EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0022383 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Nelfe
Alias: NELF-E|Rdbp
Full Name: negative elongation factor complex member E%2C Rdbp
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5996 bases
Position: chr17:32510528-32516523
Accession: 102744
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0046211	RRM_1	PF00076.22	4.4e-11	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0046212	RRM_1	PF00076.22	4.4e-11	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0046214	RRM_1	PF00076.22	4.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0046212	-	1417	-	MGP_SPRETEiJ_P0046212	373 (aa)	-	UPI000A3198AD
MGP_SPRETEiJ_T0046213	-	979	-	MGP_SPRETEiJ_P0046213	234 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0046211	-	1625	-	MGP_SPRETEiJ_P0046211	373 (aa)	-	UPI000A3198AD
MGP_SPRETEiJ_T0046216	-	443	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0046217	-	420	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0046214	-	1399	-	MGP_SPRETEiJ_P0046214	373 (aa)	-	UPI000A3198AD
MGP_SPRETEiJ_T0046215	-	499	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	91.689	ENSG00000204356	NELFE	100	94.340	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.493	ENSAMEG00000002062	NELFE	96	92.493	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	97	88.398	ENSCAPG00000015145	NELFE	89	90.237	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	90.885	ENSCPOG00000031829	NELFE	98	90.885	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	89	59.763	ENSCPBG00000000225	NELFE	60	69.318	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	93.834	ENSDNOG00000041886	-	98	93.834	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	45.187	ENSEBUG00000017070	nelfe	99	58.659	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	90.104	ENSEASG00005015538	NELFE	98	90.104	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	93.029	ENSECAG00000012274	NELFE	85	93.029	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	71	96.296	ENSEEUG00000005004	NELFE	67	96.296	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	57.672	ENSELUG00000005830	nelfe	72	74.227	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	62.834	ENSGALG00000045676	NELFE	94	77.778	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	63.369	ENSGAGG00000005411	NELFE	93	84.127	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.225	ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	71	72.727	ENSMGAG00000001297	NELFE	75	73.810	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	59.043	ENSMODG00000015063	NELFE	93	90.625	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0021478	Nelfe	100	100.000	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	97.855	ENSMUSG00000024369	Nelfe	100	97.855	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	97.855	MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	97.855	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.225	ENSMPUG00000010581	NELFE	96	92.225	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	60	73.469	ENSOMEG00000008581	nelfe	66	73.469	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.761	ENSPPAG00000039942	NELFE	98	92.761	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.493	ENSPTRG00000017996	NELFE	98	92.493	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	54.707	ENSPKIG00000012048	nelfe	75	77.241	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	93.029	ENSPPYG00000016471	NELFE	98	93.029	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	97.587	ENSRNOG00000000420	Nelfe	100	97.587	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	91.689	ENSRROG00000041993	NELFE	98	91.689	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	62.785	ENSSFOG00015017039	nelfe	99	68.097	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	93	88.506	ENSSARG00000003684	NELFE	95	88.166	Sorex_araneus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.493	ENSUAMG00000024338	NELFE	98	92.493	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.493	ENSUMAG00000012674	NELFE	98	92.493	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	59.517	ENSXCOG00000019513	nelfe	99	58.713	Xiphophorus_couchianus