EuRBPDB

Description

RBDs

RBPome

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: YLR304C (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ACO1
Alias: GLU1
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Saccharomyces_cerevisiae
Status: confidence
Strand: Minus strand
Length: 2337
Position: chrXII:735212-737548
Accession: S000004295
RBP type: canonical RBP
Summary: Aconitase%3B required for the tricarboxylic acid (TCA) cycle and also independently required for mitochondrial genome maintenance%3B component of the mitochondrial nucleoid%3B mutation leads to glutamate auxotrophy%3B human homolog ACO2 can complement yeast null mutant

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
YLR304C_mRNA	Aconitase	PF00330.20	5.9e-153	1	1
YLR304C_mRNA	Aconitase_C	PF00694.19	2.2e-49	1	1

RNA binding proteome (RBPome)

PID	Title	Method	Time	Author	Doi
26595419	Conserved mRNA-binding proteomes in eukaryotic organisms	mRBPome & yeast	2015 Nov 23	Matia Gonzalez AM	DOI: 10.1038/nsmb.3128

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
YLR304C_mRNA	-	2337	-	YLR304C_mRNA	778 (aa)	-	P19414

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
YLR304C	ACO1	99	54.937	YJL200C	-	99	55.063

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSG00000100412	ACO2	97	67.280	Homo_sapiens
YLR304C	ACO1	96	66.979	ENSAPOG00000011484	ACO2	96	66.979	Acanthochromis_polyacanthus
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSAPOG00000017786	aco2	96	67.513	Acanthochromis_polyacanthus
YLR304C	ACO1	98	65.776	ENSAMEG00000015641	ACO2	98	65.776	Ailuropoda_melanoleuca
YLR304C	ACO1	82	67.241	ENSACIG00000021636	aco2	98	67.241	Amphilophus_citrinellus
YLR304C	ACO1	96	67.781	ENSAOCG00000020887	aco2	98	67.555	Amphiprion_ocellaris
YLR304C	ACO1	98	65.789	ENSAOCG00000019100	ACO2	97	65.789	Amphiprion_ocellaris
YLR304C	ACO1	98	65.921	ENSAPEG00000012427	ACO2	97	65.921	Amphiprion_percula
YLR304C	ACO1	96	67.781	ENSAPEG00000020171	aco2	96	67.781	Amphiprion_percula
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSATEG00000008001	ACO2	96	67.112	Anabas_testudineus
YLR304C	ACO1	96	67.557	ENSATEG00000007473	aco2	98	67.606	Anabas_testudineus
YLR304C	ACO1	96	67.690	ENSATEG00000006397	aco2	98	67.762	Anabas_testudineus
YLR304C	ACO1	98	66.229	ENSAPLG00000005198	ACO2	97	66.229	Anas_platyrhynchos
YLR304C	ACO1	98	65.359	ENSACAG00000004677	-	98	65.359	Anolis_carolinensis
YLR304C	ACO1	98	66.536	ENSANAG00000029281	ACO2	98	66.536	Aotus_nancymaae
YLR304C	ACO1	96	67.246	ENSACLG00000019179	aco2	96	67.246	Astatotilapia_calliptera
YLR304C	ACO1	86	63.926	ENSAMXG00000015485	ACO2	98	63.926	Astyanax_mexicanus
YLR304C	ACO1	98	66.316	ENSAMXG00000008808	aco2	97	66.316	Astyanax_mexicanus
