EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_SPRETEiJ_G0031498 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Eri2
Alias: 4933424N09Rik|Exod1
Full Name: exoribonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_spretus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27701 bases
Position: chr7:109339205-109366905
Accession: 1918401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_SPRETEiJ_P0085223	RNase_T	PF00929.24	5.3e-25	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0085224	RNase_T	PF00929.24	6.5e-25	1	1
MGP_SPRETEiJ_P0085231	RNase_T	PF00929.24	4.2e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_SPRETEiJ_T0085231	-	2499	-	MGP_SPRETEiJ_P0085231	688 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085223	-	973	-	MGP_SPRETEiJ_P0085223	257 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085232	-	688	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085224	-	1241	-	MGP_SPRETEiJ_P0085224	274 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085230	-	3129	-	MGP_SPRETEiJ_P0085230	107 (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085228	-	5482	-	-	- (aa)	-	-
MGP_SPRETEiJ_T0085229	-	3330	-	MGP_SPRETEiJ_P0085229	38 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	MGP_SPRETEiJ_G0027330	Eri3	67	34.694
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	35.714	MGP_SPRETEiJ_G0032095	Eri1	65	35.714

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSG00000117419	ERI3	98	33.491	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	88.163	ENSG00000196678	ERI2	98	83.660	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	34.468	ENSG00000104626	ERI1	63	34.468	Homo_sapiens
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.785	ENSAPOG00000020462	eri1	60	37.900	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	84.836	ENSAMEG00000006216	ERI2	100	69.175	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSAMEG00000014032	ERI3	57	38.278	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	89	36.327	ENSAMEG00000016002	ERI1	66	36.327	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	94	65.702	ENSACIG00000001312	-	93	63.386	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.785	ENSACIG00000004140	eri1	63	37.900	Amphilophus_citrinellus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	83	69.124	ENSAOCG00000003497	-	89	63.985	Amphiprion_ocellaris
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.785	ENSAPEG00000022307	eri1	60	37.900	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	87	67.401	ENSAPEG00000010524	ERI2	94	39.335	Amphiprion_percula
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.785	ENSATEG00000022473	eri1	60	37.900	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	84	70.455	ENSATEG00000004702	-	94	66.667	Anabas_testudineus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	65.164	ENSAPLG00000015662	ERI2	95	47.577	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	59	42.105	ENSAPLG00000010575	ERI3	63	42.105	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	36.916	ENSAPLG00000012159	ERI1	64	36.916	Anas_platyrhynchos
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	99	69.141	ENSACAG00000009743	ERI2	91	46.646	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.318	ENSACAG00000002863	ERI1	68	38.318	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSACAG00000014747	ERI3	71	38.278	Anolis_carolinensis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	99	84.884	ENSANAG00000035452	ERI2	100	72.648	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSANAG00000024843	ERI3	97	36.095	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	33.617	ENSANAG00000023618	ERI1	63	33.617	Aotus_nancymaae
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	65.574	ENSACLG00000004805	ERI2	53	64.542	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	38.785	ENSACLG00000015500	eri1	60	37.900	Astatotilapia_calliptera
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	35.455	ENSAMXG00000029498	eri1	60	35.455	Astyanax_mexicanus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.656	ENSBTAG00000006448	ERI2	100	68.786	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSBTAG00000015559	ERI3	97	36.095	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	34.454	ENSBTAG00000009685	ERI1	64	34.454	Bos_taurus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	84	35.945	WBGene00019724	M02B7.2	92	35.979	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	84	35.945	WBGene00019825	R02D3.8	76	35.945	Caenorhabditis_elegans
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	99	84.496	ENSCJAG00000009400	ERI2	100	71.491	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCJAG00000003995	ERI3	93	36.683	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	33.617	ENSCJAG00000012129	ERI1	63	33.617	Callithrix_jacchus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	89	35.918	ENSCAFG00000006678	ERI1	66	35.918	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.246	ENSCAFG00000017939	ERI2	99	67.391	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCAFG00000004807	ERI3	57	38.278	Canis_familiaris
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.656	ENSCAFG00020021852	ERI2	96	69.420	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	89	35.918	ENSCAFG00020000937	ERI1	66	35.918	Canis_lupus_dingo
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.246	ENSCHIG00000015621	ERI2	100	68.353	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	34.454	ENSCHIG00000011907	ERI1	64	34.454	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCHIG00000024241	ERI3	58	38.278	Capra_hircus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	60	40.909	ENSTSYG00000002494	ERI3	50	40.909	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	87.295	ENSTSYG00000011954	ERI2	100	72.110	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	34.468	ENSTSYG00000027472	ERI1	63	34.468	Carlito_syrichta
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	92	69.915	ENSCAPG00000017074	ERI2	100	62.887	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	35.885	ENSCAPG00000008894	ERI3	66	35.885	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	32.340	ENSCAPG00000015826	ERI1	70	32.340	Cavia_aperea
