EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0016717 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Mars
Alias: MetRS|methionine tRNA ligase|methionyl-tRNA synthetase
Full Name: methionine-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15084 bases
Position: chr10:128461184-128476267
Accession: 1345633
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0026282	tRNA-synt_1g	PF09334.11	8.8e-147	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0026283	tRNA-synt_1g	PF09334.11	8.9e-147	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0026287	-	561	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0026286	-	467	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0026285	-	621	-	MGP_SPRETEiJ_P0026285	183 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0026284	-	3065	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0026283	-	2962	-	MGP_SPRETEiJ_P0026283	910 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0026282	-	2939	-	MGP_SPRETEiJ_P0026282	902 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0016717's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0016717's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSG00000166986	MARS	100	89.579	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.595	ENSAPOG00000020238	mars	100	63.124	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.690	ENSAMEG00000004962	MARS	100	89.690	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.865	ENSACIG00000016271	mars	100	66.442	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.567	ENSAOCG00000011411	mars	100	63.124	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.446	ENSAPEG00000008610	mars	100	63.015	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.270	ENSATEG00000025019	mars	100	62.121	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	93	70.843	ENSAPLG00000014821	MARS	100	70.877	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	66.740	ENSACAG00000006698	MARS	99	66.556	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.746	ENSANAG00000027589	MARS	100	89.746	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.124	ENSACLG00000018937	mars	100	63.015	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.724	ENSAMXG00000017335	mars	100	61.910	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.246	ENSBTAG00000018405	MARS	100	89.246	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	73	54.098	WBGene00003415	mars-1	89	57.781	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.246	ENSCJAG00000007249	MARS	100	89.246	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSCAFG00000000229	MARS	100	89.800	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSCAFG00020023661	MARS	100	89.800	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.914	ENSCHIG00000027023	MARS	100	88.914	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.914	ENSTSYG00000005193	MARS	100	88.914	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	83	81.110	ENSCAPG00000014448	MARS	99	81.110	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	87.694	ENSCPOG00000012866	MARS	100	87.694	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.890	ENSCCAG00000032206	MARS	100	89.890	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.341	ENSCATG00000038907	MARS	100	89.341	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	97	89.522	ENSCLAG00000012164	MARS	99	89.498	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.436	ENSCSAG00000004852	MARS	100	88.436	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	66.740	ENSCPBG00000017136	MARS	100	66.740	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	72	60.742	ENSCING00000018550	-	96	62.287	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	63	63.222	ENSCSAVG00000006145	-	98	63.047	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.724	ENSCANG00000034583	MARS	100	89.724	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	91.978	ENSCGRG00001019238	Mars	100	91.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	91.978	ENSCGRG00000017321	Mars	100	91.978	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.348	ENSCSEG00000010816	mars	99	63.537	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.664	ENSCVAG00000009314	mars	99	62.664	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	63.537	ENSDARG00000034396	mars	97	63.319	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.022	ENSDNOG00000017502	MARS	100	88.022	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.581	ENSDORG00000007127	Mars	100	88.581	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	98	48.998	FBgn0034401	MetRS	82	50.346	Drosophila_melanogaster
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	59	87.127	ENSETEG00000007106	MARS	100	87.127	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	70	53.968	ENSEBUG00000010439	mars	88	59.273	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.451	ENSEASG00005007208	MARS	100	89.451	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.451	ENSECAG00000015175	MARS	100	89.451	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	89	86.408	ENSEEUG00000015503	MARS	89	86.408	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.649	ENSELUG00000010453	mars	100	62.649	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.355	ENSFCAG00000002083	MARS	100	90.355	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	86.813	ENSFDAG00000010217	MARS	100	86.813	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.690	ENSFHEG00000016374	mars	100	63.341	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.758	ENSGMOG00000007987	mars	100	61.648	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	92	67.793	ENSGALG00000039315	MARS	95	65.874	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.651	ENSGAFG00000013461	mars	100	62.377	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.364	ENSGACG00000006474	mars	100	62.364	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	96	70.561	ENSGAGG00000011640	MARS	97	70.561	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSGGOG00000001982	MARS	100	89.579	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	91	70.130	ENSHBUG00000009575	mars	95	70.130	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.560	ENSHGLG00000013493	MARS	100	89.560	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	75.730	ENSHGLG00000019739	-	96	75.843	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.560	ENSHGLG00100006885	MARS	100	89.560	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	74.607	ENSHGLG00100004906	-	96	74.719	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.430	ENSHCOG00000001090	mars	100	61.213	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	66	71.547	ENSIPUG00000024413	mars	99	71.880	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	91	64.571	ENSIPUG00000024410	mars	98	64.407	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.037	ENSSTOG00000001128	MARS	100	88.815	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.022	ENSJJAG00000018827	Mars	100	90.022	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.095	ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.339	ENSLBEG00000013609	mars	100	62.975	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	69.298	ENSLACG00000018854	MARS	100	69.121	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	87.265	ENSLAFG00000013525	