EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0027314 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Toe1
Alias: 4930584N22Rik|4933424D16Rik
Full Name: target of EGR1%2C member 1 (nuclear)
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12927 bases
Position: chr4:113081016-113093942
Accession: 1915526
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0066332	zf-CCCH	PF00642.24	0.0003	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0066332	CAF1	PF04857.20	3e-88	1	2
MGP_SPRETEiJ_P0066332	CAF1	PF04857.20	3e-88	2	2
MGP_SPRETEiJ_P0066331	CAF1	PF04857.20	1.9e-80	1	2
MGP_SPRETEiJ_P0066331	CAF1	PF04857.20	1.9e-80	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0066338	-	916	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066337	-	666	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066336	-	780	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066335	-	1097	-	MGP_SPRETEiJ_P0066335	188 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066334	-	856	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066333	-	433	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066332	-	2092	-	MGP_SPRETEiJ_P0066332	511 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066331	-	1216	-	MGP_SPRETEiJ_P0066331	329 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_SPRETEiJ_G0027314's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_SPRETEiJ_G0027314's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSG00000132773	TOE1	100	82.192	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSAPOG00000010450	toe1	97	49.402	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSAMEG00000013576	TOE1	100	81.641	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSACIG00000004175	toe1	97	50.916	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSAOCG00000022922	toe1	97	48.649	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSAPEG00000005572	toe1	98	48.466	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSATEG00000008973	toe1	97	50.591	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	57	87.963	ENSAPLG00000007214	TOE1	96	63.115	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	82.065	ENSACAG00000015161	TOE1	95	55.682	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSANAG00000023815	-	98	90.400	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	70.703	ENSANAG00000032328	-	99	72.374	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSACLG00000021437	toe1	97	47.727	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.022	ENSAMXG00000031029	toe1	95	51.224	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSBTAG00000011243	TOE1	100	81.524	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	39.267	WBGene00013265	parn-2	60	35.197	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSCJAG00000004716	TOE1	100	82.031	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSCAFG00000004603	TOE1	100	82.779	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSCAFG00020016716	TOE1	100	82.779	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSCHIG00000026678	TOE1	100	81.800	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSTSYG00000011320	TOE1	98	89.600	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	64	95.041	ENSCAPG00000003952	TOE1	100	79.772	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSCPOG00000036595	TOE1	100	79.648	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSCCAG00000030245	TOE1	98	90.000	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.676	ENSCATG00000038458	TOE1	99	90.400	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSCLAG00000003906	TOE1	100	82.387	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSCSAG00000001213	TOE1	100	81.996	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSCHOG00000004270	TOE1	100	81.213	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	82.609	ENSCPBG00000005398	TOE1	95	60.192	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	52.174	ENSCING00000003872	-	97	35.600	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	52.688	ENSCSAVG00000004594	-	83	45.862	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSCANG00000037540	TOE1	100	82.583	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.826	ENSCGRG00001022323	Toe1	100	91.389	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.826	ENSCGRG00000004377	Toe1	100	90.998	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	67.568	ENSCSEG00000021445	toe1	97	47.013	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	70.811	ENSCVAG00000006577	toe1	97	50.299	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	70.652	ENSDARG00000077544	toe1	96	53.027	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSDNOG00000015596	TOE1	97	79.492	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSDORG00000007153	Toe1	100	82.387	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	91.848	ENSETEG00000013367	TOE1	100	77.733	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	99	51.852	ENSEBUG00000000655	toe1	93	36.854	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.565	ENSEASG00005004198	TOE1	100	72.394	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSECAG00000023204	TOE1	100	81.409	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSEEUG00000015402	TOE1	100	79.061	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	71.196	ENSELUG00000012307	toe1	94	51.859	