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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0031787 (Gene tree)
Gene ID: 110313639
Gene Symbol: Zc3h12b
Alias: A130028J20Rik|LOC245523
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 12B
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 188968 bases
Position: chrX:82288577-82477544
Accession: 110313639
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0089789	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	8e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0089789	-	2819	-	MGP_PahariEiJ_P0089789	835 (aa)	XP_021043748	UPI000A307D4B
MGP_PahariEiJ_T0089788	-	1911	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0089790	-	6904	-	MGP_PahariEiJ_P0089790	114 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	51.986	MGP_PahariEiJ_G0015078	Zc3h12c	93	51.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.845	ENSG00000102053	ZC3H12B	100	89.845	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	70.513	ENSAPOG00000001738	zc3h12b	99	66.667	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	76	89.432	ENSAMEG00000006955	ZC3H12B	100	89.432	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	66.824	ENSACIG00000009787	zc3h12b	99	67.337	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	72	55.734	ENSACIG00000005689	-	73	68.398	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	93	69.434	ENSAOCG00000010094	zc3h12b	99	66.433	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	93	69.560	ENSAPEG00000007479	zc3h12b	99	66.550	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.308	ENSATEG00000011175	zc3h12b	99	65.731	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	72.835	ENSACAG00000013582	ZC3H12B	100	73.609	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.845	ENSANAG00000010296	ZC3H12B	100	89.845	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.389	ENSACLG00000007669	zc3h12b	99	65.771	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	90	49.736	ENSAMXG00000005320	-	99	43.046	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	65.655	ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	63.918	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	87.799	ENSBTAG00000002206	ZC3H12B	99	87.799	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.606	ENSCJAG00000001427	ZC3H12B	100	89.606	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	87.694	ENSCAFG00000031307	ZC3H12B	100	87.694	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	87.694	ENSCAFG00020017995	ZC3H12B	100	87.694	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	70	89.286	ENSCHIG00000011723	ZC3H12B	98	89.286	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.725	ENSTSYG00000011302	ZC3H12B	100	89.725	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	73	84.779	ENSCAPG00000000650	ZC3H12B	100	84.779	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.725	ENSCCAG00000030171	ZC3H12B	100	89.725	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.964	ENSCATG00000044845	ZC3H12B	100	89.964	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	88.982	ENSCLAG00000003600	ZC3H12B	100	88.982	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	75.768	ENSCPBG00000006983	ZC3H12B	100	76.596	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.725	ENSCANG00000006746	ZC3H12B	100	89.725	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	95.090	ENSCGRG00001018643	Zc3h12b	100	95.090	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	95.090	ENSCGRG00000015623	Zc3h12b	100	95.090	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	70.000	ENSCSEG00000013686	zc3h12b	99	66.429	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.698	ENSCVAG00000010473	zc3h12b	99	66.200	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	65.721	ENSDARG00000062463	zc3h12b	96	66.255	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	82.177	ENSDNOG00000038439	ZC3H12B	100	83.254	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	90.442	ENSDORG00000024832	Zc3h12b	100	90.442	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	70.979	ENSETEG00000012095	ZC3H12B	100	70.979	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	85.919	ENSEASG00005006995	ZC3H12B	100	85.919	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	90.215	ENSECAG00000020993	ZC3H12B	100	90.215	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	57	90.984	ENSEEUG00000007148	-	54	90.984	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	66.705	ENSELUG00000010689	zc3h12b	88	67.013	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	87.081	ENSFCAG00000032299	ZC3H12B	99	87.081	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.222	ENSFDAG00000014258	ZC3H12B	100	89.222	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	70.077	ENSFHEG00000002391	zc3h12b	99	65.814	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	52	63.957	ENSFHEG00000014717	-	62	69.620	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	74.970	ENSGALG00000039391	ZC3H12B	100	75.887	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	69.338	ENSGAFG00000006871	zc3h12b	99	64.672	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	51	72.258	ENSGAFG00000004701	