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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0031273 (Gene tree)
Gene ID: 110326501
Gene Symbol: Zfc3h1
Alias: Ccdc131|Psrc2
Full Name: zinc finger%2C C3H1-type containing
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 49708 bases
Position: chr9:61011379-61061086
Accession: 2446143
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0087895	zf-C3H1	PF10650.9	4.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0087897	-	419	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087896	-	1551	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087895	-	6982	-	MGP_PahariEiJ_P0087895	1991 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0087898	-	679	-	-	- (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.721	ENSG00000133858	ZFC3H1	100	88.837	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.232	ENSAMEG00000000498	ZFC3H1	99	89.182	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	92	45.309	ENSACIG00000015672	ZFC3H1	92	47.105	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	48.434	ENSAOCG00000022567	ZFC3H1	91	47.283	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	98	48.852	ENSATEG00000015391	ZFC3H1	90	47.861	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	89	70.729	ENSAPLG00000016116	ZFC3H1	99	70.546	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	65.675	ENSACAG00000007327	ZFC3H1	96	66.753	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.271	ENSANAG00000038329	ZFC3H1	99	88.673	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	94	48.197	ENSACLG00000021274	ZFC3H1	86	47.183	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	95	45.092	ENSAMXG00000042831	-	95	46.658	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.471	ENSBTAG00000012267	ZFC3H1	99	89.122	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.421	ENSCJAG00000001384	ZFC3H1	99	88.822	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.209	ENSCAFG00000000453	ZFC3H1	96	89.578	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.159	ENSCAFG00020016502	ZFC3H1	96	89.578	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.671	ENSCHIG00000020097	ZFC3H1	99	89.222	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.042	ENSTSYG00000005471	ZFC3H1	96	88.588	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	85.444	ENSCPOG00000009504	ZFC3H1	99	84.945	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.271	ENSCCAG00000035967	ZFC3H1	99	88.822	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.471	ENSCATG00000016321	ZFC3H1	99	89.022	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.531	ENSCLAG00000007646	ZFC3H1	99	88.778	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.321	ENSCSAG00000004100	ZFC3H1	99	88.872	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	70.357	ENSCPBG00000013449	ZFC3H1	91	73.516	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.471	ENSCANG00000030229	ZFC3H1	99	89.022	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.191	ENSCGRG00001011660	Zfc3h1	99	88.440	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	89	93.677	ENSCGRG00000006894	Zfc3h1	99	93.677	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	92	39.643	ENSCSEG00000021462	ZFC3H1	95	40.211	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	83	48.100	ENSCVAG00000019629	-	75	47.498	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.573	ENSDNOG00000010314	ZFC3H1	99	88.523	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	84	38.095	ENSEBUG00000003491	-	62	38.290	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.259	ENSEASG00005008229	ZFC3H1	99	88.273	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.309	ENSECAG00000026833	ZFC3H1	99	88.323	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	45.100	ENSELUG00000013421	-	73	50.526	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.571	ENSFCAG00000024198	ZFC3H1	99	89.521	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	68.342	ENSFALG00000010320	ZFC3H1	95	70.374	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.027	ENSFDAG00000017503	ZFC3H1	99	88.828	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	86	48.267	ENSGMOG00000004527	-	85	47.425	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	69.143	ENSGALG00000010177	ZFC3H1	96	71.369	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	67	46.308	ENSGAFG00000013283	-	99	46.483	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	45.535	ENSGACG00000007651	ZFC3H1	96	45.929	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	69.960	ENSGAGG00000013798	ZFC3H1	96	73.368	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.371	ENSGGOG00000025994	ZFC3H1	99	88.972	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.983	ENSHGLG00000014297	ZFC3H1	99	88.784	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.833	ENSHGLG00100006263	ZFC3H1	99	88.634	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	90.120	ENSSTOG00000002650	ZFC3H1	99	90.070	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	91	46.937	ENSKMAG00000021476	-	75	46.559	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	73	49.032	ENSLBEG00000012352	-	81	54.701	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	94	60.136	ENSLACG00000002585	ZFC3H1	95	60.432	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	55.792	ENSLOCG00000016238	ZFC3H1	98	55.692	