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSFCAG00000038191	TOE1	100	82.779	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	94	80.226	ENSFALG00000005017	TOE1	99	52.024	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSFDAG00000019031	TOE1	100	81.213	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSFHEG00000021893	toe1	97	49.518	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	70.270	ENSGMOG00000004656	toe1	97	51.271	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	79.348	ENSGALG00000010228	TOE1	98	54.095	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSGAFG00000013948	toe1	97	50.098	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	68.108	ENSGACG00000014339	toe1	93	57.895	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	83.696	ENSGAGG00000023228	TOE1	97	54.182	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSGGOG00000003290	TOE1	98	90.400	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSHBUG00000012101	toe1	97	49.323	Haplochromis_burtoni
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.565	ENSHGLG00000003603	TOE1	100	81.250	Heterocephalus_glaber_female
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.565	ENSHGLG00100015361	TOE1	100	81.250	Heterocephalus_glaber_male
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSHCOG00000016394	toe1	97	49.385	Hippocampus_comes
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	72.283	ENSIPUG00000002717	toe1	97	54.697	Ictalurus_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSSTOG00000010669	TOE1	100	81.213	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.022	ENSJJAG00000021743	Toe1	99	88.211	Jaculus_jaculus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	68.649	ENSKMAG00000020891	toe1	96	50.000	Kryptolebias_marmoratus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	68.649	ENSLBEG00000010456	toe1	97	49.323	Labrus_bergylta
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	76	80.420	ENSLACG00000016268	-	100	80.420	Latimeria_chalumnae
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	74.457	ENSLOCG00000002852	toe1	98	53.175	Lepisosteus_oculatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSLAFG00000017370	TOE1	100	80.626	Loxodonta_africana
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.676	ENSMFAG00000042312	TOE1	99	90.400	Macaca_fascicularis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSMMUG00000020081	TOE1	100	83.226	Macaca_mulatta
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSMNEG00000032131	TOE1	100	82.192	Macaca_nemestrina
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSMLEG00000028729	TOE1	100	82.192	Mandrillus_leucophaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSMAMG00000015291	toe1	97	48.473	Mastacembelus_armatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSMZEG00005014305	toe1	97	47.727	Maylandia_zebra
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	91	79.651	ENSMGAG00000010387	TOE1	99	57.014	Meleagris_gallopavo
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.283	ENSMAUG00000022118	Toe1	100	90.411	Mesocricetus_auratus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.565	ENSMICG00000047305	-	100	79.412	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	76.087	ENSMICG00000032375	-	93	74.212	Microcebus_murinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	98.370	ENSMOCG00000012917	Toe1	100	89.648	Microtus_ochrogaster
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	90	66.667	ENSMMOG00000020894	toe1	96	48.203	Mola_mola
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	83.152	ENSMODG00000002430	TOE1	98	66.183	Monodelphis_domestica
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSMALG00000010017	toe1	97	48.752	Monopterus_albus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	98.434	MGP_CAROLIEiJ_G0026342	Toe1	100	98.434	Mus_caroli
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	98.936	ENSMUSG00000028688	Toe1	100	98.936	Mus_musculus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	98.936	MGP_PahariEiJ_G0028674	Toe1	100	98.936	Mus_pahari
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSMPUG00000013123	TOE1	100	80.897	Mustela_putorius_furo
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSMLUG00000005649	TOE1	100	81.018	Myotis_lucifugus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSNBRG00000019107	toe1	97	51.534	Neolamprologus_brichardi
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	94.681	ENSNLEG00000014383	TOE1	98	90.000	Nomascus_leucogenys
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	82	85.161	ENSMEUG00000000629	-	86	85.161	Notamacropus_eugenii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSOPRG00000004057	TOE1	100	80.822	Ochotona_princeps
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSODEG00000008239	TOE1	100	81.213	Octodon_degus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	68.649	ENSONIG00000009053	toe1	97	48.289	Oreochromis_niloticus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	53.229	ENSOANG00000011797	-	94	54.244	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	94.565	ENSOCUG00000017503	TOE1	100	81.800	Oryctolagus_cuniculus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSORLG00000012609	toe1	97	48.228	Oryzias_latipes
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSORLG00020006441	toe1	97	48.814	Oryzias_latipes_hni
