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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0027330 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Eri3
Alias: PINT1|Prnpip1
Full Name: exoribonuclease 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 124593 bases
Position: chr4:113924160-114048752
Accession: 2153887
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0066418	RNase_T	PF00929.24	1.3e-41	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0066421	RNase_T	PF00929.24	3.1e-16	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0066419	RNase_T	PF00929.24	2.1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0066422	-	245	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066421	-	596	-	MGP_SPRETEiJ_P0066421	125 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066420	-	1336	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0066418	-	1719	-	MGP_SPRETEiJ_P0066418	337 (aa)	-	UPI00000E9E39
MGP_SPRETEiJ_T0066419	-	830	-	MGP_SPRETEiJ_P0066419	163 (aa)	-	UPI000059E09E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	38.384	MGP_SPRETEiJ_G0032095	Eri1	52	43.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSG00000104626	ERI1	53	41.622	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.923	ENSG00000117419	ERI3	100	98.507	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSG00000196678	ERI2	75	37.321	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSAPOG00000020462	eri1	52	43.333	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSAMEG00000014032	ERI3	100	97.626	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSAMEG00000016002	ERI1	51	42.778	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSACIG00000004140	eri1	55	42.778	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	35.714	ENSACIG00000001312	-	85	36.596	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	35.000	ENSAOCG00000003497	-	72	38.095	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSAPEG00000022307	eri1	52	43.333	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	33.333	ENSATEG00000004702	-	82	39.048	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSATEG00000022473	eri1	52	42.222	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	96	32.716	ENSAPLG00000012159	ERI1	78	36.735	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	95.349	ENSAPLG00000010575	ERI3	100	81.106	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSACAG00000002863	ERI1	61	43.333	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	76	89.474	ENSACAG00000014747	ERI3	97	84.211	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSANAG00000035452	ERI2	67	37.441	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSANAG00000024843	ERI3	100	99.375	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	35.354	ENSANAG00000023618	ERI1	51	41.111	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSACLG00000015500	eri1	52	42.222	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSAMXG00000029498	eri1	52	38.889	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.329	ENSBTAG00000015559	ERI3	100	99.375	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSBTAG00000009685	ERI1	51	42.778	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	73	47.253	WBGene00019724	M02B7.2	92	44.000	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	54	32.812	WBGene00000797	crn-4	63	32.812	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	75	32.979	WBGene00001332	eri-1	50	32.787	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	73	50.549	WBGene00019825	R02D3.8	73	46.701	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	34.343	ENSCJAG00000012129	ERI1	51	40.556	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSCJAG00000009400	ERI2	67	37.915	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSCJAG00000003995	ERI3	92	97.112	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.923	ENSCAFG00000004807	ERI3	100	97.923	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCAFG00000006678	ERI1	51	42.778	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.923	ENSCAFG00020017314	ERI3	73	97.923	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCAFG00020000937	ERI1	51	42.778	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCHIG00000011907	ERI1	51	42.778	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	91.395	ENSCHIG00000024241	ERI3	100	91.395	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSTSYG00000027472	ERI1	51	42.778	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	94.479	ENSTSYG00000002494	ERI3	96	84.083	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	98	96.226	ENSCAPG00000008894	ERI3	100	94.898	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	36.364	ENSCAPG00000015826	ERI1	57	38.889	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSCPOG00000013963	ERI3	100	97.626	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCPOG00000030481	ERI1	52	42.778	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSCPOG00000030884	ERI2	81	38.571	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.329	ENSCCAG00000022116	ERI3	100	99.375	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	35.354	ENSCCAG00000032048	ERI1	51	41.111	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSCCAG00000030060	ERI2	58	37.799	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCATG00000037939	ERI1	51	42.222	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	98.220	ENSCATG00000035245	ERI3	100	99.375	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSCATG00000035294	ERI2	66	37.799	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.329	