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Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0023821 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rpp30
Alias: Rnasep2|TSG15
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20695 bases
Position: chr19:33308061-33328755
Accession: 1859683
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0050623	RNase_P_p30	PF01876.16	5e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0050623	-	1153	-	MGP_SPRETEiJ_P0050623	268 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSG00000148688	RPP30	100	90.299	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	88	58.051	ENSAPOG00000023156	rpp30	93	51.822	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.791	ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.791	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	56.652	ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.502	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	55.056	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	55.056	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	55.056	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	55.056	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	92	58.704	ENSATEG00000015263	rpp30	89	58.704	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	90	71.369	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	71.369	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	70.189	ENSACAG00000007996	RPP30	99	70.189	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	78.113	ENSANAG00000009439	RPP30	83	78.113	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	53.358	ENSACLG00000015389	-	99	53.358	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	57.463	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSBTAG00000002973	RPP30	100	90.672	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	88.060	ENSCJAG00000011045	RPP30	100	88.060	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	89.925	ENSCAFG00000031801	RPP30	100	89.925	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	89.925	ENSCAFG00020000258	RPP30	100	89.925	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	87.687	ENSCHIG00000012901	RPP30	100	87.687	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSTSYG00000013903	RPP30	100	90.672	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	90	70.833	ENSCAPG00000001326	RPP30	100	70.833	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSCPOG00000033174	RPP30	100	90.672	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	89.925	ENSCCAG00000029514	RPP30	100	89.925	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	90.189	ENSCATG00000042072	RPP30	99	90.189	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	92.537	ENSCLAG00000008595	RPP30	100	92.537	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSCSAG00000006694	RPP30	100	90.299	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	51.172	ENSCHOG00000007023	-	100	51.172	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	75.564	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	75.564	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	42.562	ENSCING00000019714	-	89	41.736	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	40.909	ENSCSAVG00000011282	-	80	40.909	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSCANG00000041084	RPP30	100	90.299	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	96.552	ENSCGRG00001017068	-	97	96.552	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	79.478	ENSCGRG00001000834	-	100	79.478	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	95.522	ENSCGRG00000002508	-	100	95.522	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	79.851	ENSCGRG00000006196	-	100	79.851	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	51.648	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	51.648	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	92	60.081	ENSCVAG00000003139	rpp30	95	58.140	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	58.801	ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	90.672	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.418	ENSDORG00000015333	Rpp30	100	91.418	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	87	35.685	FBgn0283652	Rpp30	78	35.685	Drosophila_melanogaster
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	87.687	ENSETEG00000018823	RPP30	100	87.687	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	56	39.735	ENSEBUG00000003989	-	83	39.735	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	90.637	ENSEASG00005011050	RPP30	99	90.637	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	90.637	ENSECAG00000021917	RPP30	99	90.637	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	97	63.602	ENSEEUG00000009986	-	99	63.602	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	66.912	ENSELUG00000003731	rpp30	95	66.912	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.791	ENSFCAG00000029073	RPP30	93	91.791	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	71.536	ENSFALG00000007711	RPP30	99	71.536	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.045	ENSFDAG00000019241	RPP30	100	91.045	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	93	55.422	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	53.909	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	91	54.762	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	54.762	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	70.522	ENSGALG00000006486	RPP30	100	69.600	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	95	54.902	ENSGAFG00000001445	rpp30	94	54.902	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	54.613	ENSGACG00000010285	rpp30	96	54.613	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	73.308	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	73.308	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSGGOG00000026917	RPP30	100	90.299	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	53.358	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	53.358	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.791	ENSHGLG00000013072	RPP30	100	91.791	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.791	ENSHGLG00100017798	RPP30	100	91.791	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	94	51.938	ENSHCOG00000004763	-	90	51.938	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	58.303	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	58.303	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSSTOG00000027002	RPP30	100	90.672	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	92.537	ENSJJAG00000020041	Rpp30	100	92.537	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	54.478	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	54.478	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	54.982	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	54.982	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	72	60.274	ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	63.433	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	63.433	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSLAFG00000015931	RPP30	100	90.672	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSMFAG00000031109	RPP30	100	90.299	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSMMUG00000006628	RPP30	100	90.299	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	89.925	ENSMNEG00000033838	RPP30	100	89.925	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSMLEG00000037578	RPP30	100	90.299	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	55.351	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	55.351	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	53.358	ENSMZEG00005018508	-	99	53.358	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	66.418	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	66.791	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	94.403	ENSMAUG00000008797	Rpp30	100	94.403	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	91.418	ENSMICG00000012019	RPP30	100	91.418	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	92.910	ENSMOCG00000016872	Rpp30	100	92.910	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	50.746	ENSMMOG00000009266	rpp30	93	50.746	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	69.663	ENSMODG00000009342	-	99	69.663	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	82.397	ENSMODG00000006863	-	99	82.397	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	98	55.513	ENSMALG00000011718	rpp30	96	55.513	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	98.876	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	98.876	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	99.627	ENSMUSG00000024800	Rpp30	100	99.627	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	97.388	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	97.388	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	91.698	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	91.698	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	90.637	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	90.637	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	74.627	ENSNGAG00000014392	-	100	74.627	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	92.537	ENSNGAG00000012018	-	100	92.537	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	45.353	ENSNBRG00000024170	-	100	45.353	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.672	ENSNLEG00000012383	RPP30	100	90.672	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	72.325	ENSMEUG00000015587	-	100	72.325	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	53	93.662	ENSOPRG00000007367	-	100	93.662	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	68.657	ENSODEG00000004560	-	100	68.657	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	98	92.776	ENSODEG00000004530	-	100	92.776	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	77	54.589	ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	80.150	ENSOANG00000003415	RPP30	99	80.150	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	88.806	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	88.806	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	96	55.000	ENSORLG00000020420	rpp30	89	55.000	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	54.851	ENSORLG00020009037	-	99	54.851	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	54.851	ENSORLG00015008300	rpp30	93	54.851	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	68	52.717	ENSOMEG00000012640	-	98	52.717	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSOGAG00000013963	RPP30	100	90.299	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	98	83.588	ENSOARG00000015789	RPP30	98	83.588	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	90.299	ENSPPAG00000043779	RPP30	100	90.299	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	92.164	ENSPPRG00000000115	RPP30	100	92.164	Panthera_pardus
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