-	58	63.255	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	64.508	ENSGACG00000020334	zc3h12b	99	61.853	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	75.561	ENSGAGG00000005569	ZC3H12B	100	76.478	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.486	ENSGGOG00000024638	ZC3H12B	100	89.486	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.505	ENSHBUG00000000645	zc3h12b	99	65.888	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.222	ENSHGLG00000003107	ZC3H12B	100	89.222	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.222	ENSHGLG00100010721	ZC3H12B	100	89.222	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.444	ENSHCOG00000008487	zc3h12b	99	65.444	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	65.483	ENSIPUG00000016745	zc3h12b	86	64.478	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	89	47.306	ENSIPUG00000014830	-	87	48.249	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	91.029	ENSSTOG00000020962	ZC3H12B	100	91.029	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.102	ENSJJAG00000015755	Zc3h12b	100	89.102	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	64.836	ENSKMAG00000004921	zc3h12b	99	65.380	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	93	69.849	ENSLBEG00000006448	zc3h12b	99	66.822	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	70.657	ENSLACG00000014526	ZC3H12B	100	71.009	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	98	50.000	ENSLOCG00000010717	-	92	50.631	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	71.344	ENSLOCG00000014631	zc3h12b	87	71.344	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	87.589	ENSLAFG00000014891	ZC3H12B	100	87.589	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.725	ENSMFAG00000042237	ZC3H12B	100	89.725	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.845	ENSMMUG00000012261	ZC3H12B	100	89.845	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.845	ENSMNEG00000043003	ZC3H12B	100	89.845	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.964	ENSMLEG00000042630	ZC3H12B	100	89.964	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	66.005	ENSMAMG00000011770	zc3h12b	99	66.550	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.389	ENSMZEG00005007548	zc3h12b	99	65.771	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	74.675	ENSMGAG00000000759	ZC3H12B	99	75.474	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	94.970	ENSMAUG00000017800	Zc3h12b	100	94.970	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.247	ENSMICG00000010697	ZC3H12B	100	89.247	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	94.371	ENSMOCG00000000094	Zc3h12b	100	94.371	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	93	70.127	ENSMMOG00000008734	zc3h12b	99	67.696	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	72.295	ENSMODG00000005206	ZC3H12B	99	72.295	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	62	65.517	ENSMALG00000016807	-	85	56.164	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	63.925	ENSMALG00000021153	zc3h12b	99	63.925	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	98.683	ENSMUSG00000035045	Zc3h12b	100	98.683	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	98.683	MGP_SPRETEiJ_G0034413	Zc3h12b	100	98.683	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	87.336	ENSMPUG00000001162	ZC3H12B	100	87.336	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	88.448	ENSMLUG00000013635	ZC3H12B	100	88.448	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.621	ENSNBRG00000014889	zc3h12b	99	66.005	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.606	ENSNLEG00000000383	ZC3H12B	100	89.606	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	68.106	ENSMEUG00000014075	ZC3H12B	100	68.106	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	93	68.805	ENSONIG00000012867	zc3h12b	99	66.118	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	90.670	ENSOCUG00000006130	ZC3H12B	100	90.670	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	54	67.988	ENSORLG00000009188	-	56	71.475	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	66.232	ENSORLG00000009556	zc3h12b	99	66.232	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	67	67.988	ENSORLG00020019033	-	82	67.949	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.614	ENSORLG00020021793	zc3h12b	99	65.614	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	63	68.000	ENSORLG00015020619	-	87	67.949	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.731	ENSORLG00015004818	zc3h12b	99	65.731	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	64	75.172	ENSOMEG00000018642	-	73	75.172	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	99	65.731	ENSOMEG00000005768	zc3h12b	99	65.922	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	88.889	ENSOGAG00000029439	ZC3H12B	100	88.889	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	87.814	ENSOARG00000004959	ZC3H12B	100	87.814	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	100	89.725	ENSPPAG00000039530	ZC3H12B	100	89.725	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	81	85.125	ENSPPRG00000004966	-	98	85.125	Panthera_pardus
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