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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0024051 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rpp38
Alias: C330006A15Rik
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3702 bases
Position: chr2:302600-306301
Accession: 2443607
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0051341	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	9.9e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0051341	-	1041	-	MGP_SPRETEiJ_P0051341	280 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.088	ENSG00000152464	RPP38	100	75.595	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.750	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	44.203	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.479	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	71.930	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	44.061	ENSACIG00000011592	rpp38	92	43.820	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.110	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	43.554	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	44.981	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.421	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	96	45.455	ENSATEG00000000731	rpp38	98	45.818	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	48.450	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	49.259	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	ENSACLG00000016958	rpp38	97	41.606	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.279	ENSACLG00000016962	rpp38	97	41.241	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	89	41.270	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	42.481	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	68.421	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	68.421	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.775	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	71.228	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.775	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	71.228	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	67.719	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	67.719	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.930	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	71.930	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.439	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	75.439	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	75.564	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	75.352	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	76.491	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	76.491	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	82.918	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	83.986	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	82.918	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	83.986	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.806	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.361	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	43.682	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.772	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	90	46.183	ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.255	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	73.239	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	73.239	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	65.836	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	65.836	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.025	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.025	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	99	71.631	ENSEASG00005019783	RPP38	98	71.631	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	99	66.667	ENSEEUG00000014677	RPP38	99	66.667	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	42.279	ENSELUG00000010160	rpp38	94	42.908	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	69.718	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	69.718	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	50.584	ENSFALG00000014804	RPP38	93	51.301	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	73.684	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	73.684	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	41.281	ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.308	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	49.421	ENSGALG00000008794	RPP38	91	50.000	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	57	50.000	ENSGACG00000009258	rpp38	97	48.750	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	41.971	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.579	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	71.579	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	43.373	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	41.509	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	72.281	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	72.281	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	79.649	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	78.947	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	42.424	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	42.322	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	96	44.876	ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.523	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	52.857	ENSLACG00000006502	RPP38	100	52.881	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	93	47.080	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	47.464	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	73.592	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	73.592	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	77.068	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	76.761	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	96	44.203	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	43.796	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	ENSMZEG00005003200	rpp38	97	41.606	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	41.971	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	48.462	ENSMGAG00000008217	RPP38	91	49.259	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	83.274	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	83.274	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	85.106	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	84.397	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.857	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	42.446	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	62.963	ENSMODG00000024091	RPP38	100	62.676	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	42.125	ENSMALG00000002356	rpp38	93	42.125	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	97.500	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	97.500	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	98.571	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	98.571	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	95.357	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	95.357	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	99	69.751	ENSMPUG00000018523	RPP38	99	70.213	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	74.157	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	73.944	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	78.596	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	78.596	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.910	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	42.294	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.223	ENSONIG00000020467	rpp38	96	42.701	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	70.301	ENSOCUG00000024367	-	100	70.775	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	70.301	ENSOCUG00000022768	-	100	70.775	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	90	42.146	ENSORLG00000009219	rpp38	96	42.491	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	42.063	ENSORLG00020011503	rpp38	90	41.791	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	93	41.264	ENSORLG00015017702	rpp38	94	42.199	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	45.038	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	44.599	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.088	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	75.088	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	68.421	ENSOARG00000004534	RPP38	100	68.421	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.088	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	75.088	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.070	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	70.070	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	69.718	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.070	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.088	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	75.088	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.494	ENSPKIG00000025652	rpp38	95	43.382	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	96	53.650	ENSPSIG00000001527	RPP38	97	53.650	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	86.477	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	87.189	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	64.311	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	64.311	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	62	47.253	ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.253	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	89	41.762	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	41.762	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	38.583	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	38.636	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	89	41.445	ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.065	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	75.789	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	75.789	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	71.910	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	72.281	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.647	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	41.971	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	88	43.600	ENSPNAG00000010633	rpp38	100	42.958	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	98	85.818	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	85.091	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	65.018	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	65.018	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	43.116	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.866	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	44.404	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	43.431	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	44.404	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	44.604	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	55.357	ENSSARG00000012099	RPP38	100	55.357	Sorex_araneus
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MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	55.088	ENSSPUG00000005237	-	100	55.088	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	97	51.087	ENSSPUG00000008560	-	99	51.087	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.857	ENSSPAG00000020387	rpp38	99	41.844	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	67.708	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	67.708	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	91	50.385	ENSTGUG00000001366	RPP38	96	49.442	Taeniopygia_guttata
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	41.489	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	41.135	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	68.421	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	68.421	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	71.831	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	72.281	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.979	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	72.028	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	70.070	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	70.526	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	92	46.691	ENSXETG00000003419	rpp38	97	47.331	Xenopus_tropicalis