EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0026841 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Aco1
Alias: Aco-1|Irebp|Irp1
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 128692 bases
Position: chr4:37322656-37451347
Accession: 87879
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0064202	Aconitase	PF00330.20	2.7e-182	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0064202	Aconitase_C	PF00694.19	3.8e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0064205	-	410	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0064204	-	714	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0064206	-	638	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0064203	-	1278	-	MGP_SPRETEiJ_P0064203	343 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0064202	-	3832	-	MGP_SPRETEiJ_P0064202	889 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0026841's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0026841's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	62.184	MGP_SPRETEiJ_G0033375	Ireb2	91	62.184

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.476	ENSG00000122729	ACO1	100	93.476	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.127	ENSAPOG00000008670	aco1	99	83.127	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.697	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	92.697	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.015	ENSACIG00000014377	aco1	99	83.015	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.465	ENSAOCG00000007699	aco1	99	83.465	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.352	ENSAPEG00000014370	aco1	99	83.352	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.671	ENSATEG00000000560	aco1	99	83.671	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	87.387	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	87.387	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	97	87.674	ENSACAG00000001541	ACO1	99	87.674	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	92.117	ENSANAG00000003359	ACO1	99	92.117	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.352	ENSACLG00000007755	aco1	99	83.352	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.333	ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.427	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.151	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	94.151	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.351	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	92.351	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.809	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	92.809	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.913	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	92.913	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.376	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	94.376	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.813	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	93.813	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	73.228	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	73.116	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	91.789	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	91.789	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.013	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	92.013	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSCATG00000045333	ACO1	100	93.138	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.351	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	92.351	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.251	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	93.251	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	90	74.439	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	74.324	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	89.189	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	89.189	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.026	ENSCANG00000014847	ACO1	100	93.026	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	98.088	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	98.088	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	96.963	ENSCGRG00000004877	-	100	96.963	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	78.918	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.918	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	92.754	ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.776	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.240	ENSDARG00000026376	aco1	99	83.240	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	93.138	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.363	ENSDORG00000014246	Aco1	100	93.363	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	81	91.781	ENSETEG00000012415	-	85	70.899	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	58.606	ENSEBUG00000015441	aco1	97	58.817	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.151	ENSEASG00005004602	ACO1	100	94.151	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.038	ENSECAG00000014846	ACO1	100	94.038	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	81.327	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	81.327	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	92	91.304	ENSELUG00000016812	aco1	97	81.890	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	93.138	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	87.387	ENSFALG00000001167	ACO1	99	87.387	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.463	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	92.463	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.202	ENSFHEG00000005619	aco1	99	83.202	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	79.684	ENSGMOG00000005514	aco1	99	79.684	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	87.613	ENSGALG00000002162	ACO1	99	87.613	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.340	ENSGACG00000001637	aco1	99	82.340	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	88.739	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	88.739	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.251	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	93.251	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.240	ENSHBUG00000008952	aco1	99	83.240	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	93.138	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	93.138	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	79.707	ENSHCOG00000015881	aco1	99	79.707	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.790	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.790	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.713	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	94.713	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	95.051	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	95.051	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.545	ENSKMAG00000015759	aco1	99	82.545	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	78.652	ENSLBEG00000013866	aco1	99	78.652	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	59	94.915	ENSLACG00000000936	ACO1	99	73.433	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	84.589	ENSLOCG00000011082	aco1	99	84.589	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.238	ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	93.138	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.251	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	93.251	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.026	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	93.026	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.251	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	93.251	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.690	ENSMAMG00000002915	aco1	99	83.690	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	93.103	ENSMZEG00005012733	aco1	99	79.507	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	72.210	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	72.210	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	97.300	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	97.300	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.701	ENSMICG00000006540	ACO1	100	93.701	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	97.188	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	97.188	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	81.665	ENSMMOG00000020282	aco1	99	81.665	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	89.989	ENSMODG00000004463	ACO1	100	89.989	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.015	ENSMALG00000019764	aco1	99	83.015	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	99.325	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	99.325	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	99.438	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	99.438	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	99.325	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	99.325	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	93.138	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.013	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	92.013	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	96.063	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	96.063	Nannospalax_galili
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	65.548	ENSNBRG00000008973	aco1	99	65.324	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.701	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	93.701	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	95.946	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	82.688	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	89.989	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	89.989	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	90.889	ENSODEG00000001240	-	100	90.889	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	88.414	ENSODEG00000015432	-	100	87.964	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.127	ENSONIG00000019869	aco1	99	83.127	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	81	91.148	ENSOANG00000012132	ACO1	100	91.148	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.102	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	91.880	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.333	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.333	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.883	ENSORLG00020010991	aco1	99	82.883	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.995	ENSORLG00015011785	aco1	99	82.995	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	81.490	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.490	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.476	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	93.476	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.376	ENSOARG00000014707	ACO1	98	94.376	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.363	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	93.363	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	93.138	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.026	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	93.026	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.363	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	93.363	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.251	ENSPANG00000025270	ACO1	100	93.251	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	81.440	ENSPKIG00000023168	aco1	99	81.440	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	88.851	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	88.851	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.878	ENSPMGG00000020708	aco1	99	83.878	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	97.188	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	97.188	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	89.876	ENSPCIG00000029321	ACO1	100	90.378	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.187	ENSPFOG00000013405	aco1	99	82.187	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	91.525	ENSPLAG00000023422	aco1	98	83.375	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	88	91.525	ENSPMEG00000011800	aco1	98	83.292	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.187	ENSPREG00000021791	aco1	99	82.187	Poecilia_reticulata
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	93.138	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	78	94.340	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	94.340	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	89	93.165	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	93.165	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	96	87.734	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	87.734	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.240	ENSPNYG00000009425	aco1	99	83.240	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.915	ENSPNAG00000017918	aco1	100	83.915	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	97.413	ENSRNOG00000005849	Aco1	100	97.413	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.026	ENSRBIG00000034592	ACO1	100	93.026	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	93.138	ENSRROG00000042672	ACO1	100	93.138	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.576	ENSSBOG00000026008	ACO1	100	92.576	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	89.663	ENSSHAG00000008924	ACO1	100	89.663	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.902	ENSSFOG00015018941	aco1	99	82.902	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	75	83.731	ENSSMAG00000018908	aco1	80	83.634	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.540	ENSSDUG00000002984	aco1	99	83.540	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.766	ENSSLDG00000013952	aco1	99	83.766	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	96	89.953	ENSSARG00000008437	ACO1	100	89.953	Sorex_araneus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	86.471	ENSSPUG00000002916	ACO1	99	86.471	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	83.915	ENSSPAG00000019147	aco1	99	83.915	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.038	ENSSSCG00000023807	ACO1	100	94.038	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	87.050	ENSTGUG00000001505	ACO1	99	87.050	Taeniopygia_guttata
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.393	ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.280	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	80.023	ENSTNIG00000005288	aco1	99	80.023	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	89.876	ENSTBEG00000012369	ACO1	100	89.876	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	94.151	ENSTTRG00000016991	ACO1	99	94.151	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.913	ENSUAMG00000020699	ACO1	100	92.913	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.913	ENSUMAG00000005807	ACO1	100	92.913	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	96	93.662	ENSVPAG00000009876	ACO1	100	93.662	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.913	ENSVVUG00000021152	ACO1	91	92.913	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	85.393	ENSXETG00000009184	aco1	99	85.393	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	50	81.406	ENSXCOG00000005638	aco1	96	81.406	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.413	ENSXMAG00000023603	aco1	99	82.413	Xiphophorus_maculatus