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSORLG00015001476	toe1	97	48.310	Oryzias_latipes_hsok
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	68.649	ENSOMEG00000014153	toe1	97	48.310	Oryzias_melastigma
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	81	94.771	ENSOGAG00000002298	-	100	86.301	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	97	76.374	ENSOGAG00000032761	-	100	58.915	Otolemur_garnettii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSOARG00000001561	TOE1	100	80.952	Ovis_aries
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSPPAG00000043315	TOE1	98	90.400	Pan_paniscus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSPPRG00000011880	TOE1	100	83.170	Panthera_pardus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSPTIG00000008086	TOE1	100	83.170	Panthera_tigris_altaica
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSPTRG00000000672	TOE1	98	90.400	Pan_troglodytes
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSPANG00000012549	TOE1	98	82.192	Papio_anubis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	72.973	ENSPKIG00000010811	toe1	94	50.737	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	83.152	ENSPSIG00000010299	TOE1	96	73.162	Pelodiscus_sinensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	70.270	ENSPMGG00000020389	toe1	97	50.816	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	98.370	ENSPEMG00000021892	Toe1	100	90.998	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	57.838	ENSPMAG00000004794	toe1	96	42.745	Petromyzon_marinus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	82.609	ENSPCIG00000027569	TOE1	97	65.918	Phascolarctos_cinereus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSPFOG00000019517	toe1	97	49.706	Poecilia_formosa
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSPLAG00000018228	toe1	97	49.511	Poecilia_latipinna
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSPMEG00000019956	toe1	97	49.902	Poecilia_mexicana
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSPPYG00000001414	TOE1	100	82.583	Pongo_abelii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.652	ENSPCAG00000013351	TOE1	100	80.039	Procavia_capensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	96.277	ENSPCOG00000000982	TOE1	98	88.000	Propithecus_coquereli
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSPVAG00000014998	TOE1	99	74.900	Pteropus_vampyrus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSPNYG00000019914	toe1	97	47.727	Pundamilia_nyererei
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	70.652	ENSPNAG00000021933	toe1	96	51.329	Pygocentrus_nattereri
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.826	ENSRNOG00000017561	Toe1	98	95.349	Rattus_norvegicus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.135	ENSRBIG00000031463	TOE1	99	90.000	Rhinopithecus_bieti
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.135	ENSRROG00000026371	TOE1	99	90.000	Rhinopithecus_roxellana
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	100	95.213	ENSSBOG00000026044	-	98	90.400	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	93	82.286	ENSSBOG00000032639	-	98	72.656	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	84.239	ENSSHAG00000010201	TOE1	97	66.049	Sarcophilus_harrisii
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	72.283	ENSSFOG00015021182	toe1	95	54.054	Scleropages_formosus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	81	64.052	ENSSMAG00000015336	toe1	90	56.716	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	74	68.085	ENSSMAG00000015322	toe1	83	44.989	Scophthalmus_maximus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSSDUG00000013278	toe1	97	48.155	Seriola_dumerili
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSSLDG00000021979	toe1	97	48.936	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	80.978	ENSSPUG00000003464	TOE1	98	56.952	Sphenodon_punctatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSSPAG00000009490	toe1	97	48.263	Stegastes_partitus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	95.109	ENSSSCG00000003918	TOE1	99	79.297	Sus_scrofa
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	95	69.274	ENSTGUG00000007927	TOE1	99	52.965	Taeniopygia_guttata
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.189	ENSTRUG00000025603	toe1	97	51.245	Takifugu_rubripes
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	71.351	ENSTNIG00000017614	toe1	98	51.797	Tetraodon_nigroviridis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.739	ENSTBEG00000017625	TOE1	78	88.197	Tupaia_belangeri
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSTTRG00000008815	TOE1	100	82.387	Tursiops_truncatus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSUAMG00000017724	TOE1	100	82.192	Ursus_americanus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	96.196	ENSUMAG00000024253	TOE1	100	83.656	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.826	ENSVPAG00000011731	TOE1	100	83.366	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	97.283	ENSVVUG00000007469	TOE1	92	83.534	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	74.457	ENSXETG00000003534	toe1	97	53.267	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSXCOG00000007796	toe1	97	50.000	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0027314	Toe1	98	69.730	ENSXMAG00000011102	toe1	97	49.706	Xiphophorus_maculatus