EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0017404 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Naa38
Alias: 1500034E06Rik|Lsmd1
Full Name: N(alpha)-acetyltransferase 38%2C NatC auxiliary subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1196 bases
Position: chr11:69278348-69279543
Accession: 1925554
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0028916	LSM	PF01423.22	7.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0028915	-	343	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0028917	-	534	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0028916	-	672	-	MGP_SPRETEiJ_P0028916	125 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0028918	-	404	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0017404's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0017404's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSG00000183011	NAA38	100	95.890	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	74	74.194	ENSAPOG00000005647	naa38	80	75.556	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	99	80.645	ENSAMEG00000016995	NAA38	55	94.681	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	55	81.159	ENSACIG00000019730	naa38	90	81.159	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	69.697	ENSAOCG00000023811	naa38	80	75.556	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	69.697	ENSAPEG00000006441	naa38	80	75.556	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	76.404	ENSATEG00000001072	naa38	82	76.404	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	91	73.684	ENSACAG00000004477	NAA38	76	80.851	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.148	ENSANAG00000027273	NAA38	100	88.148	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSACLG00000009549	naa38	80	74.444	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	86	69.444	ENSAMXG00000037469	naa38	77	83.951	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.238	ENSBTAG00000014695	NAA38	100	95.238	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	64	30.000	WBGene00021682	Y48G1C.9	76	30.000	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.148	ENSCJAG00000014843	NAA38	100	88.148	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	91	74.400	ENSCAFG00000032682	-	73	74.400	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	91	74.400	ENSCAFG00020007495	-	73	74.400	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.238	ENSCHIG00000023618	NAA38	100	95.238	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSTSYG00000033326	NAA38	100	96.000	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSCPOG00000032412	NAA38	100	96.000	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.148	ENSCCAG00000021358	NAA38	100	88.148	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSCATG00000032806	NAA38	100	95.200	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	ENSCLAG00000015879	NAA38	100	96.800	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSCSAG00000011136	NAA38	100	95.200	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	92.233	ENSCHOG00000009659	NAA38	76	94.681	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSCANG00000038998	NAA38	95	93.617	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	ENSCGRG00001016403	Naa38	100	96.800	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	73	74.468	ENSCSEG00000004480	naa38	92	74.468	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	70.000	ENSCVAG00000007301	naa38	83	78.889	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	63	83.544	ENSDARG00000099122	naa38	72	83.544	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	72	95.556	ENSDNOG00000040664	-	100	95.556	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSDORG00000010169	Naa38	100	95.200	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	66	44.578	FBgn0051950	CG31950	64	44.578	Drosophila_melanogaster
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	59	70.270	ENSEBUG00000002518	naa38	69	70.270	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	93.204	ENSEASG00005019355	NAA38	54	95.745	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	94.488	ENSECAG00000037837	NAA38	100	94.488	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	66	82.927	ENSELUG00000019427	naa38	71	82.927	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	91.262	ENSFCAG00000026713	NAA38	95	94.681	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	94.400	ENSFDAG00000012656	NAA38	100	94.400	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	76	75.789	ENSFHEG00000017032	naa38	83	77.778	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	72	73.626	ENSGMOG00000013571	naa38	95	74.157	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	77	63.542	ENSGALG00000054037	-	79	74.684	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	66	73.171	ENSGALG00000052672	-	84	73.171	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSGAFG00000004021	naa38	81	78.409	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	66.364	ENSGACG00000019273	naa38	81	77.273	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	58	75.309	ENSGAGG00000002550	NAA38	100	75.309	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSGGOG00000015317	-	95	93.617	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSHBUG00000019918	naa38	80	74.444	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	94.400	ENSHGLG00000014324	NAA38	100	94.400	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	94.400	ENSHGLG00100013112	NAA38	100	94.400	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	71.910	ENSHCOG00000010193	naa38	75	71.910	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	74	73.913	ENSIPUG00000021657	naa38	85	76.136	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSSTOG00000025950	NAA38	100	96.000	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	58	94.521	ENSJJAG00000013236	Naa38	100	94.521	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	98	63.415	ENSKMAG00000019461	naa38	95	63.415	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	64.545	ENSLBEG00000028489	naa38	80	75.581	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	73	73.626	ENSLACG00000007757	NAA38	89	72.043	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	89	67.568	ENSLOCG00000013981	naa38	76	78.161	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	94.400	ENSLAFG00000009169	NAA38	100	94.400	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSMFAG00000037580	NAA38	