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	89	90.202	ENSLAFG00000005820	ZFC3H1	100	88.318	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.571	ENSMFAG00000039403	ZFC3H1	99	89.122	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.571	ENSMMUG00000020943	ZFC3H1	99	89.122	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSMNEG00000008807	ZFC3H1	99	89.072	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.471	ENSMLEG00000029967	ZFC3H1	99	89.022	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	50.092	ENSMAMG00000021320	ZFC3H1	88	49.753	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	89	71.667	ENSMGAG00000010716	ZFC3H1	100	72.040	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.271	ENSMICG00000009137	ZFC3H1	99	88.822	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	78.220	ENSMODG00000020408	ZFC3H1	95	79.160	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	95.357	MGP_CAROLIEiJ_G0015814	Zfc3h1	99	95.357	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	95.557	ENSMUSG00000034163	Zfc3h1	99	95.557	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	95.607	MGP_SPRETEiJ_G0016636	Zfc3h1	99	95.607	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.571	ENSMPUG00000017488	ZFC3H1	99	89.471	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	100	85.351	ENSMLUG00000011723	ZFC3H1	99	85.304	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.967	ENSNGAG00000017623	Zfc3h1	99	88.268	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.122	ENSNLEG00000004372	ZFC3H1	99	88.523	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	76	84.938	ENSOPRG00000008075	ZFC3H1	77	84.938	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	52	46.175	ENSONIG00000018271	ZFC3H1	99	46.382	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.772	ENSOCUG00000004591	ZFC3H1	99	88.772	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	94	45.517	ENSORLG00000000155	-	87	45.766	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	94	45.517	ENSORLG00015020699	-	86	45.766	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	94	45.800	ENSOMEG00000015403	-	82	45.681	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.185	ENSOGAG00000033606	ZFC3H1	99	87.737	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.471	ENSOARG00000014589	ZFC3H1	99	89.072	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSPPAG00000029409	ZFC3H1	99	89.072	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSPPRG00000010196	ZFC3H1	99	89.471	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSPTIG00000006898	ZFC3H1	99	89.471	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.571	ENSPTRG00000005224	ZFC3H1	99	89.122	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	87.375	ENSPANG00000009558	ZFC3H1	99	86.776	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	49.976	ENSPKIG00000023219	ZFC3H1	96	50.972	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	70.259	ENSPSIG00000012997	ZFC3H1	99	75.216	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	44.532	ENSPMGG00000007504	ZFC3H1	98	43.239	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	78.027	ENSPCIG00000025066	ZFC3H1	99	78.632	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	45.583	ENSPFOG00000001903	-	92	46.597	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	78	46.662	ENSPLAG00000015995	-	90	47.892	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	88	44.830	ENSPMEG00000007517	-	95	42.382	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	92	45.203	ENSPREG00000016974	ZFC3H1	94	46.877	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSPPYG00000004773	ZFC3H1	99	89.072	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	79	83.404	ENSPCAG00000003723	ZFC3H1	90	81.981	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.972	ENSPCOG00000019879	ZFC3H1	99	88.523	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	95	87.054	ENSPVAG00000012354	ZFC3H1	95	87.054	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	48.320	ENSPNYG00000005977	ZFC3H1	85	47.196	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	68	47.388	ENSPNAG00000017704	-	97	45.781	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	85.745	ENSRNOG00000053060	Zfc3h1	100	85.261	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	87.076	ENSRBIG00000028462	ZFC3H1	99	86.205	Rhinopithecus_bieti
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	89.521	ENSRROG00000040039	ZFC3H1	99	89.072	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.124	ENSSBOG00000032676	ZFC3H1	99	87.475	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	92	50.835	ENSSFOG00015018112	ZFC3H1	95	51.632	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	78	48.054	ENSSMAG00000019783	ZFC3H1	91	47.447	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	98	48.949	ENSSDUG00000000244	ZFC3H1	91	48.649	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	87	48.211	ENSSLDG00000018408	ZFC3H1	92	48.578	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	79	89.552	ENSSARG00000008639	ZFC3H1	82	89.552	Sorex_araneus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	82	47.176	ENSSPAG00000001916	-	68	48.071	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	99	88.972	ENSSSCG00000000509	ZFC3H1	99	89.943	Sus_scrofa
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MGP_PahariEiJ_G0031273	Zfc3h1	93	46.972	ENSXMAG00000006933	-	91	46.411	Xiphophorus_maculatus