YLR304C	ACO1	99	66.580	ENSBTAG00000006429	ACO2	99	66.580	Bos_taurus
YLR304C	ACO1	96	68.717	WBGene00000041	aco-2	99	69.809	Caenorhabditis_elegans
YLR304C	ACO1	98	64.937	ENSCJAG00000005004	ACO2	99	68.289	Callithrix_jacchus
YLR304C	ACO1	98	67.493	ENSCAFG00000001075	ACO2	98	67.493	Canis_familiaris
YLR304C	ACO1	98	67.493	ENSCAFG00020001976	ACO2	98	67.493	Canis_lupus_dingo
YLR304C	ACO1	98	67.016	ENSCHIG00000007877	ACO2	98	67.016	Capra_hircus
YLR304C	ACO1	98	67.937	ENSTSYG00000001084	ACO2	97	69.475	Carlito_syrichta
YLR304C	ACO1	98	67.806	ENSCAPG00000017225	ACO2	98	67.806	Cavia_aperea
YLR304C	ACO1	98	67.806	ENSCPOG00000012642	ACO2	98	67.806	Cavia_porcellus
YLR304C	ACO1	98	66.928	ENSCCAG00000028378	ACO2	98	68.404	Cebus_capucinus
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSCATG00000030437	ACO2	96	68.312	Cercocebus_atys
YLR304C	ACO1	77	52.931	ENSCATG00000026864	-	99	52.931	Cercocebus_atys
YLR304C	ACO1	98	44.678	ENSCATG00000000038	-	97	44.678	Cercocebus_atys
YLR304C	ACO1	98	67.674	ENSCLAG00000016998	ACO2	97	67.674	Chinchilla_lanigera
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSCSAG00000005807	ACO2	97	67.148	Chlorocebus_sabaeus
YLR304C	ACO1	68	65.684	ENSCHOG00000003549	ACO2	79	65.684	Choloepus_hoffmanni
YLR304C	ACO1	98	66.360	ENSCPBG00000020545	ACO2	97	66.360	Chrysemys_picta_bellii
YLR304C	ACO1	54	65.468	ENSCING00000008967	-	99	65.468	Ciona_intestinalis
YLR304C	ACO1	96	61.721	ENSCSAVG00000007584	-	99	67.894	Ciona_savignyi
YLR304C	ACO1	93	67.070	ENSCANG00000018904	ACO2	94	67.070	Colobus_angolensis_palliatus
YLR304C	ACO1	98	54.987	ENSCGRG00001009672	-	92	54.987	Cricetulus_griseus_chok1gshd
YLR304C	ACO1	98	67.543	ENSCGRG00001023335	Aco2	97	67.543	Cricetulus_griseus_chok1gshd
YLR304C	ACO1	98	54.987	ENSCGRG00000002318	-	92	54.987	Cricetulus_griseus_crigri
YLR304C	ACO1	98	67.543	ENSCGRG00000005122	Aco2	97	67.543	Cricetulus_griseus_crigri
YLR304C	ACO1	98	66.886	ENSCSEG00000006701	ACO2	97	66.886	Cynoglossus_semilaevis
YLR304C	ACO1	82	64.643	ENSCSEG00000020501	aco2	98	64.643	Cynoglossus_semilaevis
YLR304C	ACO1	96	63.235	ENSCVAG00000006081	aco2	97	63.235	Cyprinodon_variegatus
YLR304C	ACO1	96	67.380	ENSCVAG00000010923	ACO2	99	67.746	Cyprinodon_variegatus
YLR304C	ACO1	98	66.754	ENSDARG00000007294	aco2	97	66.754	Danio_rerio
YLR304C	ACO1	98	61.488	ENSDNOG00000018156	ACO2	97	61.488	Dasypus_novemcinctus
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSDORG00000002209	Aco2	98	67.148	Dipodomys_ordii
YLR304C	ACO1	98	64.698	FBgn0037862	CG4706	97	64.698	Drosophila_melanogaster
YLR304C	ACO1	96	68.491	FBgn0010100	Acon	95	68.491	Drosophila_melanogaster
YLR304C	ACO1	78	65.549	ENSETEG00000010742	ACO2	78	65.549	Echinops_telfairi
