Gene Symbol: Mars
Alias: MetRS|methionine tRNA ligase|methionyl-tRNA synthetase
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15080 bases
Position: chr9:49786400-49801479
Accession: 110326608
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0087657	tRNA-synt_1g	PF09334.11	8.8e-147	1	1
MGP_PahariEiJ_P0087658	tRNA-synt_1g	PF09334.11	9e-147	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0087657	-	2941	XM_021205168	MGP_PahariEiJ_P0087657	902 (aa)	XP_021060827	UPI000A30D97F
MGP_PahariEiJ_T0087659	-	3064	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087658	-	2964	XM_021205167	MGP_PahariEiJ_P0087658	910 (aa)	XP_021060826	UPI000A30856B
MGP_PahariEiJ_T0087660	-	575	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087661	-	623	-	MGP_PahariEiJ_P0087661	183 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087662	-	467	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_PahariEiJ_G0031194's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_PahariEiJ_G0031194's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSG00000166986	MARS	100	90.244	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.419	ENSAPOG00000020238	mars	100	63.272	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.909	ENSAMEG00000004962	MARS	100	90.909	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	63.656	ENSACIG00000016271	mars	100	66.846	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.419	ENSAOCG00000011411	mars	100	63.164	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.297	ENSAPEG00000008610	mars	100	63.055	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.054	ENSATEG00000025019	mars	100	62.162	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	93	70.375	ENSAPLG00000014821	MARS	100	71.145	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	66.704	ENSACAG00000006698	MARS	99	66.704	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.408	ENSANAG00000027589	MARS	100	90.408	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.907	ENSACLG00000018937	mars	100	62.473	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	63.402	ENSAMXG00000017335	mars	100	61.910	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.911	ENSBTAG00000018405	MARS	100	89.911	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	72	54.463	WBGene00003415	mars-1	89	57.947	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.911	ENSCJAG00000007249	MARS	100	89.911	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSCAFG00000000229	MARS	100	90.466	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSCAFG00020023661	MARS	100	90.466	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.135	ENSCHIG00000027023	MARS	100	89.135	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.468	ENSTSYG00000005193	MARS	100	89.468	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	83	82.299	ENSCAPG00000014448	MARS	99	82.299	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	88.914	ENSCPOG00000012866	MARS	100	88.914	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.769	ENSCCAG00000032206	MARS	100	90.769	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.220	ENSCATG00000038907	MARS	100	90.220	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	97	89.749	ENSCLAG00000012164	MARS	99	89.726	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.317	ENSCSAG00000004852	MARS	100	89.317	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	66.740	ENSCPBG00000017136	MARS	100	67.143	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	72	60.742	ENSCING00000018550	-	99	60.593	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	63	63.222	ENSCSAVG00000006145	-	98	63.047	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.608	ENSCANG00000034583	MARS	100	90.608	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	92.527	ENSCGRG00001019238	Mars	100	92.527	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	92.527	ENSCGRG00000017321	Mars	100	92.527	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.979	ENSCSEG00000010816	mars	99	63.417	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.555	ENSCVAG00000009314	mars	99	62.664	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	63.210	ENSDARG00000034396	mars	97	63.210	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	88.462	ENSDNOG00000017502	MARS	100	88.462	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.468	ENSDORG00000007127	Mars	100	89.468	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	98	48.886	FBgn0034401	MetRS	82	50.346	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	59	87.873	ENSETEG00000007106	MARS	100	87.873	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	61	59.818	ENSEBUG00000010439	mars	88	59.818	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.000	ENSEASG00005007208	MARS	100	90.000	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.000	ENSECAG00000015175	MARS	100	90.000	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	89	88.350	ENSEEUG00000015503	MARS	89	88.350	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.297	ENSELUG00000010453	mars	100	62.760	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	91.131	ENSFCAG00000002083	MARS	100	91.131	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	87.802	ENSFDAG00000010217	MARS	100	87.802	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.391	ENSFHEG00000016374	mars	100	62.826	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.868	ENSGMOG00000007987	mars	100	61.758	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	92	67.594	ENSGALG00000039315	MARS	95	65.398	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.651	ENSGAFG00000013461	mars	100	62.541	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.473	ENSGACG00000006474	mars	100	62.364	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	96	70.447	ENSGAGG00000011640	MARS	97	70.857	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSGGOG00000001982	MARS	100	90.244	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	91	69.805	ENSHBUG00000009575	mars	95	69.805	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	76.292	ENSHGLG00000019739	-	96	75.843	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.659	ENSHGLG00000013493	MARS	100	90.659	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.659	ENSHGLG00100006885	MARS	100	90.659	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	74.944	ENSHGLG00100004906	-	96	74.494	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.147	ENSHCOG00000001090	mars	100	61.147	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	65	72.137	ENSIPUG00000024413	mars	96	72.137	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	91	64.450	ENSIPUG00000024410	mars	98	64.329	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.812	ENSSTOG00000001128	MARS	100	89.590	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	91.131	ENSJJAG00000018827	Mars	100	91.131	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.771	ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.446	ENSLBEG00000013609	mars	100	62.649	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	68.969	ENSLACG00000018854	MARS	100	68.969	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	87.929	ENSLAFG00000013525	MARS	100	87.929	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.687	ENSMFAG00000010123	MARS	100	90.687	