MARS	100	87.265	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.800	ENSMFAG00000010123	MARS	100	89.800	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.022	ENSMMUG00000011277	MARS	100	90.022	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.398	ENSMNEG00000044464	MARS	100	88.398	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	89	90.578	ENSMLEG00000034638	MARS	100	90.578	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	96	63.892	ENSMAMG00000010012	mars	97	63.892	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.907	ENSMZEG00005007092	mars	100	62.798	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.914	ENSMAUG00000011482	Mars	100	88.914	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.690	ENSMICG00000032056	MARS	100	89.690	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	92.350	ENSMOCG00000010941	Mars	100	92.350	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.130	ENSMMOG00000007461	mars	99	62.130	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.957	ENSMALG00000010005	mars	99	63.418	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	98.681	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	98.681	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	99.451	ENSMUSG00000040354	Mars	100	99.451	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	97.473	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	97.473	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.024	ENSMPUG00000001831	MARS	100	89.024	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.803	ENSMLUG00000001037	MARS	100	88.803	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	91.131	ENSNGAG00000018824	Mars	100	91.131	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	92	64.783	ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.133	ENSNLEG00000017297	MARS	100	90.133	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	89	81.017	ENSMEUG00000007195	MARS	100	80.685	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	86.031	ENSOPRG00000006518	MARS	100	86.031	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.024	ENSODEG00000001752	MARS	100	89.024	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.379	ENSONIG00000005090	mars	100	62.191	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	73	76.018	ENSOANG00000013318	MARS	100	75.566	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.911	ENSOCUG00000007373	MARS	100	89.911	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.806	ENSORLG00000005405	mars	100	62.133	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.024	ENSORLG00020017397	mars	100	62.350	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.024	ENSORLG00015012976	mars	100	62.350	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.672	ENSOMEG00000018411	mars	100	61.915	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.326	ENSOGAG00000005226	MARS	100	87.665	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.914	ENSOARG00000006477	MARS	100	88.914	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	88.242	ENSPPAG00000025147	MARS	100	88.242	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.355	ENSPPRG00000023243	MARS	100	90.355	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	90.244	ENSPTIG00000006721	MARS	100	90.244	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSPTRG00000005135	MARS	100	89.579	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.670	ENSPANG00000009140	MARS	100	89.670	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.210	ENSPKIG00000002833	mars	100	63.210	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	70	49.137	ENSPSIG00000013607	MARS	100	45.528	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	61.614	ENSPMGG00000014847	mars	99	61.287	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	92.527	ENSPEMG00000000046	Mars	100	92.527	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	81.579	ENSPCIG00000023765	MARS	100	81.250	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.514	ENSPFOG00000006998	mars	100	62.623	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.295	ENSPLAG00000017870	mars	100	62.514	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.404	ENSPMEG00000008197	mars	100	62.514	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.514	ENSPREG00000008123	mars	100	62.514	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSPPYG00000004691	MARS	100	89.579	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	89	87.179	ENSPCAG00000016037	MARS	100	80.000	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.800	ENSPCOG00000017598	MARS	100	89.800	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	82	83.562	ENSPVAG00000012112	MARS	82	83.562	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.907	ENSPNYG00000013809	mars	100	62.798	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.557	ENSPNAG00000017290	mars	100	63.626	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	95.344	ENSRNOG00000025459	Mars	100	95.344	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	87.528	ENSRBIG00000044782	MARS	99	87.528	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.183	ENSRROG00000042331	MARS	100	89.183	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	63	51.499	YGR264C	MES1	75	51.499	Saccharomyces_cerevisiae
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	86.489	ENSSBOG00000022875	MARS	100	86.489	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	82.522	ENSSHAG00000007182	MARS	100	82.412	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.144	ENSSFOG00015011038	mars	99	62.322	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.662	ENSSMAG00000012409	mars	92	72.334	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	62.662	ENSSDUG00000019070	mars	100	62.839	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	92	64.405	ENSSLDG00000005561	mars	96	64.124	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	92	88.273	ENSSARG00000002477	MARS	92	88.273	Sorex_araneus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	87	75.676	ENSSPUG00000007756	MARS	99	72.549	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.135	ENSSPAG00000022691	mars	100	63.557	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.357	ENSSSCG00000023318	MARS	95	89.357	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.009	ENSTRUG00000014774	mars	100	62.009	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	60.560	ENSTNIG00000007060	mars	100	60.884	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	75	82.353	ENSTBEG00000000303	MARS	87	82.927	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	79	91.667	ENSTTRG00000013088	MARS	78	91.667	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	51	89.201	ENSUAMG00000019284	-	94	89.201	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.579	ENSUMAG00000019826	MARS	100	89.579	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	64	94.771	ENSVPAG00000008665	MARS	66	94.771	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	89.357	ENSVVUG00000017940	MARS	100	89.357	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	68	74.878	ENSXETG00000025174	mars	100	74.959	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.404	ENSXCOG00000013878	mars	100	62.623	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	62.623	ENSXMAG00000017920	mars	100	62.842	Xiphophorus_maculatus