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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0032023 (Gene tree)
Gene ID: 110313652
Gene Symbol: Apex2
Alias: Ape2|C430040P13Rik
Full Name: apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 59638 bases
Position: chrX:128519118-128578755
Accession: 110313652
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0090598	Exo_endo_phos	PF03372.23	3.8e-18	1	1
MGP_PahariEiJ_P0090601	Exo_endo_phos	PF03372.23	3.8e-18	1	1
MGP_PahariEiJ_P0090602	Exo_endo_phos	PF03372.23	1.2e-16	1	1
MGP_PahariEiJ_P0090593	Exo_endo_phos	PF03372.23	3.6e-14	1	1
MGP_PahariEiJ_P0090605	Exo_endo_phos	PF03372.23	4.4e-14	1	1
MGP_PahariEiJ_P0090604	Exo_endo_phos	PF03372.23	1.3e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0090604	-	795	-	MGP_PahariEiJ_P0090604	264 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0090605	-	965	-	MGP_PahariEiJ_P0090605	245 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0090602	-	1858	XM_021188105	MGP_PahariEiJ_P0090602	523 (aa)	XP_021043764	UPI000A306C35
MGP_PahariEiJ_T0090603	-	750	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0090600	-	366	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0090601	-	1890	-	MGP_PahariEiJ_P0090601	516 (aa)	XP_021043765	UPI000A3068F8
MGP_PahariEiJ_T0090598	-	4755	-	MGP_PahariEiJ_P0090598	516 (aa)	XP_021043765	UPI000A3068F8
MGP_PahariEiJ_T0090599	-	2606	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0090593	-	1555	-	MGP_PahariEiJ_P0090593	226 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.785	ENSG00000169188	APEX2	100	79.344	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	63.636	ENSAPOG00000005805	apex2	99	47.276	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSAMEG00000003608	APEX2	100	78.571	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	61.611	ENSACIG00000010000	apex2	99	46.154	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	63.158	ENSAOCG00000021774	apex2	99	47.100	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	63.158	ENSAPEG00000020890	apex2	93	46.924	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	60.664	ENSATEG00000023600	apex2	99	45.955	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	58.333	ENSACAG00000011201	APEX2	99	51.744	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	80.282	ENSANAG00000020845	-	100	69.522	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.793	ENSANAG00000021907	-	100	78.764	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	61.836	ENSAMXG00000007422	apex2	99	44.894	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.263	ENSBTAG00000013177	APEX2	100	79.884	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.263	ENSCJAG00000016584	APEX2	100	79.344	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	78.113	ENSCAFG00000014310	APEX2	100	77.413	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSCAFG00020013818	APEX2	100	78.764	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.854	ENSCHIG00000019916	APEX2	100	79.884	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.732	ENSTSYG00000005612	APEX2	100	79.576	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	83.568	ENSCPOG00000007265	APEX2	100	73.308	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	86	82.051	ENSCCAG00000025405	-	99	66.600	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.854	ENSCATG00000044854	APEX2	100	78.764	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	86.321	ENSCLAG00000017315	APEX2	100	76.255	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.854	ENSCSAG00000012124	APEX2	100	78.958	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	53.759	ENSCPBG00000016631	APEX2	99	47.665	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	99	45.552	ENSCSAVG00000006052	-	99	39.962	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.385	ENSCANG00000003053	APEX2	100	78.764	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	88.975	ENSCGRG00001008132	Apex2	100	88.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	88.975	ENSCGRG00000009667	Apex2	100	88.975	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	61.611	ENSCSEG00000019900	apex2	98	46.690	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	52.330	ENSCVAG00000021583	apex2	99	44.138	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	54.122	ENSDARG00000008472	apex2	99	46.303	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	85.446	ENSDNOG00000038901	APEX2	100	75.869	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.792	ENSDORG00000024412	-	98	85.022	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	99	49.064	ENSEBUG00000015654	apex2	99	43.822	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.318	ENSEASG00005011694	APEX2	91	79.537	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.318	ENSECAG00000026921	APEX2	91	79.537	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	83.099	ENSEEUG00000013172	APEX2	100	72.394	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	62.736	ENSELUG00000021417	apex2	99	44.108	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	85.446	ENSFCAG00000021990	APEX2	100	75.676	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.385	ENSFDAG00000008076	APEX2	94	84.685	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	41.993	ENSFHEG00000021411	apex2	99	42.246	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	88	55.779	ENSGMOG00000019681	apex2	89	55.500	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	59.903	ENSGAFG00000005829	apex2	99	44.386	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	83	61.170	ENSGACG00000012307	apex2	81	60.417	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	