YLR304C	ACO1	80	77.215	ENSEBUG00000009201	aco2	96	77.215	Eptatretus_burgeri
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSEASG00005001546	ACO2	95	67.280	Equus_asinus_asinus
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSECAG00000023762	ACO2	95	67.148	Equus_caballus
YLR304C	ACO1	92	68.472	ENSEEUG00000010201	ACO2	92	68.472	Erinaceus_europaeus
YLR304C	ACO1	98	66.842	ENSELUG00000007787	ACO2	97	68.611	Esox_lucius
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSELUG00000019769	aco2	97	67.148	Esox_lucius
YLR304C	ACO1	98	65.685	ENSFCAG00000018526	ACO2	98	65.685	Felis_catus
YLR304C	ACO1	96	67.292	ENSFALG00000011957	ACO2	99	67.292	Ficedula_albicollis
YLR304C	ACO1	98	66.928	ENSFDAG00000010448	ACO2	98	66.928	Fukomys_damarensis
YLR304C	ACO1	97	67.287	ENSFHEG00000020556	ACO2	99	68.016	Fundulus_heteroclitus
YLR304C	ACO1	96	68.048	ENSFHEG00000012709	aco2	96	68.048	Fundulus_heteroclitus
YLR304C	ACO1	98	58.716	ENSGMOG00000001946	-	98	58.716	Gadus_morhua
YLR304C	ACO1	98	65.177	ENSGMOG00000013297	aco2	97	65.177	Gadus_morhua
YLR304C	ACO1	98	65.927	ENSGALG00000011950	ACO2	97	65.927	Gallus_gallus
YLR304C	ACO1	95	66.532	ENSGAFG00000010889	ACO2	95	66.532	Gambusia_affinis
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSGAFG00000008252	aco2	98	66.928	Gambusia_affinis
YLR304C	ACO1	97	65.912	ENSGACG00000004686	aco2	99	66.442	Gasterosteus_aculeatus
YLR304C	ACO1	98	66.229	ENSGAGG00000017500	ACO2	97	66.229	Gopherus_agassizii
YLR304C	ACO1	98	44.488	ENSGGOG00000037860	-	97	44.488	Gorilla_gorilla
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSGGOG00000001107	ACO2	97	67.280	Gorilla_gorilla
YLR304C	ACO1	96	67.246	ENSHBUG00000004106	aco2	96	67.246	Haplochromis_burtoni
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSHGLG00000015463	Aco2	97	67.280	Heterocephalus_glaber_female
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSHGLG00100010294	ACO2	97	67.148	Heterocephalus_glaber_male
YLR304C	ACO1	98	66.842	ENSHCOG00000006890	ACO2	98	67.937	Hippocampus_comes
YLR304C	ACO1	98	66.623	ENSHCOG00000010190	aco2	97	66.623	Hippocampus_comes
YLR304C	ACO1	98	66.097	ENSIPUG00000001101	aco2	98	67.085	Ictalurus_punctatus
YLR304C	ACO1	98	67.806	ENSSTOG00000016210	ACO2	97	67.806	Ictidomys_tridecemlineatus
YLR304C	ACO1	88	62.887	ENSJJAG00000014029	Aco2	98	62.887	Jaculus_jaculus
YLR304C	ACO1	96	67.470	ENSKMAG00000014823	ACO2	96	67.470	Kryptolebias_marmoratus
YLR304C	ACO1	53	68.434	ENSKMAG00000021995	aco2	86	68.434	Kryptolebias_marmoratus
YLR304C	ACO1	96	66.043	ENSLBEG00000002060	aco2	98	66.301	Labrus_bergylta
YLR304C	ACO1	81	63.994	ENSLACG00000011854	ACO2	100	63.994	Latimeria_chalumnae
YLR304C	ACO1	88	58.798	ENSLOCG00000011607	aco2	95	58.798	Lepisosteus_oculatus