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCPOG00000013963	ERI3	57	38.278	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	100	86.770	ENSCPOG00000030884	ERI2	100	86.770	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	36.170	ENSCPOG00000030481	ERI1	64	36.170	Cavia_porcellus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	33.617	ENSCCAG00000032048	ERI1	63	33.617	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	88.525	ENSCCAG00000030060	ERI2	100	72.319	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCCAG00000022116	ERI3	97	36.095	Cebus_capucinus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCATG00000035245	ERI3	97	36.095	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	34.468	ENSCATG00000037939	ERI1	63	34.468	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	88.571	ENSCATG00000035294	ERI2	100	72.359	Cercocebus_atys
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	100	86.770	ENSCLAG00000013395	-	100	87.705	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCLAG00000005732	ERI3	57	38.278	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	36.170	ENSCLAG00000001116	ERI1	67	36.170	Chinchilla_lanigera
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	34.468	ENSCSAG00000016866	ERI1	63	34.468	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	88.525	ENSCSAG00000007592	ERI2	100	72.648	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCSAG00000001198	ERI3	57	38.278	Chlorocebus_sabaeus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	61	79.208	ENSCHOG00000009137	-	81	79.208	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	35.565	ENSCHOG00000007272	ERI1	71	35.565	Choloepus_hoffmanni
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	73.469	ENSCPBG00000019060	ERI2	99	48.122	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.756	ENSCPBG00000003646	ERI3	75	38.756	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.383	ENSCPBG00000027186	ERI1	73	37.383	Chrysemys_picta_bellii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	83	36.449	ENSCING00000006175	-	67	35.088	Ciona_intestinalis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	37.321	ENSCSAVG00000010701	-	99	37.321	Ciona_savignyi
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCANG00000015812	ERI3	97	36.095	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	34.043	ENSCANG00000039595	ERI1	63	34.043	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	88.525	ENSCANG00000036280	ERI2	100	73.082	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCGRG00001024214	Eri3	57	38.278	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	99	91.051	ENSCGRG00001013593	Eri2	99	91.051	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	34.454	ENSCGRG00001017852	Eri1	65	34.454	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	92.213	ENSCGRG00000017149	Eri2	100	82.874	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSCGRG00000004320	Eri3	65	38.278	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.383	ENSCGRG00000004717	Eri1	64	37.383	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	93	35.950	ENSCSEG00000005863	eri1	66	35.950	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	65.323	ENSCSEG00000002050	ERI2	65	47.761	Cynoglossus_semilaevis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	96	63.454	ENSCVAG00000014954	ERI2	58	63.968	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.850	ENSCVAG00000015467	eri1	60	36.986	Cyprinodon_variegatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.850	ENSDARG00000044692	eri1	59	37.850	Danio_rerio
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	83.607	ENSDNOG00000004093	ERI2	99	68.986	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	35.146	ENSDNOG00000016937	ERI1	64	35.146	Dasypus_novemcinctus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSDORG00000005989	Eri3	57	38.278	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	35.745	ENSDORG00000012092	Eri1	68	35.745	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.656	ENSDORG00000028564	-	100	85.656	Dipodomys_ordii
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	46.948	FBgn0265192	Snp	94	46.948	Drosophila_melanogaster
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MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	96	65.854	ENSETEG00000007322	-	76	65.854	Echinops_telfairi
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	35.047	ENSEBUG00000012469	ERI3	75	35.047	Eptatretus_burgeri
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSEASG00005002077	ERI3	57	38.278	Equus_asinus_asinus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	86	34.874	ENSEASG00005016982	ERI1	64	34.874	Equus_asinus_asinus
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MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	38.278	ENSUMAG00000024317	ERI3	64	38.278	Ursus_maritimus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	78.279	ENSVPAG00000003457	ERI2	100	66.570	Vicugna_pacos
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	89	35.918	ENSVVUG00000019723	ERI1	66	35.918	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	95	85.656	ENSVVUG00000023254	ERI2	99	69.420	Vulpes_vulpes
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.383	ENSXETG00000008153	eri1	62	35.217	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	96	72.691	ENSXETG00000016659	eri2	99	47.051	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	81	35.714	ENSXETG00000030397	ERI3	71	35.714	Xenopus_tropicalis
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	93	64.463	ENSXCOG00000015998	ERI2	98	37.588	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	85	36.986	ENSXCOG00000014835	eri1	63	36.866	Xiphophorus_couchianus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	82	37.383	ENSXMAG00000008936	eri1	60	36.530	Xiphophorus_maculatus
MGP_SPRETEiJ_G0031498	Eri2	93	64.050	ENSXMAG00000014766	-	95	64.050	Xiphophorus_maculatus