EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0016987 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Papolg
Alias: 9630006B20Rik
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34773 bases
Position: chr11:21385832-21420604
Accession: 2442119
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0027252	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	1	2
MGP_SPRETEiJ_P0027252	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	2	2
MGP_SPRETEiJ_P0027255	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.9e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0027255	-	2180	-	MGP_SPRETEiJ_P0027255	429 (aa)	-	UPI00000EA5DF
MGP_SPRETEiJ_T0027254	-	1882	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0027253	-	1641	-	MGP_SPRETEiJ_P0027253	255 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0027252	-	3746	-	MGP_SPRETEiJ_P0027252	739 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0027251	-	803	-	MGP_SPRETEiJ_P0027251	206 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0016987's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0016987's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	95	78.973	MGP_SPRETEiJ_G0028966	Papolb	86	68.240
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	81.884	MGP_SPRETEiJ_G0018943	Papola	98	61.088

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.676	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.059	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.038	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSACIG00000010546	papolg	99	70.580	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.703	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.836	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.324	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.573	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	88.263	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.431	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	81	63.816	ENSACAG00000015048	-	100	63.816	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	93.792	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.428	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.916	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.642	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.332	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.062	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.086	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.173	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.197	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	94.332	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	89	91.842	ENSCAPG00000014901	-	99	91.842	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.730	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.197	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	91	98.268	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.268	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.007	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	93.927	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	89	91.806	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.806	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	94	68.719	ENSCING00000024664	-	94	64.554	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	94	68.719	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.062	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	99.287	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	96.170	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	99.287	ENSCGRG00000005552	-	100	96.170	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.479	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSCVAG00000016602	papolg	92	82.917	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.150	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.810	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	95.093	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	92.973	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.533	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	73.442	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.378	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	75	84.291	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.018	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	90	59.173	ENSEBUG00000005042	-	81	57.082	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	94.467	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	94.038	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	82.568	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.568	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.247	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.426	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.332	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	79.953	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.160	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.602	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	66	61.850	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.941	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSGMOG00000018772	papolg	92	83.032	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.981	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.400	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.385	ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.092	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	93.927	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.428	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.059	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.851	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.277	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.620	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.105	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.588	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.386	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.007	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	99.299	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.651	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.396	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.077	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	77.176	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.733	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.383	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.132	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	98.372	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.197	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.197	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	85.121	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.255	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	93.792	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.270	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.196	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	84.615	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.494	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	99.762	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	96.443	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.737	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	99.534	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	97.023	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.385	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.979	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	95.294	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.747	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.713	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	100	100.000	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	100.000	ENSMUSG00000020273	Papolg	100	100.000	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	99.534	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	98.512	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.332	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	97.882	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	92.402	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.399	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	73.286	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.624	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSNLEG00000009507	-	99	99.065	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	66	98.551	ENSMEUG00000013605	-	88	78.082	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.332	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	95.059	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.059	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	75.878	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.596	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	95.261	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	84.987	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.547	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.748	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.277	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.981	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.596	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.981	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.277	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.915	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.907	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	58	87.442	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.442	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.197	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.522	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.332	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.197	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.522	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	91.860	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	89.771	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	84.615	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.781	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.781	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.800	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	91.686	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.331	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	99.762	ENSPEMG00000008960	-	100	96.170	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	95	67.241	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	65.105	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.957	Petromyzon_marinus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	96.028	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.467	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.841	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSPLAG00000018445	papolg	89	70.263	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSPMEG00000003961	papolg	89	70.565	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.915	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.908	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.657	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	93.839	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.361	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	90	99.485	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	83.941	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.065	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.073	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.854	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.541	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.294	ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.825	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	99.767	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	97.294	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	89.252	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.124	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.062	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.792	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	90	97.656	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.252	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	78.220	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.420	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	84.038	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.213	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.781	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.408	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.198	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.596	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	90.824	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	77.867	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	ENSSPAG00000009004	papolg	99	69.865	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.332	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	96	81.356	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.340	Taeniopygia_guttata
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.699	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	77.598	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.744	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	92.891	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	86.531	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	98.832	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	89.204	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.270	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	99.762	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.270	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	93.602	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.476	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.927	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.047	ENSXETG00000002208	papolg	100	73.342	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	86.158	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.371	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	83.095	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	Xiphophorus_maculatus