EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0018159 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Ftsj3
Alias: C79843|D11Ertd400e|Epcs3
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3 (E. coli)
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6897 bases
Position: chr11:108258967-108265863
Accession: 1860295
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0031983	FtsJ	PF01728.19	1.4e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0031984	-	569	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0031985	-	590	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0031986	-	543	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0031987	-	672	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0031983	-	3132	-	MGP_SPRETEiJ_P0031983	837 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0031988	-	677	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0018159's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0018159's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.930	ENSG00000108592	FTSJ3	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	72	70.000	ENSAPOG00000005543	ftsj3	86	69.176	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.872	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	98	88.285	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	59.743	ENSAOCG00000023196	ftsj3	96	61.905	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	59.743	ENSAPEG00000004250	ftsj3	97	62.012	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	92	59.897	ENSATEG00000010069	ftsj3	96	59.688	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	92	60.931	ENSAPLG00000010362	-	98	61.061	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	88	63.648	ENSACAG00000017930	FTSJ3	98	64.372	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.424	ENSANAG00000033774	FTSJ3	98	88.150	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	84	70.225	ENSACLG00000019137	ftsj3	97	70.225	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.520	ENSAMXG00000021571	ftsj3	94	61.786	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	89.104	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	98	89.225	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	41.076	WBGene00019168	H06I04.3	100	41.009	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.820	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	98	87.304	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	86.564	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	98	86.957	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.500	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	98	87.908	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.848	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	98	88.485	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	95	81.000	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	97	81.449	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	71	81.048	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	82	97.717	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.490	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	98	86.490	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.441	ENSCCAG00000023533	-	97	90.341	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	85.954	ENSCATG00000018510	FTSJ3	98	86.194	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.015	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.015	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	86.240	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	98	86.265	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	68.772	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	90	83.246	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	58	57.980	ENSCSAVG00000003607	-	97	41.317	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.883	ENSCANG00000042921	FTSJ3	98	86.747	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	91.636	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	98	91.758	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	91.636	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	98	91.758	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	59.814	ENSCSEG00000013468	ftsj3	96	60.237	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.322	ENSCVAG00000007484	ftsj3	97	63.114	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.611	ENSDARG00000104938	ftsj3	97	62.127	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	83.294	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	98	83.933	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	90.459	ENSDORG00000004200	Ftsj3	98	90.700	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	40.302	FBgn0030720	CG8939	98	39.699	Drosophila_melanogaster
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	83.137	ENSETEG00000019228	FTSJ3	98	83.313	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	51.732	ENSEBUG00000007828	ftsj3	97	51.267	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	88.005	ENSEASG00005013565	FTSJ3	98	88.299	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.420	ENSECAG00000011995	FTSJ3	98	88.540	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.118	ENSELUG00000013501	ftsj3	95	59.668	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	86.651	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	98	86.667	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	68.810	ENSFALG00000013635	FTSJ3	99	69.762	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.257	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	98	87.864	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.692	ENSFHEG00000007639	ftsj3	97	63.473	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	51	71.396	ENSGMOG00000017184	ftsj3	100	71.167	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	69.581	ENSGALG00000032993	FTSJ3	99	69.976	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	51	73.068	ENSGACG00000009841	ftsj3	100	73.068	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	70.903	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	99	71.755	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.470	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	98	87.470	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.249	ENSHBUG00000022331	ftsj3	96	62.515	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.350	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	98	88.228	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	88.378	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	98	88.228	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.820	ENSHCOG00000018770	ftsj3	96	62.172	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.900	ENSIPUG00000024942	ftsj3	94	61.695	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.575	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	98	88.164	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.242	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	98	88.364	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.396	ENSKMAG00000021997	ftsj3	96	62.724	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.786	ENSLBEG00000027142	ftsj3	96	61.429	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	82	48.599	ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.296	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.515	ENSLOCG00000008979	ftsj3	98	63.114	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	85.850	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	98	85.870	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.161	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	98	86.402	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	82.147	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	98	81.415	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	85.817	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	98	86.178	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.779	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	98	86.795	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.381	ENSMZEG00005001992	ftsj3	96	62.665	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	67	72.968	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	99	65.162	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	91.283	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	98	91.283	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.862	ENSMICG00000045996	FTSJ3	98	89.225	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	92.115	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	98	91.990	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	66	62.390	ENSMMOG00000019522	ftsj3	89	59.739	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	78.690	ENSMODG00000009901	FTSJ3	98	78.019	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	98.805	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	98.805	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	99.165	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	100	99.165	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	98.093	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	100	98.093	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.411	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	98	86.578	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.976	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	98	88.271	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	91.315	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	98	91.404	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	85	70.588	ENSNBRG00000017453	ftsj3	97	70.787	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	87.455	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	98	87.545	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	71.864	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	98	73.398	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	85.971	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	98	85.612	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.857	ENSODEG00000008167	FTSJ3	98	87.515	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	62.278	ENSONIG00000001654	ftsj3	96	62.590	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	85.850	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	98	85.109	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.773	ENSORLG00000005910	ftsj3	96	61.842	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	75	72.545	ENSORLG00020021255	ftsj3	89	71.591	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	59.007	ENSORLG00015018416	ftsj3	96	61.474	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.439	ENSOMEG00000014432	ftsj3	88	71.429	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	88.228	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	98	87.802	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.848	ENSOARG00000013637	FTSJ3	98	88.848	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.275	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	98	87.275	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	86.174	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	98	86.667	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	85.545	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	98	86.145	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.170	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	98	87.170	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.161	ENSPANG00000020978	FTSJ3	98	86.402	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	81	69.663	ENSPKIG00000012838	ftsj3	90	69.061	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	59	82.222	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	68	86.957	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	54.513	ENSPMGG00000012959	ftsj3	98	54.765	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	93.811	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	98	93.932	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	77.500	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	98	79.227	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.656	ENSPFOG00000023101	ftsj3	97	60.710	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	60.490	ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.592	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.773	ENSPMEG00000012692	ftsj3	97	60.828	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.349	ENSPREG00000014874	ftsj3	97	61.484	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.320	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	98	86.320	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	84.110	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	98	83.273	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	88.285	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	98	88.647	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	88.138	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	98	87.817	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	85	70.157	ENSPNYG00000005108	ftsj3	96	70.787	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	97	59.398	ENSPNAG00000022474	ftsj3	94	60.662	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	94.265	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	99	94.660	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.369	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	98	86.369	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	86.353	ENSRROG00000045002	FTSJ3	98	86.353	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	65	39.716	YCL054W	-	63	39.821	Saccharomyces_cerevisiae
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	86.369	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	92	87.167	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	77.316	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	77.952	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.393	ENSSFOG00015018053	ftsj3	97	62.217	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	66	62.903	ENSSMAG00000002863	ftsj3	96	60.072	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.385	ENSSDUG00000003385	ftsj3	95	62.321	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	61.876	ENSSLDG00000017970	ftsj3	95	62.081	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	92	69.716	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	99	69.369	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	59.070	ENSSPAG00000002390	ftsj3	96	61.566	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.304	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	98	87.787	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.380	ENSTRUG00000017550	ftsj3	88	69.886	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	99	60.900	ENSTNIG00000015549	ftsj3	98	61.271	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	81.697	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	98	81.818	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	98	87.666	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	98	87.545	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	82	99.254	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	94	99.254	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.619	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	98	87.787	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	87.381	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	98	87.787	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	97	58.768	ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.184	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	85	69.780	ENSXCOG00000002999	ftsj3	88	69.318	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	66	64.539	ENSXMAG00000018139	ftsj3	96	61.118	Xiphophorus_maculatus