YLR304C	ACO1	98	67.674	ENSLAFG00000006030	ACO2	98	67.674	Loxodonta_africana
YLR304C	ACO1	81	52.941	ENSMFAG00000041445	-	95	52.941	Macaca_fascicularis
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSMFAG00000043571	ACO2	98	68.182	Macaca_fascicularis
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSMMUG00000001454	ACO2	97	67.280	Macaca_mulatta
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSMNEG00000044522	ACO2	97	67.148	Macaca_nemestrina
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSMLEG00000031603	ACO2	98	68.182	Mandrillus_leucophaeus
YLR304C	ACO1	97	50.132	ENSMLEG00000042289	-	98	52.426	Mandrillus_leucophaeus
YLR304C	ACO1	98	67.105	ENSMAMG00000007378	ACO2	99	68.286	Mastacembelus_armatus
YLR304C	ACO1	96	66.845	ENSMAMG00000003762	aco2	98	67.085	Mastacembelus_armatus
YLR304C	ACO1	96	67.246	ENSMZEG00005019194	aco2	96	67.246	Maylandia_zebra
YLR304C	ACO1	98	65.927	ENSMGAG00000012110	ACO2	98	65.927	Meleagris_gallopavo
YLR304C	ACO1	98	67.543	ENSMAUG00000007598	Aco2	98	67.543	Mesocricetus_auratus
YLR304C	ACO1	98	60.897	ENSMICG00000013529	ACO2	97	60.897	Microcebus_murinus
YLR304C	ACO1	98	67.543	ENSMOCG00000008387	Aco2	97	67.543	Microtus_ochrogaster
YLR304C	ACO1	82	66.614	ENSMMOG00000003639	aco2	98	66.614	Mola_mola
YLR304C	ACO1	98	66.447	ENSMMOG00000002702	ACO2	97	66.447	Mola_mola
YLR304C	ACO1	98	66.928	ENSMODG00000016560	ACO2	98	66.928	Monodelphis_domestica
YLR304C	ACO1	98	65.789	ENSMALG00000013359	ACO2	96	66.711	Monopterus_albus
YLR304C	ACO1	96	66.979	ENSMALG00000008744	aco2	99	67.476	Monopterus_albus
YLR304C	ACO1	98	67.674	ENSMUSG00000022477	Aco2	96	71.123	Mus_musculus
YLR304C	ACO1	98	67.543	MGP_PahariEiJ_G0020064	Aco2	97	67.543	Mus_pahari
YLR304C	ACO1	99	67.012	MGP_SPRETEiJ_G0020963	Aco2	97	67.674	Mus_spretus
YLR304C	ACO1	98	67.806	ENSMPUG00000016396	ACO2	97	67.806	Mustela_putorius_furo
YLR304C	ACO1	98	67.411	ENSMLUG00000002472	ACO2	98	67.411	Myotis_lucifugus
YLR304C	ACO1	98	67.454	ENSNGAG00000015866	-	97	67.454	Nannospalax_galili
YLR304C	ACO1	98	50.847	ENSNGAG00000014065	-	98	50.847	Nannospalax_galili
YLR304C	ACO1	96	67.380	ENSNBRG00000004766	aco2	96	67.380	Neolamprologus_brichardi
YLR304C	ACO1	98	67.017	ENSNLEG00000015482	ACO2	97	67.017	Nomascus_leucogenys
YLR304C	ACO1	98	52.431	ENSNLEG00000036269	-	98	52.431	Nomascus_leucogenys
YLR304C	ACO1	89	69.128	ENSMEUG00000002023	ACO2	90	69.128	Notamacropus_eugenii
YLR304C	ACO1	98	66.146	ENSOPRG00000000365	ACO2	97	66.146	Ochotona_princeps
YLR304C	ACO1	98	67.674	ENSODEG00000012550	ACO2	97	67.674	Octodon_degus
YLR304C	ACO1	96	67.246	ENSONIG00000019690	aco2	90	67.246	Oreochromis_niloticus
YLR304C	ACO1	98	64.837	ENSOANG00000003550	ACO2	98	64.837	Ornithorhynchus_anatinus