ENSCLAG00000005732	ERI3	100	97.329	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSCLAG00000013395	-	85	38.278	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCLAG00000001116	ERI1	55	42.778	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSCSAG00000016866	ERI1	51	42.222	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSCSAG00000001198	ERI3	100	97.626	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSCHOG00000007272	ERI1	57	42.778	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	96	96.178	ENSCHOG00000010877	ERI3	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSCPBG00000027186	ERI1	66	43.094	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	76	88.421	ENSCPBG00000003646	ERI3	100	85.714	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	44.186	ENSCING00000006175	-	60	40.206	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	44.186	ENSCSAVG00000010701	-	96	40.000	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	36.364	ENSCANG00000039595	ERI1	51	41.667	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSCANG00000015812	ERI3	100	99.375	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	38.384	ENSCGRG00001017852	Eri1	52	43.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	98.813	ENSCGRG00001024214	Eri3	100	98.813	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	36.082	ENSCGRG00001013593	Eri2	81	38.942	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	38.384	ENSCGRG00000004717	Eri1	57	43.889	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	98.160	ENSCGRG00000004320	Eri3	99	98.299	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	34.118	ENSCSEG00000005863	eri1	53	38.889	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSCVAG00000015467	eri1	53	41.667	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	40.000	ENSDARG00000044692	eri1	53	40.556	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	98	94.340	ENSDNOG00000017168	ERI3	81	89.105	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	80	36.000	ENSDNOG00000016937	ERI1	51	42.778	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	35.354	ENSDORG00000012092	Eri1	55	41.667	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	33.673	ENSDORG00000028564	-	86	37.619	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.626	ENSDORG00000005989	Eri3	100	97.626	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	70	33.333	FBgn0265192	Snp	93	35.885	Drosophila_melanogaster
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	80	95.420	ENSETEG00000017436	ERI3	72	86.905	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSETEG00000016628	ERI1	57	42.222	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	62.791	ENSEBUG00000012469	ERI3	75	62.312	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	98.220	ENSEASG00005002077	ERI3	100	98.220	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	38.384	ENSEASG00005016982	ERI1	51	43.333	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	38.384	ENSECAG00000011091	ERI1	57	43.333	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	98.220	ENSECAG00000014960	ERI3	95	90.728	Equus_caballus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSEEUG00000000425	ERI1	57	42.778	Erinaceus_europaeus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	69	38.372	ENSELUG00000024302	eri1	52	42.778	Esox_lucius
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.923	ENSFCAG00000005285	ERI3	99	97.603	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSFCAG00000029808	ERI1	51	42.778	Felis_catus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	36.471	ENSFALG00000006747	ERI1	57	42.222	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	80	85.662	ENSFALG00000005283	ERI3	99	85.662	Ficedula_albicollis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSFDAG00000015042	ERI1	53	42.778	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	100	97.033	ENSFDAG00000015896	ERI3	100	97.033	Fukomys_damarensis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	36.000	ENSFHEG00000013370	ERI2	79	38.462	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.824	ENSFHEG00000003119	eri1	60	34.597	Fundulus_heteroclitus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	36.047	ENSGMOG00000013948	eri1	60	41.989	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	64	37.615	ENSGMOG00000004616	-	54	37.615	Gadus_morhua
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	76	89.474	ENSGALG00000010106	ERI3	81	91.878	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	35.294	ENSGALG00000011448	ERI1	55	41.667	Gallus_gallus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	40.000	ENSGAFG00000014207	eri1	53	42.222	Gambusia_affinis
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	36.000	ENSGACG00000019510	ERI2	82	36.287	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	38.372	ENSGACG00000020068	eri1	55	42.541	Gasterosteus_aculeatus
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	76	88.421	ENSGAGG00000009419	ERI3	100	85.714	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	36.471	ENSGAGG00000021423	ERI1	53	42.778	Gopherus_agassizii
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	74	37.374	ENSGGOG00000013059	ERI1	51	42.222	Gorilla_gorilla
MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694	ENSGGOG00000004534	ERI2	64	37.619	Gorilla_gorilla
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MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	68	37.647	ENSHBUG00000007948	eri1	52	42.222	Haplochromis_burtoni
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