49.020	ENSGAGG00000011520	APEX2	85	47.817	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.785	ENSGGOG00000002056	APEX2	100	79.151	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	62.085	ENSHBUG00000009938	apex2	99	47.339	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	84.507	ENSHGLG00000000273	APEX2	99	78.049	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	83.099	ENSHGLG00100006734	-	100	83.099	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	55.805	ENSHCOG00000010165	apex2	99	48.134	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	63.285	ENSHCOG00000018521	-	100	63.285	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	52.518	ENSIPUG00000000352	APEX2	99	45.085	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	90.141	ENSSTOG00000025121	APEX2	99	84.082	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.679	ENSJJAG00000019611	Apex2	100	81.431	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	64.734	ENSKMAG00000006985	apex2	99	49.554	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	60.377	ENSLBEG00000012139	apex2	99	45.927	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	99	43.894	ENSLACG00000000865	APEX2	99	43.894	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	54.225	ENSLOCG00000014467	apex2	99	46.988	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSLAFG00000018312	APEX2	100	77.220	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSMFAG00000002486	APEX2	100	78.958	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSMMUG00000008428	APEX2	100	78.571	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSMNEG00000036783	APEX2	100	78.958	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	86.854	ENSMLEG00000028208	APEX2	100	78.764	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	60.190	ENSMAMG00000024220	apex2	99	44.388	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	62.085	ENSMZEG00005026322	apex2	99	47.339	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	83	94.681	ENSMAUG00000016924	-	100	94.681	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	75.483	ENSMICG00000043181	APEX2	100	75.483	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	88.201	ENSMOCG00000004339	Apex2	100	89.168	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	63.507	ENSMMOG00000017340	apex2	99	45.345	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	69.194	ENSMODG00000005341	APEX2	99	56.641	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	58.852	ENSMALG00000014179	apex2	99	44.501	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	98.485	MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	98.485	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	98.106	ENSMUSG00000025269	Apex2	100	97.132	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	98.485	MGP_SPRETEiJ_G0034654	Apex2	100	98.485	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	79.245	ENSMPUG00000003293	APEX2	100	77.563	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	83.568	ENSMLUG00000004562	-	100	72.587	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	84.977	ENSMLUG00000016298	-	100	74.517	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	92.488	ENSNGAG00000013576	Apex2	100	82.592	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	62.085	ENSNBRG00000010099	apex2	99	46.528	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	88.318	ENSNLEG00000032067	-	100	81.955	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	84.038	ENSODEG00000003095	-	100	84.038	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	56.226	ENSONIG00000016881	apex2	99	49.812	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	70	77.215	ENSOANG00000000689	-	95	53.638	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	85.915	ENSOCUG00000000570	APEX2	100	66.031	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	62.319	ENSORLG00000014053	apex2	99	47.500	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	61.353	ENSORLG00020013253	apex2	99	46.786	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	61.836	ENSORLG00015007515	apex2	99	47.679	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	92	61.836	ENSOMEG00000003655	apex2	99	45.536	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	78.113	ENSOGAG00000007797	APEX2	99	77.821	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	81.132	ENSOARG00000005742	APEX2	100	80.077	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.793	ENSPPAG00000035747	APEX2	100	78.958	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	85.915	ENSPPRG00000002440	APEX2	100	75.676	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	84.977	ENSPTIG00000021651	APEX2	100	75.290	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.850	ENSPTRG00000021946	APEX2	100	79.151	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	94	87.324	ENSPANG00000003595	APEX2	100	78.958	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	61.611	ENSPKIG00000007752	apex2	99	46.479	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	58.768	ENSPMGG00000009151	apex2	99	43.816	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	89.168	ENSPEMG00000016475	Apex2	100	89.168	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	68.246	ENSPCIG00000007633	APEX2	98	55.969	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	60.190	ENSPFOG00000000408	apex2	99	45.263	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	60.190	ENSPLAG00000023814	apex2	99	45.263	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	93	59.716	ENSPMEG00000023222	apex2	99	45.088	Poecilia_mexicana
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