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSOCUG00000021368	ACO2	95	67.148	Oryctolagus_cuniculus
YLR304C	ACO1	96	66.845	ENSORLG00000002618	aco2	96	66.845	Oryzias_latipes
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSORLG00020007394	aco2	96	67.112	Oryzias_latipes_hni
YLR304C	ACO1	96	66.979	ENSORLG00015006146	aco2	96	66.979	Oryzias_latipes_hsok
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSOMEG00000000704	aco2	96	67.513	Oryzias_melastigma
YLR304C	ACO1	93	64.477	ENSOGAG00000002845	ACO2	99	64.477	Otolemur_garnettii
YLR304C	ACO1	98	66.184	ENSOARG00000018307	ACO2	97	66.184	Ovis_aries
YLR304C	ACO1	80	45.208	ENSPPAG00000041996	-	95	45.208	Pan_paniscus
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSPPAG00000019653	ACO2	97	67.280	Pan_paniscus
YLR304C	ACO1	98	67.493	ENSPPRG00000005996	ACO2	98	67.493	Panthera_pardus
YLR304C	ACO1	98	67.363	ENSPTIG00000014744	ACO2	98	67.363	Panthera_tigris_altaica
YLR304C	ACO1	72	56.218	ENSPTRG00000048121	-	95	56.218	Pan_troglodytes
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSPTRG00000014428	ACO2	97	67.280	Pan_troglodytes
YLR304C	ACO1	88	54.070	ENSPANG00000032070	-	96	54.070	Papio_anubis
YLR304C	ACO1	99	64.899	ENSPANG00000024107	-	99	68.182	Papio_anubis
YLR304C	ACO1	98	65.440	ENSPKIG00000008567	aco2	98	66.771	Paramormyrops_kingsleyae
YLR304C	ACO1	98	56.899	ENSPKIG00000003055	ACO2	97	57.293	Paramormyrops_kingsleyae
YLR304C	ACO1	98	66.449	ENSPSIG00000007077	ACO2	98	66.449	Pelodiscus_sinensis
YLR304C	ACO1	97	63.081	ENSPMGG00000003518	aco2	98	63.009	Periophthalmus_magnuspinnatus
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSPEMG00000021158	Aco2	97	67.280	Peromyscus_maniculatus_bairdii
YLR304C	ACO1	98	67.237	ENSPCIG00000026414	ACO2	97	67.237	Phascolarctos_cinereus
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSPFOG00000016765	aco2	96	67.513	Poecilia_formosa
YLR304C	ACO1	95	67.341	ENSPLAG00000017481	ACO2	95	67.341	Poecilia_latipinna
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSPLAG00000001300	aco2	98	67.085	Poecilia_latipinna
YLR304C	ACO1	98	66.184	ENSPMEG00000018305	ACO2	97	66.184	Poecilia_mexicana
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSPMEG00000010286	aco2	98	67.398	Poecilia_mexicana
YLR304C	ACO1	98	63.947	ENSPREG00000017594	ACO2	97	64.474	Poecilia_reticulata
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSPREG00000020672	aco2	98	67.398	Poecilia_reticulata
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSPPYG00000011871	ACO2	97	67.280	Pongo_abelii
YLR304C	ACO1	98	66.281	ENSPCAG00000009742	ACO2	97	66.281	Procavia_capensis
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSPCOG00000017488	ACO2	97	67.148	Propithecus_coquereli