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.909	ENSMMUG00000011277	MARS	100	90.909	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.282	ENSMNEG00000044464	MARS	100	89.282	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	89	91.489	ENSMLEG00000034638	MARS	100	91.489	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	96	63.830	ENSMAMG00000010012	mars	97	64.004	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.690	ENSMZEG00005007092	mars	100	62.256	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.579	ENSMAUG00000011482	Mars	100	89.579	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSMICG00000032056	MARS	100	90.244	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	93.126	ENSMOCG00000010941	Mars	100	93.126	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	61.952	ENSMMOG00000007461	mars	99	61.513	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.065	ENSMALG00000010005	mars	99	63.538	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	97.143	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	97.143	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	97.473	ENSMUSG00000040354	Mars	100	97.473	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	97.473	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	97.473	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.022	ENSMPUG00000001831	MARS	100	90.022	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.246	ENSMLUG00000001037	MARS	100	89.246	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	91.907	ENSNGAG00000018824	Mars	100	91.907	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	65.046	ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.355	ENSNLEG00000017297	MARS	100	90.355	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	89	81.390	ENSMEUG00000007195	MARS	100	81.463	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	87.029	ENSOPRG00000006518	MARS	100	87.029	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.022	ENSODEG00000001752	MARS	100	90.022	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.165	ENSONIG00000005090	mars	100	61.869	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	73	76.471	ENSOANG00000013318	MARS	100	76.551	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.687	ENSOCUG00000007373	MARS	100	90.687	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.065	ENSORLG00000005405	mars	100	62.174	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.133	ENSORLG00020017397	mars	100	62.242	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.283	ENSORLG00015012976	mars	100	62.391	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.371	ENSOMEG00000018411	mars	100	61.806	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	88.987	ENSOGAG00000005226	MARS	100	88.987	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	89.135	ENSOARG00000006477	MARS	100	89.135	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	88.901	ENSPPAG00000025147	MARS	100	88.901	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	91.131	ENSPPRG00000023243	MARS	100	91.131	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	91.020	ENSPTIG00000006721	MARS	100	91.020	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSPTRG00000005135	MARS	100	90.244	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.549	ENSPANG00000009140	MARS	100	90.549	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	63.100	ENSPKIG00000002833	mars	100	63.100	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	70	49.137	ENSPSIG00000013607	MARS	100	45.819	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.413	ENSPMGG00000014847	mars	99	61.396	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	92.747	ENSPEMG00000000046	Mars	100	92.747	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	81.689	ENSPCIG00000023765	MARS	100	81.689	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.404	ENSPFOG00000006998	mars	100	62.514	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.186	ENSPLAG00000017870	mars	100	62.404	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.295	ENSPMEG00000008197	mars	100	62.404	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.295	ENSPREG00000008123	mars	100	62.295	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.355	ENSPPYG00000004691	MARS	100	90.355	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	96	80.578	ENSPCAG00000016037	MARS	100	80.578	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.466	ENSPCOG00000017598	MARS	100	90.466	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	82	84.810	ENSPVAG00000012112	MARS	82	84.810	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.690	ENSPNYG00000013809	mars	100	62.256	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	63.557	ENSPNAG00000017290	mars	100	63.666	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	96.231	ENSRNOG00000025459	Mars	100	96.231	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	88.641	ENSRBIG00000044782	MARS	99	88.641	Rhinopithecus_bieti
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.287	ENSRROG00000042331	MARS	100	90.287	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	63	52.113	YGR264C	MES1	75	52.205	Saccharomyces_cerevisiae
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	87.154	ENSSBOG00000022875	MARS	100	87.154	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	82.965	ENSSHAG00000007182	MARS	100	82.965	Sarcophilus_harrisii
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.035	ENSSFOG00015011038	mars	99	62.212	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.297	ENSSMAG00000012409	mars	92	71.870	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	62.189	ENSSDUG00000019070	mars	100	62.405	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	92	64.005	ENSSLDG00000005561	mars	96	63.766	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	92	88.913	ENSSARG00000002477	MARS	92	88.913	Sorex_araneus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	87	75.676	ENSSPUG00000007756	MARS	100	70.178	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.771	ENSSPAG00000022691	mars	100	63.124	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.355	ENSSSCG00000023318	MARS	95	90.355	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	61.547	ENSTRUG00000014774	mars	100	61.900	Takifugu_rubripes
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	60.470	ENSTNIG00000007060	mars	100	60.707	Tetraodon_nigroviridis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	75	84.706	ENSTBEG00000000303	MARS	88	84.706	Tupaia_belangeri
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	79	91.667	ENSTTRG00000013088	MARS	79	91.667	Tursiops_truncatus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	51	90.929	ENSUAMG00000019284	-	94	90.929	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.798	ENSUMAG00000019826	MARS	100	90.798	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	64	95.425	ENSVPAG00000008665	MARS	66	95.425	Vicugna_pacos
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	90.244	ENSVVUG00000017940	MARS	100	90.244	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	68	74.716	ENSXETG00000025174	mars	100	74.797	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.295	ENSXCOG00000013878	mars	100	62.514	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	62.514	ENSXMAG00000017920	mars	100	62.732	Xiphophorus_maculatus