95	93.617	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSMMUG00000008178	NAA38	100	95.200	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSMNEG00000031597	NAA38	95	93.617	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSMLEG00000037461	NAA38	95	93.617	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	66.364	ENSMAMG00000000538	naa38	77	77.273	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSMZEG00005021265	naa38	80	74.444	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	60	74.667	ENSMGAG00000017259	NAA38	93	74.667	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	ENSMAUG00000020052	Naa38	100	96.800	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	92.233	ENSMICG00000015147	NAA38	95	94.681	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	ENSMOCG00000002129	Naa38	100	96.800	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	69	79.070	ENSMMOG00000012705	naa38	76	79.070	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	85.714	ENSMODG00000007434	NAA38	100	88.095	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	76	72.917	ENSMALG00000001438	naa38	77	76.744	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	99.200	MGP_CAROLIEiJ_G0016568	Naa38	100	99.200	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	99.200	ENSMUSG00000059278	Naa38	100	99.200	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	MGP_PahariEiJ_G0017699	Naa38	100	96.800	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSMPUG00000008886	NAA38	100	96.000	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSNGAG00000019042	Naa38	100	95.200	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSNBRG00000000619	naa38	80	74.444	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	87.407	ENSNLEG00000027601	NAA38	95	92.553	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	82.828	ENSMEUG00000015533	NAA38	55	86.316	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	95	79.339	ENSOPRG00000008383	NAA38	57	93.617	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSODEG00000017702	NAA38	100	96.000	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSONIG00000009306	naa38	80	74.444	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSOCUG00000017284	NAA38	100	96.000	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSORLG00000007119	naa38	89	62.185	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSORLG00020008335	naa38	89	62.185	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	73	74.725	ENSORLG00015005138	naa38	82	74.725	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	73.469	ENSOMEG00000013718	naa38	83	75.269	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	84	91.429	ENSOGAG00000030727	NAA38	53	94.681	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSPPAG00000026097	NAA38	95	93.617	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	92.233	ENSPPRG00000012023	NAA38	55	94.681	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	87.407	ENSPTRG00000008712	NAA38	95	92.553	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	88.462	ENSPANG00000023935	NAA38	95	93.617	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	90	66.071	ENSPMGG00000008216	naa38	77	77.907	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.800	ENSPEMG00000015014	Naa38	100	96.800	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	62	71.795	ENSPMAG00000006001	naa38	78	71.795	Petromyzon_marinus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSPFOG00000012670	naa38	83	76.667	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSPLAG00000002707	naa38	83	76.667	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	66.667	ENSPMEG00000016652	naa38	87	76.667	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	86	68.182	ENSPREG00000011017	naa38	59	78.161	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	94.898	ENSPCAG00000013613	NAA38	55	94.681	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	89	85.586	ENSPCOG00000020844	NAA38	95	94.681	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	92.233	ENSPVAG00000016342	NAA38	54	94.681	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	65	80.247	ENSPNYG00000021415	naa38	80	74.444	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	72.165	ENSPNAG00000020828	naa38	85	78.409	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	98.400	ENSRNOG00000009823	Naa38	100	98.400	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	80	93.000	ENSRBIG00000039054	NAA38	95	93.617	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	80	93.000	ENSRROG00000037370	NAA38	95	93.617	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	92.857	ENSSBOG00000035591	NAA38	55	92.553	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	70	80.682	ENSSFOG00015023111	naa38	80	80.682	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	55	81.159	ENSSMAG00000006429	naa38	90	81.159	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSSDUG00000005842	naa38	79	77.273	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	88	67.273	ENSSLDG00000003013	naa38	79	77.273	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	72.662	ENSSARG00000006299	NAA38	55	92.553	Sorex_araneus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	82.653	ENSSPUG00000014761	NAA38	96	81.915	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	69.697	ENSSPAG00000013671	naa38	80	75.556	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSSSCG00000017971	NAA38	100	95.200	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	76	73.958	ENSTRUG00000021566	naa38	81	75.824	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	55	81.159	ENSTNIG00000012999	naa38	95	81.159	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	91.262	ENSTBEG00000011092	NAA38	53	93.617	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	96.000	ENSUAMG00000005463	NAA38	100	96.000	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	82	92.233	ENSUMAG00000017042	NAA38	50	94.681	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	78	93.878	ENSVPAG00000005503	NAA38	57	93.617	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	95.200	ENSVVUG00000028004	NAA38	100	95.200	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	100	67.200	ENSXETG00000015633	naa38	100	58.400	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	71	76.404	ENSXCOG00000000768	naa38	75	76.404	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0017404	Naa38	70	78.409	ENSXMAG00000028369	naa38	81	78.409	Xiphophorus_maculatus