YLR304C	ACO1	98	64.758	ENSPVAG00000001163	ACO2	98	64.758	Pteropus_vampyrus
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSPNYG00000004399	aco2	96	67.112	Pundamilia_nyererei
YLR304C	ACO1	98	65.576	ENSPNAG00000013876	ACO2	98	65.576	Pygocentrus_nattereri
YLR304C	ACO1	98	67.543	ENSRNOG00000024128	Aco2	97	67.543	Rattus_norvegicus
YLR304C	ACO1	82	64.902	ENSRBIG00000035174	ACO2	92	64.902	Rhinopithecus_bieti
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSRROG00000005066	ACO2	98	67.280	Rhinopithecus_roxellana
YLR304C	ACO1	93	65.055	ENSSBOG00000029050	-	95	65.055	Saimiri_boliviensis_boliviensis
YLR304C	ACO1	81	66.876	ENSSBOG00000021699	-	98	66.876	Saimiri_boliviensis_boliviensis
YLR304C	ACO1	98	67.895	ENSSHAG00000010092	ACO2	97	67.895	Sarcophilus_harrisii
YLR304C	ACO1	98	66.491	ENSSFOG00015013704	aco2	98	67.453	Scleropages_formosus
YLR304C	ACO1	96	67.781	ENSSMAG00000007063	aco2	98	67.868	Scophthalmus_maximus
YLR304C	ACO1	96	67.380	ENSSMAG00000005805	ACO2	93	67.380	Scophthalmus_maximus
YLR304C	ACO1	96	67.246	ENSSDUG00000014898	ACO2	96	67.246	Seriola_dumerili
YLR304C	ACO1	98	67.280	ENSSDUG00000008036	aco2	98	68.025	Seriola_dumerili
YLR304C	ACO1	98	67.148	ENSSLDG00000009538	aco2	98	66.614	Seriola_lalandi_dorsalis
YLR304C	ACO1	96	67.112	ENSSLDG00000018236	ACO2	96	67.112	Seriola_lalandi_dorsalis
YLR304C	ACO1	54	77.419	ENSSARG00000004424	-	54	77.419	Sorex_araneus
YLR304C	ACO1	98	65.535	ENSSPUG00000011600	ACO2	98	65.535	Sphenodon_punctatus
YLR304C	ACO1	96	67.513	ENSSPAG00000022958	aco2	96	67.513	Stegastes_partitus
YLR304C	ACO1	98	66.053	ENSSPAG00000017882	ACO2	99	67.341	Stegastes_partitus
YLR304C	ACO1	98	67.493	ENSSSCG00000000064	ACO2	98	67.493	Sus_scrofa
YLR304C	ACO1	98	65.927	ENSTGUG00000009907	ACO2	99	65.927	Taeniopygia_guttata
YLR304C	ACO1	96	66.176	ENSTRUG00000017021	aco2	96	66.176	Takifugu_rubripes
YLR304C	ACO1	96	66.578	ENSTNIG00000012938	aco2	96	66.578	Tetraodon_nigroviridis
YLR304C	ACO1	98	67.017	ENSTBEG00000011060	ACO2	97	67.017	Tupaia_belangeri
YLR304C	ACO1	98	61.947	ENSTTRG00000003371	ACO2	98	61.947	Tursiops_truncatus
YLR304C	ACO1	98	67.937	ENSUAMG00000022582	ACO2	95	67.937	Ursus_americanus
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YLR304C	ACO1	55	68.528	ENSVPAG00000002616	-	59	68.528	Vicugna_pacos
YLR304C	ACO1	98	67.493	ENSVVUG00000003619	ACO2	98	67.493	Vulpes_vulpes
YLR304C	ACO1	97	56.069	ENSXETG00000006892	aco2	96	56.069	Xenopus_tropicalis
YLR304C	ACO1	82	67.555	ENSXCOG00000000374	aco2	98	67.555	Xiphophorus_couchianus
YLR304C	ACO1	95	64.555	ENSXCOG00000016019	ACO2	95	64.555	Xiphophorus_couchianus
YLR304C	ACO1	95	66.667	ENSXMAG00000006870	ACO2	95	66.667	Xiphophorus_maculatus
YLR304C	ACO1	96	67.647	ENSXMAG00000000683	aco2	96	67.647	Xiphophorus_maculatus